cluster # 3382

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Schistosoma mansoni
cluster # 3382 cluster # 3382 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3382#0 length = 512 sequences # 2

consensusID : consensus_3382#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 512
fasta sequence

                              [TATTTTCGGCTATTGGCTCTTGATAGGGTGCGCTGTTATACCTAGGGTGACTTGGTCCGTTGTACAATTTGTTTGGGTCAATAAGAGTATATTTTGTACTTTGCTTGTAAGCCTAGGTTTTAATCATTCGGAAGGTTTTTTTATTCTCCGAGGTCACCCCAACCGGAATCTACCAACTTATATTTAGTTTTTTAAAGTCAGTAGACTGTTTGTTATTAAAATTAAGTTGTGAGATTAAAGCTCCATAGGGTCTTCTCGTTTTATTATTATATCCCCGCCTCTTCACGGGAAGGTCAATTTCACTGATTGGAAATAAGAGACAGTTGAACCCTCGTTTAGCCTTTCATACTAGTCCCTAATTAAGGAACAAGTGATTATGCTACCTTTGCACGGTCAGGATACCGCGGCCGTTTAACTTAGTCACTGGGCAGGCATTGCCTCTAATACCTATAATGCTAGAGGTTATGTTTTTGGTAAACAAGCGGGATTCATGTTTGCCGAGNTCCTTTTAT]

[-] EMBL AI820488             [TATTTTCGGCTATTGGCTCTTGATAGGGTGCGCTGTTATACCTAGGGTGACTTGGTCCGTTGTACAATTTGTTTGGGTCAATAAGAGTATATTTTGTACTTTGCTTGTAAGCCTAGGTTTTAATCATTCGGAAGGTTTTTTTATTCTCCGAGGTCACCCCAACCGGAATCTACCAACTTATATTTAGTTTTTTAAAGTCAGTAGACTGTTTGTTATTAAAATTAAGTTGTGAGATTAAAGCTCCATAGGGTCTTCTCGTTTTATTATTATATCC                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD167184             [                                                                                                                                                     ttattgACCCCAACCGAAATCTA CAACTTATATTTAGTTTTTTAAAGTCAGTAGACTGTTTGTTATTAAAATTAAGTTGTGAGATTAAAGCTCCATAGGGTCTTCTCGTCTTATTATTATATCCCCGCCTCTTCACGGGAAGGTCAATTTCACTGATTGGAAATAAGAGACAGTTGAACCCTCGTTTAGCCTTTCATACTAGTCCCTAATTAAGGAACAAGTGATTATGCTACCTTTGCACGGTCAGGATACCGCGGCCGTTTAACTTAGTCACTGGGCAGGCATTGCCTCTAATACCTATAATGCTAGAGGTTATGTTTTTGGTAAACAAGCGGGATTCATGTTTGCCGAGNTCCTTTTAT]




>consensus_3382#0
TATTTTCGGCTATTGGCTCTTGATAGGGTGCGCTGTTATACCTAGGGTGACTTGGTCCGT
TGTACAATTTGTTTGGGTCAATAAGAGTATATTTTGTACTTTGCTTGTAAGCCTAGGTTT
TAATCATTCGGAAGGTTTTTTTATTCTCCGAGGTCACCCCAACCGGAATCTACCAACTTA
TATTTAGTTTTTTAAAGTCAGTAGACTGTTTGTTATTAAAATTAAGTTGTGAGATTAAAG
CTCCATAGGGTCTTCTCGTTTTATTATTATATCCCCGCCTCTTCACGGGAAGGTCAATTT
CACTGATTGGAAATAAGAGACAGTTGAACCCTCGTTTAGCCTTTCATACTAGTCCCTAAT
TAAGGAACAAGTGATTATGCTACCTTTGCACGGTCAGGATACCGCGGCCGTTTAACTTAG
TCACTGGGCAGGCATTGCCTCTAATACCTATAATGCTAGAGGTTATGTTTTTGGTAAACA
AGCGGGATTCATGTTTGCCGAGNTCCTTTTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case