Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3156 cluster # 3156       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3156#0 length = 512 sequences # 2  

consensusID : consensus_3156#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 512
fasta sequence
                              [AAATGTGACATCTGTGCACCGGGATTTTATGGGGATCCACGTACCGGTGATCCAAAAGCATGTAAATCATGTGAATGTCCACATTTAGATTATCAAATGACTACAGTTTGTTTAGCACATGAAGAAGAATTATTTAAAGAGGAGAAACCATATGTTTGTTTAGATTGTACAGAAAATACTCGAGGTCGATATTGTGAAGTATGTGCAGAAATGTATTATGGTGATCCACTGAATGGGGTACCATGTCGTCCATGTAATTGTGGACCCGCTGCTATAGGATGCAATGCAACAAATGGAGCTTGCATCTGTGGATTTAATACAGCTGGACCGCAATGCGATGCATGCGCTGAAGGAACACATGGAGATCCAACTAGAGGACAACCATGTAGACCTTGTAATTGTCATCCAAAAGGTAGTATCTCTCCATCATGTAGACTTGAAGATGGTCAATGTAATTGTTTATCAACATATGAAGGTGTTAGATGTGATCGTTGTATACCTGGTCGTGGTAT]

[+] EMBL CD115252             [AAATGTGACATCTGTGCACCGGGATTTTATGGGGATCCACGTACCGGTGATCCAAAAGCATGTAAATCATGTGAATGTCCACATTTAGATTATCAAATGACTACAGTTTGTTTAGCACATGAAGAAGAATTATTTAAAGAGGAGAAACCATATGTTTGTTTAGATTGTACAGAAAATACTCGAGGTCGATATTGTGAAGTATGTGCAGAAATGTATTATGGTGATCCACTGAATGGGGTACCATGTCGTCCATGTAATTGTGGACCCGCTGCTATAGGATGCAATGCAACAAATGGAGCTTGCATCTGTGGATTTAATACAGCTGGACCGCAATGCGATGCATGCGCTGAAGGAACACATGGAGATCCAACTAGAGGACAACCATGTAGACCTTGTAATTGTCATCCAAAAGGTAGTATCTCTCCATCATGTAGACTTGAAGATGGTCAATGTAATTGTTTATCAACATATGAAGGTGTTAGATGTGATCGTTGTATACCTGGTCGTGGTAT]
[-] EMBL CD202960             [                                           cgGGTGATCCAAAAGCATGTAAATCATGTGAATGTCCACATTTAGGTTATCAAATGACTACAGTTTGTTTAGCACATGAAGAAGAATTATTTAAAGAGGAGAAACCATATGTTTGTTTAGATTGTACAGAAAATACTCGAGGTCGATATTGTGAAGTATGTGCAGAAATGTATTATGGTGATCCACTGAATGGGGTACCATGTCGTCCATGTAATTGTGGACCCGCTGCTATAGGATGCAATGCAACAAATGGAGCTTGCATCTGTGGATTTAATACAGCTGGACCGCAATGCGATGCATGCGCTGAAGGAACACATGTAGATCCAACTAGAGGACAACCATGTAGACCTTGTAATTGTCATCCAAAAGGTAGTATCTCTCCATCATGTAGACTTGAAGATGGTCAATGTAATTGTTT                                                   ]


>consensus_3156#0 AAATGTGACATCTGTGCACCGGGATTTTATGGGGATCCACGTACCGGTGATCCAAAAGCA TGTAAATCATGTGAATGTCCACATTTAGATTATCAAATGACTACAGTTTGTTTAGCACAT GAAGAAGAATTATTTAAAGAGGAGAAACCATATGTTTGTTTAGATTGTACAGAAAATACT CGAGGTCGATATTGTGAAGTATGTGCAGAAATGTATTATGGTGATCCACTGAATGGGGTA CCATGTCGTCCATGTAATTGTGGACCCGCTGCTATAGGATGCAATGCAACAAATGGAGCT TGCATCTGTGGATTTAATACAGCTGGACCGCAATGCGATGCATGCGCTGAAGGAACACAT GGAGATCCAACTAGAGGACAACCATGTAGACCTTGTAATTGTCATCCAAAAGGTAGTATC TCTCCATCATGTAGACTTGAAGATGGTCAATGTAATTGTTTATCAACATATGAAGGTGTT AGATGTGATCGTTGTATACCTGGTCGTGGTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)