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Schistosoma mansoni
cluster # 328 cluster # 328       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_328#0 length = 1035 sequences # 2  

consensusID : consensus_328#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1035
fasta sequence
                              [CTCCCAGCCAATATTCGGCACGAGGCCTCTCTCACTGAATTATTTACTTCCTCACTTTTCATATTCACTCTCTATATCCACTCCAATCCTCATCCTTACTTTTATTCTCTGCCGTAAATTCTACAGTTTTCATCACTTGACTTATTGCTCAATGTATACATCTATAATCAGTGTCTTCCTTTATTTTACTCCATTATTATAATCCGATTGTTTTTTAATGCTCCCTCTTTCTCCTCCATTTACACATTTCACCGAAGCGCCTTAAGTTCTTGCATAAATACTCTATATTCTATTGAATCTTTATAATATACTAACCTATTATTTAAATAGGTTATCTGTAGAGTAAGCCCGCTTCGTCCATACCCAGGTTTGGTTATTCCTAACATCAAATAATTTATTACCCATTCTTTTTTACATCACATAAGAATATATACATATATAGTCTGTGTTCTGTCTTCATTCTTTTTATTATTTAAAATATGTGAGCGTTTACTCCGATCGATTCATCATAGTCTTTCAATATCGGACCTAAGTTTCCGATTGCAACTTGATTTCTCAGAACATTTTAGAACAGTCAGCGATTTCTGTACTCAGAAGTCGTCATTGAATGATTGTCCTGGTTTTTCTTCTATCTACGATTGTTACCTTTACCACTATTTGGCTAAACCAATCGTCCGTTCTATCTGTTCTTAACCTACAAGTTTAAAATATGTATNTTTGTGTTCGTATATAAAATGATATGAGTTTATATACCTCAGTGTACTAGATTTGCTCAATATTTGTTCTGTATGGAACTTAGTGTTGGATGGAATTTGAATTGTGTAGTGTTTCTGGTTTTTACTAGGTCATCTATAAATATTCATCTATGTGTTATTGTTGTCGTCTTTATTTTCCTGTTAATTAATGAATTAGGCAAATATTTTCCATTTCATAAAATTATTACTTTAAAACCAGCATGTCTTTTTCTCCCTCAATATCTTATTTGTTTTTATTAGATAATAACTTTAAATATAAAAGTAAAAATATCGGTGTTTT]

[+] EMBL CD080756             [CTCCCAGCCAATATTCGGCACGAGGCCTCTCTCACTGAATTATTTACTTCCTCACTTTTCATATTCACTCTCTATATCCACTCCAATCCTCATCCTTACTTTTATTCTCTGCCGTAAATTCTACAGTTTTCATCACTTGACTTATTGCTCAATGTATACATCTATAATCAGTGTCTTCCTTTATTTTACTCCATTATTATAATCCGATTGTTTTTTAATGCTCCCTCTTTCTCCTCCATTTACACATTTCACCGAAGCGCCTTAAGTTCTTGCATAAATACTCTATATTCTATTGAATCTTTATAATATACTAACCTATTATTTAAATAGGTTATCTGTAGAGTAAGCCCGCTTCGTCCATACCCAGGTTTGGTTATTCCTAACATCAAATAATTTATTACCCATTCTTTTTTACATCACATAAGAATATATACATATATAGTCTGTGTTCTGTCTTCATTCTTTTTATTATTTAAAATATGTGAGCGTTTACTCCGATCGATTCATCATAGTCTTTCAATATCGGACCTAAGTTTCCGATTGCAACTTGATTTCTCAGAACATTTTAGAACAGTCAGCGATTTCTGTACTCAGAAGTCGTCATTGAATGATTGTCCTGGTTTTTCTTCTATCTACGATTGTTACCTTTACCACTATTTGGCTAAACCAATCGTCCGTTCTATCTGTTCTTAACCTACAAGTTTAAAATATGTATNTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD074680             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATATACATATATAGTCTGTGTTCTGTCTTCATTCTTTTTATTATTTAAAATATGTGAGCGTTTACTCCGATCGATTCATCATAGTCTTTCAATATCGGACCTAAGTTTCCGATTGCAACTTGATTTCTCAGAACATTTTAGAACAGTCAGCGATTTCTGTACTCAGAAGTCGTCATTGAATGATTGTCCTGGTTTTTCTTCTATCTACGATTGTTACCTTTACCACTATTTGGCTAAACCAATCGTCCGTTCTATCTGTTCTTAACCTACAAGTTTAAAATATGTATTTGTGTGTTCGTATATAAAATGATATGAGTTTATATACCTCAGTGTACTAGATTTGCTCAATATTTGTTCTGTATGGAACTTAGTGTTGGATGGAATTTGAATTGTGTAGTGTTTCTGGTTTTTACTAGGTCATCTATAAATATTCATCTATGTGTTATTGTTGTCGTCTTTATTTTCCTGTTAATTAATGAATTAGGCAAATATTTTCCATTTCATAAAATTATTACTTTAAAACCAGCATGTCTTTTTCTCCCTCAATATCTTATTTGTTTTTATTAGATAATAACTTTAAATATAAAAGTAAAAATATCGGTGTTTT]


>consensus_328#0 CTCCCAGCCAATATTCGGCACGAGGCCTCTCTCACTGAATTATTTACTTCCTCACTTTTC ATATTCACTCTCTATATCCACTCCAATCCTCATCCTTACTTTTATTCTCTGCCGTAAATT CTACAGTTTTCATCACTTGACTTATTGCTCAATGTATACATCTATAATCAGTGTCTTCCT TTATTTTACTCCATTATTATAATCCGATTGTTTTTTAATGCTCCCTCTTTCTCCTCCATT TACACATTTCACCGAAGCGCCTTAAGTTCTTGCATAAATACTCTATATTCTATTGAATCT TTATAATATACTAACCTATTATTTAAATAGGTTATCTGTAGAGTAAGCCCGCTTCGTCCA TACCCAGGTTTGGTTATTCCTAACATCAAATAATTTATTACCCATTCTTTTTTACATCAC ATAAGAATATATACATATATAGTCTGTGTTCTGTCTTCATTCTTTTTATTATTTAAAATA TGTGAGCGTTTACTCCGATCGATTCATCATAGTCTTTCAATATCGGACCTAAGTTTCCGA TTGCAACTTGATTTCTCAGAACATTTTAGAACAGTCAGCGATTTCTGTACTCAGAAGTCG TCATTGAATGATTGTCCTGGTTTTTCTTCTATCTACGATTGTTACCTTTACCACTATTTG GCTAAACCAATCGTCCGTTCTATCTGTTCTTAACCTACAAGTTTAAAATATGTATNTTTG TGTTCGTATATAAAATGATATGAGTTTATATACCTCAGTGTACTAGATTTGCTCAATATT TGTTCTGTATGGAACTTAGTGTTGGATGGAATTTGAATTGTGTAGTGTTTCTGGTTTTTA CTAGGTCATCTATAAATATTCATCTATGTGTTATTGTTGTCGTCTTTATTTTCCTGTTAA TTAATGAATTAGGCAAATATTTTCCATTTCATAAAATTATTACTTTAAAACCAGCATGTC TTTTTCTCCCTCAATATCTTATTTGTTTTTATTAGATAATAACTTTAAATATAAAAGTAA AAATATCGGTGTTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)