cluster # 3174

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Schistosoma mansoni
cluster # 3174 cluster # 3174 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3174#0 length = 673 sequences # 2

consensusID : consensus_3174#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 673
fasta sequence

                              [AAGATTCCATAGAAACTCTCATTACGGGTATAAAAAGTATTCCGCTTTCGAATATCACATCCAAAGAGATCGATCACCTTACTGATTTTCTATCGGATCGTTTAGCACTTGCTGATCCAAATATTACAAATTTAATTCTTGATGGATTTATATGGTTGACAAAATGTACATGGTCTAATGGTTGTAGCTTGATCAATCCAGAACAAGCTAAACAGATTGTTCAGGATGGAATATGTGGTCATTTAACAATACAGAATTTAATGAAATCTGGAAGGCTAAAAGTTTTTCAGCTACTACATTACTTTTTAACTGGATCTCAGCTAAGTGGTATTCAGTCAATGGAATCTAATTTTATCCAGAATTATTTAGTAGCTATTGATGAAGAGAAAGATCCAC-AAATTTTACATCTGATTTTTCGTATGAATGTAATCGTTCTTAAAGAGTTTCCTTCAGTAGTCGAGTTTAAGGATGAACTATTTGAAACAATATCAGTTTATTTTCCTATCGACTTTTCACCGCCTCCAGGTGGTGGTATCTCTGGAGTTACGCGTGATTTACTAGCGTCTAGCTTGCACCAATGTTTATTTGCTATGCGAAATATAACTGGTCATAATCTATGCCACTTATTTGCGAGAAAATTGAATCACAATGGCCTAATGGTCAGTTGGATGCT]

[+] EMBL CD153877             [AAGATTCCATAGAAACTCTCATTACGGGTATAAAAAGTATTCCGCTTTCGAATATCACATCCAAAGAGATCGATCACCTTACTGATTTTCTATCGGATCGTTTAGCACTTGCTGATCCAAATATTACAAATTTAATTCTTGATGGATTTATATGGTTGACAAAATGTACATGGTCTAATGGTTGTAGCTTGATCAATCCAGAACAAGCTAAACAGATTGTTCAGGATGGAATATGTGGTCATTTAACAATACAGAATTTAATGAAATCTGGAAGGCTAAAAGTTTTTCAGCTACTACATTACTTTTTAACTGGATCTCAGCTAAGTGGTATTCAGTCAATGGAATCTAATTTTATCCAGAATTATTTAGTAGCTATTGATGAAGAGAAAGATCCAC AAATTTTACATCTGATTTTTCGTATGAATGTAATCGTTCTTAAAGAGTTTCCTTCAGTAGTCGAGTTTAAGGATGAACTATTTGAAACAATATCAGTTTATTTTCCTATCGACTTTTCACCGCCTCCAGGTGGTGGTATCTCTGGAGTTACGCGTGATTTACTAGCGTCTAGCTTGCACCAATGTTTATTTGCTATGCG                                                                              ]
[+] EMBL CD115638             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TACATTACTTTTTAACTGGATCTCAGCTAAGTGGTATTCAGTCAATGGAATCTAATTTTATCCAGAATTATTTATTATCTATTGATGAAGAGAAAGATCCACGGGGGGGGACATCTGATTTTTCGTATGAATGTAATCGTTCTTAAAGAGTTTCCTTCAGTAGTCGACTCTAAGGATGAACTATTTGAAACAATATCAGTTTATTTTCCTATCGACTTTTCACCGCCTCCAGGTGGTGGTATCTCTGGAGTTACGCGTGATTTACTAGCGTCTAGCTTGCACCAATGTTTATTTGCTATGCGAAATATAACTGGTCATAATCTATGCCACTTATTTGCGAGAAAATTGAATCACAATGGCCTAATGGTCAGTTGGATGCT]




>consensus_3174#0
AAGATTCCATAGAAACTCTCATTACGGGTATAAAAAGTATTCCGCTTTCGAATATCACAT
CCAAAGAGATCGATCACCTTACTGATTTTCTATCGGATCGTTTAGCACTTGCTGATCCAA
ATATTACAAATTTAATTCTTGATGGATTTATATGGTTGACAAAATGTACATGGTCTAATG
GTTGTAGCTTGATCAATCCAGAACAAGCTAAACAGATTGTTCAGGATGGAATATGTGGTC
ATTTAACAATACAGAATTTAATGAAATCTGGAAGGCTAAAAGTTTTTCAGCTACTACATT
ACTTTTTAACTGGATCTCAGCTAAGTGGTATTCAGTCAATGGAATCTAATTTTATCCAGA
ATTATTTAGTAGCTATTGATGAAGAGAAAGATCCACAAATTTTACATCTGATTTTTCGTA
TGAATGTAATCGTTCTTAAAGAGTTTCCTTCAGTAGTCGAGTTTAAGGATGAACTATTTG
AAACAATATCAGTTTATTTTCCTATCGACTTTTCACCGCCTCCAGGTGGTGGTATCTCTG
GAGTTACGCGTGATTTACTAGCGTCTAGCTTGCACCAATGTTTATTTGCTATGCGAAATA
TAACTGGTCATAATCTATGCCACTTATTTGCGAGAAAATTGAATCACAATGGCCTAATGG
TCAGTTGGATGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case