cluster # 31

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Schistosoma mansoni
cluster # 31 cluster # 31 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_31#0 length = 516 sequences # 2

consensusID : consensus_31#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 516
fasta sequence

                              [AGCTAGGATTTAGATTTCGATACACTTCGAGATGACTAAGATGTATCTTGTGCAAATTATACTGGTGACAATGTTGCTTTTGTTGAACACAGAATACAGTCTATCACTAAAGTGTTACACATGCGCTTTCTGTTCAGTACCATTTAATCCACACTCACTACTAGTTAATGAACAAGATGATTGTAGATGGTGTGCAAAAATTAATATAAAAGGTGTACCCTACCCATTTAGACTCTGTGCAGCTGATTGTGGATATGATTACTGGAAAAAAAATTTTAGTTCCTTTAGTTATGAATGTTGCCAAAAAGACTTATGTAATAAAAGCATACAAAGTCGGGTAACGCATCAATTTCTATTTATTATTGTCTTAATGTTTGTTTGCTTTATTATTCATAAGAAAAACTGAACAAAATATCCCAATTCACTTGTTACTAAGTATACATTTTGCTGTTTATTTGCACTTTAACATACTACTTATTATTCAAATGTATTTCATTTAACTTCATGTTATACTAT]

[+] EMBL CD079892             [AGCTAGGATTTAGATTTCGATACACTTCGAGATGACTAAGATGTATCTTGTGCAAATTATACTGGTGACAATGTTGCTTTTGTTGAACACAGAATACAGTCTATCACTAAAGTGTTACACATGCGCTTTCTGTTCAGTACCATTTAATCCACACTCACTACTAGTTAATGAACAAGATGATTGTAGATGGTGTGCAAAAATTAATATAAAAGGTGTACCCTACCCATTTAGACTCTGTGCAGCTGATTGTGGATATGATTACTGGAAAAAAAATTTTAGTTCCTTTAGTTATGAATGTTGCCAAAAAGACTTATGTAATAAAAGCATACAAAGTCGGGTAACGCATCAATTTCTATTTATTATTGTCTTAATGTTTGTTTGCTTTATTATTCATAAGAAAAACTGAACAAAATATCCCAATTCACTTGTTACTAAGTATACATTTTGCTGTTTATTTGCACTTTAACATACTACTTATTATTCAAATGTATTTCATTTAACTTCATGTTATACTA ]
[-] EMBL CD074091             [                                                                                                                                                                                   ATTGTAAATGGTGTGCAAAAATTAAAATAAAAGGGGTGCCCTACCCCTTTAGACTTTGTGCAGCTGATTGTGGATATGATTACTGGAAAAAAAATTTTAGTTCCTTTAGTTATGAATGTTGCCCAAAAAACTTATGTAATAAAAGCATACAAAGTCGGGGAACGCACCAATTTTTATTTATTATTGTTTTAAAGTTTGTTTGCTTTATTATTCATAAAAAAAAATGAACAAAAAATCCCCATTCCCTTGTTATTAAGTAAACATTTTGCTGTTTATTTGCCCTTTAACATACTACTTATTATTCAAATGTATTTCATTTAACTTCATGTTATACTAT]




>consensus_31#0
AGCTAGGATTTAGATTTCGATACACTTCGAGATGACTAAGATGTATCTTGTGCAAATTAT
ACTGGTGACAATGTTGCTTTTGTTGAACACAGAATACAGTCTATCACTAAAGTGTTACAC
ATGCGCTTTCTGTTCAGTACCATTTAATCCACACTCACTACTAGTTAATGAACAAGATGA
TTGTAGATGGTGTGCAAAAATTAATATAAAAGGTGTACCCTACCCATTTAGACTCTGTGC
AGCTGATTGTGGATATGATTACTGGAAAAAAAATTTTAGTTCCTTTAGTTATGAATGTTG
CCAAAAAGACTTATGTAATAAAAGCATACAAAGTCGGGTAACGCATCAATTTCTATTTAT
TATTGTCTTAATGTTTGTTTGCTTTATTATTCATAAGAAAAACTGAACAAAATATCCCAA
TTCACTTGTTACTAAGTATACATTTTGCTGTTTATTTGCACTTTAACATACTACTTATTA
TTCAAATGTATTTCATTTAACTTCATGTTATACTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case