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Schistosoma mansoni
cluster # 3316 cluster # 3316       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3316#0 length = 618 sequences # 2  

consensusID : consensus_3316#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 618
fasta sequence
                              [TACGGTGAGCTGTGGAAGTATTTCCCACACTTACAGATCTCTGGTTACTTTCCAAAGATCGGACTATACTACTTTTATTACAAGTTCAGAATGATCATCCATCACCTTTAATATTGAAAACTGCTTTCTATGCGAATGTTCATGATGCTCTTCGGTCTTACTCTTGATATCTAGGTTTTAAAGTTGGAAATACTTTAGACGACAATTATCAATTTAGAGATGTTTTTAAGAGGTTATGTAATTGCTACATGTCCAAAAGGATCTGGTTGAAGTAATCTTCCACTATCATATCTGTAACTCTTACTTTTCCGCCATGCTCCATATTGTACTGACTGACTGTAGTAATTTGAACAGAGCATATCTGTCACTGGTTACACTTTGTTTATGACCGAAAAAGGGTTTTCCTTTATGTGGAAGTTAACTTGGTTTCTGGCGTCGTACTATTTCACTAGAATATAATGTAATTGGTTAATGCTGAATAAACATTTATGGGACAACACATTTCCTATGGAGATGTGGCACACATCAGCAAATAACCTATTCTGCACAGTTAATTTGCACTTTGTAAAAAAGACAAACATATGGTAATAAGTTTTAGTCTGCCAATTCATTACAACC]

[+] EMBL CD197318             [TACGGTGAGCTGTGGAAGTATTTCCCACACTTACAGATCTCTGGTTACTTTCCAAAGATCGGACTATACTACTTTTATTACAAGTTCAGAATGATCATCCATCACCTTTAATATTGAAAACTGCTTTCTATGCGAATGTTCATGATGCTCTTCGGTCTTACTCTTGATATCTAGGTTTTAAAGTTGGAAATACTTTAGACGACAATTATCAATTTAGAGATGTTTTTAAGAGGTTATGTAATTGCTACATGTCCAAAAGGATCTGGTTGAAGTAATCTTCCACTATCATATCTGTAACTCTTACTTTTCCGCCATGCTCCATATTGTACTGACTGACTGTAGTAATTTGAACAGAGCATATCTGTCACTGGTTACACTTTGTTTATGACCGAAAAAGGGTTTTCCTTTATGTGGAAGTTAACTTGGTTTCTGGCGTCGTACTATT                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD197319             [                                                                                                                                                                                                         ACAATAATCAATTAAGAGATGTTTTTAAGAGGTTATGTAATTGCAACATGTCCAAAAGGATCTGGTTGAAGTAATCTTCCACTATAAAATCTGTAACTCTTACTTTTCCGCCATGCTCCATATTGTACTGACTGACTGTAGTAATTTGAACAGAGCATATCTGTCACTGGTTACACTTTGTTTATGACCGAAAAAGGGTTTTCCTTTATGTGGAAGTTAACTTGGTTTCTGGCGTCGTACTATTTCACTAGAATATAATGTAATTGGTTAATGCTGAATAAACATTTATGGGACAACACATTTCCTATGGAGATGTGGCACACATCAGCAAATAACCTATTCTGCACAGTTAATTTGCACTTTGTAAAAAAGACAAACATATGGTAATAAGTTTTAGTCTGCCAATTCATTACAACC]


>consensus_3316#0 TACGGTGAGCTGTGGAAGTATTTCCCACACTTACAGATCTCTGGTTACTTTCCAAAGATC GGACTATACTACTTTTATTACAAGTTCAGAATGATCATCCATCACCTTTAATATTGAAAA CTGCTTTCTATGCGAATGTTCATGATGCTCTTCGGTCTTACTCTTGATATCTAGGTTTTA AAGTTGGAAATACTTTAGACGACAATTATCAATTTAGAGATGTTTTTAAGAGGTTATGTA ATTGCTACATGTCCAAAAGGATCTGGTTGAAGTAATCTTCCACTATCATATCTGTAACTC TTACTTTTCCGCCATGCTCCATATTGTACTGACTGACTGTAGTAATTTGAACAGAGCATA TCTGTCACTGGTTACACTTTGTTTATGACCGAAAAAGGGTTTTCCTTTATGTGGAAGTTA ACTTGGTTTCTGGCGTCGTACTATTTCACTAGAATATAATGTAATTGGTTAATGCTGAAT AAACATTTATGGGACAACACATTTCCTATGGAGATGTGGCACACATCAGCAAATAACCTA TTCTGCACAGTTAATTTGCACTTTGTAAAAAAGACAAACATATGGTAATAAGTTTTAGTC TGCCAATTCATTACAACC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)