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Schistosoma mansoni
cluster # 3107 cluster # 3107       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3107#0 length = 515 sequences # 2  

consensusID : consensus_3107#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 515
fasta sequence
                              [GAATGAATTTAGCGGCGCGATTCGCCCTTCATTAGTAAGATGCCCGAATTCAGAAATAAAAATAATTTAGATACAGTCTGATAATAGGAATAGTAATTCATTAGGATTTAGCCTAACACGTGGTTTGACGGGATCAAACAGAGATCTATTTATTATTGGACTAGTTGCTGTTATCATTAGTTTGGCATTAATTGCCGTGATATGCATTGCATTTGGATGTTTTATACGTCGTAAACGTCGCCCGAAACTAATTAACCATTTAACTCCAAATGATTCGACAATGAAACAACCACTGATGCGAATGAATGACTGTGGTCCAGCTAATGGCAACAGTTTTCCTTTAATGACAAGTGGAATAGAAGTAATAAATACTAATTTTACATCCTCTGTCGACAAACGTGGTAGTTCGGTTGTTGGTAATGATAGTTTAAAAAGTGGAACTTTAATCGCTGCCTCTTCACCAGGACCACCACAATCCTCATTAATCTCCTCAATATCAGCCACAGGTAGACCAA]

[+] EMBL CD069126             [GAATGAATTTAGCGGCGCGATTCGCCCTTCATTAGTAAGATGCCCGAATTCAGAAATAAAAATAATTTAGATACAGTCTGATAATAGGAATAGTAATTCATTAGGATTTAGCCTAACACGTGGTTTGACGGGATCAAACAGAGATCTATTTATTATTGGACTAGTTGCTGTTATCATTAGTTTGGCATTAATTGCCGTGATATGCATTGCATTTGGATGTTTTATACGTCGTAAACGTCGCCCGAAACTAATTAACCATTTAACTCCAAATGATTCGACAATGAAACAACCACTGATGCGAATGAATGACTGTGGTCCAGCTAATGGCAACAGTTTTCCTTTAATGACAAGTGGAATAGAAGTAATAAATACTAATTTTACATCCTCTGTCGACAAACGTGGTAGTTCGGTTGTTGGTAATGATAGTTTAAAAAGTGGAACTTTAATCGCTGCCTCTTCACCAGGACCACCACAATCCTCATTAATCTCCTCAATATCAGCC             ]
[+] EMBL CD069174             [                                                    GAAATAAAAATAATTTAGATACA TCTGATAATAGGAATAGTAATTCATTAGGATTTAGCCTAACACGTGGTTTGACGGGATCAAACAGAGATCTATTTATTATTGGACTAGTTGCTGTTATCATTAGTTTGGCATTAATTGCCGTGATATGCATTGCATTTGGATGTTTTATACGTCGTAAACGTCGCCCGAAACTAATTAACCATTTAACTCCAAATGATTCGACAATGAAACAACCACTGATGCGAATGAATGACTGTGGTCCAGCTAATGGCTACAGTTTTCCTTTAATGACAAGTGGAATAGAAGTAATAAATACTAATTTTACATCCTCTGTCGACAAACGTGGTAGTTCGGTTGTTGGTAATGATAGTTTAAAAAGTGGAACTTTAATCGCTGCCTCTTCACCAGGACCAGCAGAATCCTCATTAATCTCCTCAATATCAGCCACAGGTAGACCAA]


>consensus_3107#0 GAATGAATTTAGCGGCGCGATTCGCCCTTCATTAGTAAGATGCCCGAATTCAGAAATAAA AATAATTTAGATACAGTCTGATAATAGGAATAGTAATTCATTAGGATTTAGCCTAACACG TGGTTTGACGGGATCAAACAGAGATCTATTTATTATTGGACTAGTTGCTGTTATCATTAG TTTGGCATTAATTGCCGTGATATGCATTGCATTTGGATGTTTTATACGTCGTAAACGTCG CCCGAAACTAATTAACCATTTAACTCCAAATGATTCGACAATGAAACAACCACTGATGCG AATGAATGACTGTGGTCCAGCTAATGGCAACAGTTTTCCTTTAATGACAAGTGGAATAGA AGTAATAAATACTAATTTTACATCCTCTGTCGACAAACGTGGTAGTTCGGTTGTTGGTAA TGATAGTTTAAAAAGTGGAACTTTAATCGCTGCCTCTTCACCAGGACCACCACAATCCTC ATTAATCTCCTCAATATCAGCCACAGGTAGACCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)