cluster # 3194

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Schistosoma mansoni
cluster # 3194 cluster # 3194 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3194#0 length = 622 sequences # 2

consensusID : consensus_3194#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 622
fasta sequence

                              [GTATAGGTGGTGCTCACGGAGCAGTATCTAGTCTCGATGGTCATCTGTGTCATTTATAATAAAACTTTATGGATTAACATAACTAATATTCGTAGTTGAAGTTAGTCCTAACGATATTATTAGCGATTCAAACAGTTTGTATGTGATGTTCCGTTCTTATTGTATTATGAAATAACACTTGCGGTTGCGCGGACTAATTTCGAGTAAAACTATTGTCTATTGTCTTAACAACTATGTTTCACACGTTTCAACACTTAAGTTAACGCTATAAATCTCCACATACCTGCTTGTCTGCGAGTTTCATCTCATAACTATCTTCATAATTCAATTTCCCCCTTTACTAAACTAATCTTTTTATTTTGACCGTGTTCATTTTTGACAGATCTTTTGTAATGTTTTAAAGCTATACTGTCTTGAATCATTTTTATAATACGAGTAATAATTTAATTACCAGCCACTAAATACTTGACAATTGTGTTGTAGACTATATCTCTTCTATACTTGGTAGCACACTAATCTTTATAAAGTATTCAAGTGTCTCTTTAATCCCACCAAGATTTACAAGTGTATTAGATAATTTAGAGCAAATTATTTTGTTCTCATTATTTGCCCATTTTTTTTG]

[+] EMBL CD069560             [GTATAGGTGGTGCTCACGGAGCAGTATCTAGTCTCGATGGTCATCTGTGTCATTTATAATAAAACTTTATGGATTAACATAACTAATATTCGTAGTTGAAGTTAGTCCTAACGATATTATTAGCGATTCAAACAGTTTGTATGTGATGTTCCGTTCTTATTGTATTATGAAATAACACTTGCGGTTGCGCGGACTAATTTCGAGTAAAACTATTGTCTATTGTCTTAACAACTATGTTTCACACGTTTCAACACTTAAGTTAACGCTATAAATCTCCACATACCTGCTTGTCTGCGAGTTTCATCTCATAACTATCTTCATAATTCAATTTCCCCCTTTACTAAACTAATCTTTTTATTTTGACCGTGTTCATTTTTGACAGATCTTTTGTAATGTTTTAAAGCTATACTGTCTTGAATCATTTTTATAATACGAGTAATAATTTAATTACCAGCCACTAAATACTTGACAATTGTGTTGT                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD149956             [                                                                                                                                                                                                           GTAAAACTATTGTCTATTATCTTACCAACTATGTTTCACACGTTTCAACACTTAAGTTAACGCTAT AATCTCCACATACCTGCTTGTCTGCGAGTTTCATCTCATAACTATCTTCATAATTCAATTTCCCCCTTTACTAAACTAATCTTTTTATTTTGA CGTGTTCATTCTTGACAGATCTTTTGTAATGTTTTAAAGCTATACTGTCTTGAATCATTTTTATAATACGAGTAATAATTTAATTACCAGCCACTAAATACTTGACAATTGTGTTGTAGACTATATCTCTTCTATACTTGGTAGCACACTAATCTTTATAAAGTATTCAAGTGTCTCTTTAATCCCACCAAGATTTACAAGTGTATTAGATAATTTAGAGCAAATTATTTTGTTCTCATTATTTGCCCATTTTTTTTG]




>consensus_3194#0
GTATAGGTGGTGCTCACGGAGCAGTATCTAGTCTCGATGGTCATCTGTGTCATTTATAAT
AAAACTTTATGGATTAACATAACTAATATTCGTAGTTGAAGTTAGTCCTAACGATATTAT
TAGCGATTCAAACAGTTTGTATGTGATGTTCCGTTCTTATTGTATTATGAAATAACACTT
GCGGTTGCGCGGACTAATTTCGAGTAAAACTATTGTCTATTGTCTTAACAACTATGTTTC
ACACGTTTCAACACTTAAGTTAACGCTATAAATCTCCACATACCTGCTTGTCTGCGAGTT
TCATCTCATAACTATCTTCATAATTCAATTTCCCCCTTTACTAAACTAATCTTTTTATTT
TGACCGTGTTCATTTTTGACAGATCTTTTGTAATGTTTTAAAGCTATACTGTCTTGAATC
ATTTTTATAATACGAGTAATAATTTAATTACCAGCCACTAAATACTTGACAATTGTGTTG
TAGACTATATCTCTTCTATACTTGGTAGCACACTAATCTTTATAAAGTATTCAAGTGTCT
CTTTAATCCCACCAAGATTTACAAGTGTATTAGATAATTTAGAGCAAATTATTTTGTTCT
CATTATTTGCCCATTTTTTTTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case