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Schistosoma mansoni
cluster # 3086 cluster # 3086       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3086#0 length = 721 sequences # 2  

consensusID : consensus_3086#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 721
fasta sequence
                              [ACTAACTGCAGCATTATTTTTAGCCAATCATGTGGAACAAATGAGTTAGTTTTTTTATCTTGAATAATTTCTAATTGAGGTGATANTGACAATCGATTGAATTGTTTCTTTCTGTACAACATTTCGTTAGTGGATGTAATTGATGATTTCGAACGAATAGGTGTGATTGTTGATGACGCTGATAATGACGATGTTAAACAGGTTACTGATTCTGCGGCAGTATTGGTGCTGGTGTTAGTTAATAATACTGTTGTGGCATGTTTTGGTACTTCATACGGATCGTCTAATTTACAAAATAACTTATGTAGTTGAGATTTTTTTGGTGGTAAAGGAGGCGGGAGAG-TATATGAAACTGAAGATGATATAAGTGAATTTCGTGTTCTATGCAAACTATACACAGATTTATTGTCTGATGGTGATTCGTATGAAATTCCATGGATTGAATGACCAGATGATGATTTTGTTGATTGAAATACATCGGAAACTTGTGAATTTCTCTTATCAACTGATGTACCAGAAGTTGTTGTAACAGGTATTTTGAACGAATCTATGCGAACAGATGGTGGTGATGGACAACTTATCGTAGGACGAAGAGAATGACGCTTATTTGAAAAGAAACGTGCAATGCTGCTACTTAATGGTCTCCTTTGTTACACTGACACATTACAATTATTATTAGTAGTGGCTACGGTATTAGTAGTATTAATATCACCACCACCAT]

[+] EMBL CD149087             [ACTAACTGCAGCATTATTTTTAGCCAATCATGTGGAACAAATGAGTTAGTTTTTTTATCTTGAATAATTTCTAATTGAGGTGATANTGACAATCGATTGAATTGTTTCTTTCTGTACAACATTTCGTTAGTGGATGTAATTGATGATTTCGAACGAATAGGTGTGATTGTTGATGACGCTGATAATGACGATGTTAAACAGGTTACTGATTCTGCGGCAGTATTGGTGCTGGTGTTAGTTAATAATACTGTTGTGGCATGTTTTGGTACTTCATACGGATCGTCTAATTTACAAAATAACTTATGTAGTTGAGATTTTTTTGGTGGTAAAGGAGGCGGGAGAG TATATGAAACTGAAGATGATATAAGTGAATTTCGTGTTCTATGCAAACTATACACAGATTTATTGTCTGATGGTGATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD114094             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ancGAGTGTTAAATGAAACTGAAGATGATATAAGTGAATTTCGTGTTCTATCAAAACTATACACAGATTTATTGTCTGATGGTGATTCGTATGAAATTCCATGGATTGAATGACCAGATGATGATTTTGTTGATTGAAATACATCGGAAACTTGTGAATTTCTCTTATCAACTGATGTACCAGAAGTTGTTGTAACAGGTATTTTGAACGAATCTATGCGAACAGATGGTGGTGATGGACAACTTATCGTAGGACGAAGAGAATGACGCTTATTTGAAAAGAAACGTGCAATGCTGCTACTTAATGGTCTCCTTTGTTACACTGACACATTACAATTATTATTAGTAGTGGCTACGGTATTAGTAGTATTAATATCACCACCACCAT]


>consensus_3086#0 ACTAACTGCAGCATTATTTTTAGCCAATCATGTGGAACAAATGAGTTAGTTTTTTTATCT TGAATAATTTCTAATTGAGGTGATANTGACAATCGATTGAATTGTTTCTTTCTGTACAAC ATTTCGTTAGTGGATGTAATTGATGATTTCGAACGAATAGGTGTGATTGTTGATGACGCT GATAATGACGATGTTAAACAGGTTACTGATTCTGCGGCAGTATTGGTGCTGGTGTTAGTT AATAATACTGTTGTGGCATGTTTTGGTACTTCATACGGATCGTCTAATTTACAAAATAAC TTATGTAGTTGAGATTTTTTTGGTGGTAAAGGAGGCGGGAGAGTATATGAAACTGAAGAT GATATAAGTGAATTTCGTGTTCTATGCAAACTATACACAGATTTATTGTCTGATGGTGAT TCGTATGAAATTCCATGGATTGAATGACCAGATGATGATTTTGTTGATTGAAATACATCG GAAACTTGTGAATTTCTCTTATCAACTGATGTACCAGAAGTTGTTGTAACAGGTATTTTG AACGAATCTATGCGAACAGATGGTGGTGATGGACAACTTATCGTAGGACGAAGAGAATGA CGCTTATTTGAAAAGAAACGTGCAATGCTGCTACTTAATGGTCTCCTTTGTTACACTGAC ACATTACAATTATTATTAGTAGTGGCTACGGTATTAGTAGTATTAATATCACCACCACCA T



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)