cluster # 3284

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Schistosoma mansoni
cluster # 3284 cluster # 3284 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3284#0 length = 564 sequences # 2

consensusID : consensus_3284#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 564
fasta sequence

                              [GGGCGTTTGTCCACAAATTGAATATTGTTTCGATCTGGAATTACCGCCCGATTTTATTCCTGTTAGCTCTGATGGTGAAGTGGATAGTTTCCGATTGGCCAGTATATCACAGATTAAGCAACTCATATTTGACGAACATTTCAAATCAAATTCTGCTCTAGTTGCCTTGGATTTTTTGTACAGACATAAATTTATTGATAAAGACTCAGATCCAAGGCATGCAGAAGTACAGTCCTTGATGCATGTTAATTTACCATTTGATTAATTGCATTTGTGAATACGGTTTTTATCTATCAACTTCATTGTTTCAAAATCAAAAATCCTCATAACTTCTATACATTCGATTATTTTCCAGTAGAAATTAATTATTTTTAACTTACTTGTTTGCTTTGTATTATAAGTGGTATTCATTGTTGGCTAACAGTAAAGACTTCATTCTAGTTACAAATCTTAAGCAGAGTTTTTATCATACAAACATACCCCTTTCAAGTAGCTATCTTTCACATTTAATTTTCCTAACAGATAATTTTACTAAATCGACCTATTNCCTTGCATAAATAATGT]

[+] EMBL CD117540             [GGGCGTTTGTCCACAAATTGAATATTGTTTCGATCTGGAATTACCGCCCGATTTTATTCCTGTTAGCTCTGATGGTGAAGTGGATAGTTTCCGATTGGCCAGTATATCACAGATTAAGCAACTCATATTTGACGAACATTTCAAATCAAATTCTGCTCTAGTTGCCTTGGATTTTTTGTACAGACATAAATTTATTGATAAAGACTCAGATCCAAGGCATGCAGAAGTACAGTCCTTGATGCATGTTAATTTACCATTTGATTAATTGCATTTGTGAATACGGTTTTTATCTATCAACTTCATTGTTTCAAAATCAAAAATCCTCATAACTTCTATACATTCGATTATTTTCCAGTAGAAATTAATTATTTTTAACTTACTTGTTTGCTTTGTATTATAAGTGGT                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AA999465             [                                                                                                                                                                                                                                               TGCATGTTAATTTCCCATTTGATNAATTGCATTTGTGAATACGGTGTTTATCTATCAACTTCATTGTTTCAAAATCAAAAATCCTCATAACTTCTATACATTCGATTATTTTCCAGTAGAAATTAATTATTTTTAACTTAGTTGTTTGCTTTGTATTATAAGTGGTATTCATTGTTGGCTAACAGTAAAGACTTCATTCTAGTTACAAATCTTAAGCAGAGTTTTTATCATACAAACATACCCCTTTCAAGTAGCTATCTTTCACATTTAATTTTCCTAACAGATAATTTTACTAAATCGACCTATTNCCTTGCATAAATAATGT]




>consensus_3284#0
GGGCGTTTGTCCACAAATTGAATATTGTTTCGATCTGGAATTACCGCCCGATTTTATTCC
TGTTAGCTCTGATGGTGAAGTGGATAGTTTCCGATTGGCCAGTATATCACAGATTAAGCA
ACTCATATTTGACGAACATTTCAAATCAAATTCTGCTCTAGTTGCCTTGGATTTTTTGTA
CAGACATAAATTTATTGATAAAGACTCAGATCCAAGGCATGCAGAAGTACAGTCCTTGAT
GCATGTTAATTTACCATTTGATTAATTGCATTTGTGAATACGGTTTTTATCTATCAACTT
CATTGTTTCAAAATCAAAAATCCTCATAACTTCTATACATTCGATTATTTTCCAGTAGAA
ATTAATTATTTTTAACTTACTTGTTTGCTTTGTATTATAAGTGGTATTCATTGTTGGCTA
ACAGTAAAGACTTCATTCTAGTTACAAATCTTAAGCAGAGTTTTTATCATACAAACATAC
CCCTTTCAAGTAGCTATCTTTCACATTTAATTTTCCTAACAGATAATTTTACTAAATCGA
CCTATTNCCTTGCATAAATAATGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case