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Schistosoma mansoni
cluster # 3029 cluster # 3029       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3029#0 length = 974 sequences # 2  

consensusID : consensus_3029#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 974
fasta sequence
                              [CTGCCGCAAATAATAGTGTATGTGGATTAGGTATAGCTTATAGAGCTCGTATTGGTGGTGTACGTATGTTAGATGGTGATGTGACTGATGCAATGGAGTCGCGTTCGCTAAGTCATCAGCTACAACATATTGATGTATATTCTGCATCATGGGGTCCAGAAGATGACGGTAAAACAGTTGATGGTCCAGGTAAACTTGCTCAAATGGCATTTCGCAATGGAATACAAATGGGTCGGCGTGGTTTGGGATCAATTTTTGTATGGGCCAGTGGGAATGGTGGTACAAGTCACGATAACTGCAATTGTGATGGATACACAAATAGCATTTATACACTAGGTGTTGGATCAGTTTCAGAGCATGGATCTGTTCCGTGGTATGCAGAATTATGTTCTTCAACTTTAGCTGTTACCTATAGCAGTGGAGGACGTGGTGAACGTGGTGTCGTAAGTTTTCATAATCATAATTATTTTCATTTGAGAAAAATGCTTAGCTTCAATTTGATTTGTTTTTTACTTGTAACCTTTTAAATGACATAATCCACTAACATTTGATATAATCTGTTTTACTGAATCGTCTATTTATGTTGTCATTGATCACCACAATTATGATAACACAAAAACACATGGTAAAAGTTATGTTTTCAAGCAAACAAATAGTGCTTAGAACTTATATAGAATCAGAACAATCTTAATAATATAAGAGTTGGAGTAGACGTTTGACATAGTGAACAATCTATTTATTTATGCATTCGCGTTCTTGCACTGAAAGTAATATCCACTTATCATACAGTTTTAATGTGTTTTATGATGAGAAAGGTTTGCTACATCACTCATTTAGTTAGTCCTTTTTTTATCTATGTTGGGGAGTAGTATGAAAGTTCTGATTTCTATATCATTACCTTTAAGTCCATGGAAAATGTTTTGTAGCCTATAATTTGATATTTTAATTTGTTAACTTAAGCGTTAAATGCTCTT]

[+] EMBL CD112163             [CTGCCGCAAATAATAGTGTATGTGGATTAGGTATAGCTTATAGAGCTCGTATTGGTGGTGTACGTATGTTAGATGGTGATGTGACTGATGCAATGGAGTCGCGTTCGCTAAGTCATCAGCTACAACATATTGATGTATATTCTGCATCATGGGGTCCAGAAGATGACGGTAAAACAGTTGATGGTCCAGGTAAACTTGCTCAAATGGCATTTCGCAATGGAATACAAATGGGTCGGCGTGGTTTGGGATCAATTTTTGTATGGGCCAGTGGGAATGGTGGTACAAGTCACGATAACTGCAATTGTGATGGATACACAAATAGCATTTATACACTAGGTGTTGGATCAGTTTCAGAGCATGGATCTGTTCCGTGGTATGCAGAATTATGTTCTTCAACTTTAGCTGTTACCTATAGCAGTGGAGGACGTGGTGAACGTGGTGTCGTAAGTTTTCATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD129301             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATACACAAATAGCATTTATACACTAGGTGTTGGATCAGTTTCAGAGCATGGATCTGTTCCGTGGTATGCAGAATTATGTTCTTCAACTTTAGCTGTTACCTATAGCAGTGGAGGACGTGGTGAACGTGGTGTTGTAAGTTTTCATAATCATAATTATTTTCATTTGAGAAAAATGCTTAGCTTCAATTTGATTTGTTTTTTACTTGTAACCTTTTAAATGACATAATCCACTAACATTTGATATAATCTGTTTTACTGAATCGTCTATTTATGTTGTCATTGATCACCACAATTATGATAACACAAAAACACATGGTAAAAGTTATGTTTTCAAGCAAACAAATAGTGCTTAGAACTTATATAGAATCAGAACAATCTTAATAATATAAGAGTTGGAGTAGACGTTTGACATAGTGAACAATCTATTTATTTATGCATTCGCGTTCTTGCACTGAAAGTAATATCCACTTATCATACAGTTTTAATGTGTTTTATGATGAGAAAGGTTTGCTACATCACTCATTTAGTTAGTCCTTTTTTTATCTATGTTGGGGAGTAGTATGAAAGTTCTGATTTCTATATCATTACCTTTAAGTCCATGGAAAATGTTTTGTAGCCTATAATTTGATATTTTAATTTGTTAACTTAAGCGTTAAATGCTCTT]


>consensus_3029#0 CTGCCGCAAATAATAGTGTATGTGGATTAGGTATAGCTTATAGAGCTCGTATTGGTGGTG TACGTATGTTAGATGGTGATGTGACTGATGCAATGGAGTCGCGTTCGCTAAGTCATCAGC TACAACATATTGATGTATATTCTGCATCATGGGGTCCAGAAGATGACGGTAAAACAGTTG ATGGTCCAGGTAAACTTGCTCAAATGGCATTTCGCAATGGAATACAAATGGGTCGGCGTG GTTTGGGATCAATTTTTGTATGGGCCAGTGGGAATGGTGGTACAAGTCACGATAACTGCA ATTGTGATGGATACACAAATAGCATTTATACACTAGGTGTTGGATCAGTTTCAGAGCATG GATCTGTTCCGTGGTATGCAGAATTATGTTCTTCAACTTTAGCTGTTACCTATAGCAGTG GAGGACGTGGTGAACGTGGTGTCGTAAGTTTTCATAATCATAATTATTTTCATTTGAGAA AAATGCTTAGCTTCAATTTGATTTGTTTTTTACTTGTAACCTTTTAAATGACATAATCCA CTAACATTTGATATAATCTGTTTTACTGAATCGTCTATTTATGTTGTCATTGATCACCAC AATTATGATAACACAAAAACACATGGTAAAAGTTATGTTTTCAAGCAAACAAATAGTGCT TAGAACTTATATAGAATCAGAACAATCTTAATAATATAAGAGTTGGAGTAGACGTTTGAC ATAGTGAACAATCTATTTATTTATGCATTCGCGTTCTTGCACTGAAAGTAATATCCACTT ATCATACAGTTTTAATGTGTTTTATGATGAGAAAGGTTTGCTACATCACTCATTTAGTTA GTCCTTTTTTTATCTATGTTGGGGAGTAGTATGAAAGTTCTGATTTCTATATCATTACCT TTAAGTCCATGGAAAATGTTTTGTAGCCTATAATTTGATATTTTAATTTGTTAACTTAAG CGTTAAATGCTCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)