cluster # 3110

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Schistosoma mansoni
cluster # 3110 cluster # 3110 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3110#0 length = 633 sequences # 2

consensusID : consensus_3110#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 633
fasta sequence

                              [ATTGTTTGGAAGGCTCAATTAACATGAACAGAACTCTATCACAGTGACAGATGGATTAGTGTTTGTTCGTACTCAGATCTTTGTTTTCACCATCAGTTCTGGATTTATCTCCATGTTTCACCCAATCCTTTGAAATTATATCCCTCATTTATTGTGGATGAGGATTTGTACTATCCAACTGTTCAAAATGTAAGCTGTAATATTGAACAGACATTGGATAACGATTAAATGGCTATGTGAAGCTAGTAACTTGGTAGATAATACCCACATGCTTAAAGGAAAGTTTGTAAGTCCACGTCTCATCGTATACATTAAATGTGGGATGCAAACGAATCTATCTGACCGGTCGCAGATGTGGCGAAACAGATGTCCAGGATTTCACTGCTAGCGGTGCTCCATATCCTCTTAAAAGTATTCCCCACGTTTATTTTTTTTACCCATCATAAATACCGCTCTTGTTATTCTTTTTGCACTCTTACTTTGTTGTGCTGAGTTGATGTGATGTCCTTGGCTGGTATACAGTTATTCCAGGTTGTACTACGATTACGACTGACTTTTTACACAAAAAATTGGAAGAATACTCTAAATTTTACCTTAATAACAACTTCTGGATAAACAATTCATTCTTAAATT]

[+] EMBL CD114299             [ATTGTTTGGAAGGCTCAATTAACATGAACAGAACTCTATCACAGTGACAGATGGATTAGTGTTTGTTCGTACTCAGATCTTTGTTTTCACCATCAGTTCTGGATTTATCTCCATGTTTCACCCAATCCTTTGAAATTATATCCCTCATTTATTGTGGATGAGGATTTGTACTATCCAACTGTTCAAAATGTAAGCTGTAATATTGAACAGACATTGGATAACGATTAAATGGCTATGTGAAGCTAGTAACTTGGTAGATAATACCCACATGCTTAAAGGAAAGTTTGTAAGTCCACGTCTCATCGTATACATTAAATGTGGGATGCAAACGAATCTATCTGACCGGTCGCAGATGTGGCGAAACAGATGTCCAGGATTTCACTGCTAGCGGTGCTCCATATCCTCTTAAAAGTAT                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD114237             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGTTAGTAAGTCCACGTCTCAGCACATACATTAAATGTGGGATGCAAACGAATCTATCTGACCGGTCGCAGATGTGGCGAAACAGATATCCAGGATTTCACTGCTAGCGGTGCTCCATATCCTCATAAAAGTTATCCCCACGTTTATTTTTTTTACCCATCATAAATACCGCTCTTGTTATTCTTTTTGCACTCTTACTTTGTTGTGCTGAGTTGATGTGATGTCCTTGGCTGGTATACAGTTATTCCAGGTTGTACTACGATTACGACTGACTTTTTACACAAAAAATTGGAAGAATACTCTAAATTTTACCTTAATAACAACTTCTGGATAAACAATTCATTCTTAAATT]




>consensus_3110#0
ATTGTTTGGAAGGCTCAATTAACATGAACAGAACTCTATCACAGTGACAGATGGATTAGT
GTTTGTTCGTACTCAGATCTTTGTTTTCACCATCAGTTCTGGATTTATCTCCATGTTTCA
CCCAATCCTTTGAAATTATATCCCTCATTTATTGTGGATGAGGATTTGTACTATCCAACT
GTTCAAAATGTAAGCTGTAATATTGAACAGACATTGGATAACGATTAAATGGCTATGTGA
AGCTAGTAACTTGGTAGATAATACCCACATGCTTAAAGGAAAGTTTGTAAGTCCACGTCT
CATCGTATACATTAAATGTGGGATGCAAACGAATCTATCTGACCGGTCGCAGATGTGGCG
AAACAGATGTCCAGGATTTCACTGCTAGCGGTGCTCCATATCCTCTTAAAAGTATTCCCC
ACGTTTATTTTTTTTACCCATCATAAATACCGCTCTTGTTATTCTTTTTGCACTCTTACT
TTGTTGTGCTGAGTTGATGTGATGTCCTTGGCTGGTATACAGTTATTCCAGGTTGTACTA
CGATTACGACTGACTTTTTACACAAAAAATTGGAAGAATACTCTAAATTTTACCTTAATA
ACAACTTCTGGATAAACAATTCATTCTTAAATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case