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Schistosoma mansoni
cluster # 3145 cluster # 3145       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3145#0 length = 880 sequences # 2  

consensusID : consensus_3145#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 880
fasta sequence
                              [TTAACCACTTGCCTTTATTCAGAATCTTTACCAGTTAGGCTTACGGTTAATAATTACTGAGTAATCCACTTTCTGGACATATAATCCATTAGATTCCTGATTGACAATAAACATTAATATGAATCTCGAGTAAAAACTAAAACCATTTGCAGAAAAAGTCAGTTTTACAGACTACGAAGATTTGAGATGAGAGTATTAACACGTACCAAGTAATCACTTCTGAAAACAAATGACAGTAAACAACTTAAGCCGTTAAAATTAGAATACGGAACACTAACCAAATATGCCCACAGATAACACAAAAATGAATACCGAGTGACGGTTAAGAATGAATACTAATACTGTTATCCATTTACCAACTACGGTTTCGTGTGCTCGCCTTTGAGCCACATTGTTAAGTAAGTTAGTGAGACTACCTGGATGTTAAAACTATAGTTCGAACCCGTGAACTGGCCACTGAAAGTCAATCGTTTTAACGACTGAGTAAAATTCAGTCAGTTATAAGCAATGACGAACCAGACATATGGAACGGTTTGAAATGCCACAATTTAGCACACCAAGATGATATCATTAGGGCAAATCCCAGAGTAGCAAGGCAGTAACAGTTTATGGTAACAGAAAAGACTANGCATAGATGATTCAAGGGGAAAATACTGGTAAGTAAAGTTTTTAAGAAGTTTTGAAGTAATTCAACAATAATATTTGCTTTTCTTAACAAAATCACGTAGAACGAGCTTTAAATGAAGAGCCAACGCTCATGCACTTGGATACCTAACTTTAGACATATGATTCACGTTTCGGTAGTGCTTTTCTAACCCTCTCGCAGTACACGGTTCAAGACATAATACACGAGATCAAACTTAGTCGTTGAGTTACGTTC]

[+] EMBL CD115022             [TTAACCACTTGCCTTTATTCAGAATCTTTACCAGTTAGGCTTACGGTTAATAATTACTGAGTAATCCACTTTCTGGACATATAATCCATTAGATTCCTGATTGACAATAAACATTAATATGAATCTCGAGTAAAAACTAAAACCATTTGCAGAAAAAGTCAGTTTTACAGACTACGAAGATTTGAGATGAGAGTATTAACACGTACCAAGTAATCACTTCTGAAAACAAATGACAGTAAACAACTTAAGCCGTTAAAATTAGAATACGGAACACTAACCAAATATGCCCACAGATAACACAAAAATGAATACCGAGTGACGGTTAAGAATGAATACTAATACTGTTATCCATTTACCAACTACGGTTTCGTGTGCTCGCCTTTGAGCCACATTGTTAAGTAAGTTAGTGAGACTACCTGGATGTTAAAACTATAGTTCGAACCCGTGAACTGGCCACTGAAAGTCAATCGTTTTAACGACTGAGTAAAATTCAGTCAGTTATAAGCAATGACGAACCAGACATATGGAACGGTTTGAAATGCCACAATTTAGCACACCAAGATGATATCATTAGGGCAAATCCCAGAGTAGCAAGGCAGTAACAGTTTATGGTAACAGAAAAGACTANGCATAGATGATTCAAGG                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD114995             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTTATCCATTTACCAACTACGGTTTCGTGTGCTCGCCTTTGGGCCACATTGTTAAGTAAGTTAGTGAGACTACCTGGATGTTAAAACTATAGTTCGAACCCGTGAACTGGCCACTGAAAGTCAATCGTTTTAACGACTGAGTAAAATTCAGTCAGTTATAAGCAATGACGAACCAGACATATGGAACGGTTTGAAATGCCACAATTTAGCACACCAAGATGATATCATTAGGGCAAATCCCAGAGTAGCAAGGCAGTAACAGTATATGGTAACAGAAAAGACTAGGCATAGATGATTCAAGGGGAAAATACTGGTAAGTAAAGTTTTTAAGAAGTTTTGAAGTAATTCAACAATAATATTTGCTTTTCTTAACAAAATCACGTAGAACGAGCTTTAAATGAAGAGCCAACGCTCATGCACTTGGATACCTAACTTTAGACATATGATTCACGTTTCGGTAGTGCTTTTCTAACCCTCTCGCAGTACACGGTTCAAGACATAATACACGAGATCAAACTTAGTCGTTGAGTTACGTTC]


>consensus_3145#0 TTAACCACTTGCCTTTATTCAGAATCTTTACCAGTTAGGCTTACGGTTAATAATTACTGA GTAATCCACTTTCTGGACATATAATCCATTAGATTCCTGATTGACAATAAACATTAATAT GAATCTCGAGTAAAAACTAAAACCATTTGCAGAAAAAGTCAGTTTTACAGACTACGAAGA TTTGAGATGAGAGTATTAACACGTACCAAGTAATCACTTCTGAAAACAAATGACAGTAAA CAACTTAAGCCGTTAAAATTAGAATACGGAACACTAACCAAATATGCCCACAGATAACAC AAAAATGAATACCGAGTGACGGTTAAGAATGAATACTAATACTGTTATCCATTTACCAAC TACGGTTTCGTGTGCTCGCCTTTGAGCCACATTGTTAAGTAAGTTAGTGAGACTACCTGG ATGTTAAAACTATAGTTCGAACCCGTGAACTGGCCACTGAAAGTCAATCGTTTTAACGAC TGAGTAAAATTCAGTCAGTTATAAGCAATGACGAACCAGACATATGGAACGGTTTGAAAT GCCACAATTTAGCACACCAAGATGATATCATTAGGGCAAATCCCAGAGTAGCAAGGCAGT AACAGTTTATGGTAACAGAAAAGACTANGCATAGATGATTCAAGGGGAAAATACTGGTAA GTAAAGTTTTTAAGAAGTTTTGAAGTAATTCAACAATAATATTTGCTTTTCTTAACAAAA TCACGTAGAACGAGCTTTAAATGAAGAGCCAACGCTCATGCACTTGGATACCTAACTTTA GACATATGATTCACGTTTCGGTAGTGCTTTTCTAACCCTCTCGCAGTACACGGTTCAAGA CATAATACACGAGATCAAACTTAGTCGTTGAGTTACGTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)