cluster # 3426

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Schistosoma mansoni
cluster # 3426 cluster # 3426 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3426#0 length = 617 sequences # 2

consensusID : consensus_3426#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 617
fasta sequence

                              [AGTTTGACTCGTTCCGATTTTGGTATAGATGATGGTGTTGGTGCTGGTACTGGTGTAGATGAATTATTTTTCTTACATATATTTGATTCACACTTTTCCAGGGTTGAAAGATTGACAACAGATTGACTTTTTGAAGCTTTTAATGCTCGTAATCGTGTAGTCATTTCTTTTGGAAGATATGATAATTCTTGTTCAGTAAATTGACTCAAAAAATTTGGCGCCGGTTTACCACTAGGTAAATAACCTGTTGCATCGATTGAATGACCAGGAGGTGGCAAGATGAGATCATTAAAAAGACAGCAACTCAAAATATTACAAGCAGTCATACGAGTTTTAGGACTGTAAACTAACAACTTTCCAAGTACATAGAATGCTGCTGTGTTGGTACTTCGATTACGAATAAGTTTTTCCCATGAACATCCTTGAATATTTGGAAATTTGAATTCACTATAATGAGGATTCATTTCATGGATTTGTTCACGCGTTGGAGTACCAAGAACTTTAATAATTTCAACTAATTGATCAACTCCTGATTCACCTGGAAAAAGTGGTCGACCTAATAAAAGTTCACCAATAACGCAACCAGCTGACCACATATCTATTTGTACAGTATAGTG]

[+] EMBL CD185168             [AGTTTGACTCGTTCCGATTTTGGTATAGATGATGGTGTTGGTGCTGGTACTGGTGTAGATGAATTATTTTTCTTACATATATTTGATTCACACTTTTCCAGGGTTGAAAGATTGACAACAGATTGACTTTTTGAAGCTTTTAATGCTCGTAATCGTGTAGTCATTTCTTTTGGAAGATATGATAATTCTTGTTCAGTAAATTGACTCAAAAAATTTGGCGCCGGTTTACCACTAGGTAAATAACCTGTTGCATCGATTGAATGACCAGGAGGTGGCAAGATGAGATCATTAAAAAGACAGCAACTCAAAATATTACAAGCAGTCATACGAGTTTTAGGACTGTAAACTAACAACTTTCCAAGTACATAGAATGCTGCTGTGTTGGTACTTCGATTACGAATAAGTTTTTCCCATGAACATCCTTGAATATTTGGAAATTTGAATTCACTATAATGAGGATTCATTTCATGGATTTGTTCACGCGTTGGAGTACCAAGAACTTTAATAATTTCAACTAATTGATCAACTCCTGATTCACCTGGAAAAAGTGGTCGACCTAATAAAAGTTCACCAATAACGCAACCAGCTGACCACATATCTATTTGTACAGTATAGT ]
[-] EMBL CD133744             [                                                                        TTACATATATTTGATTCACACTTTTCCAGGGTTGAAAGATTGACAACAGATTGACTTTTTGAAGCTTTTAATGCTCGTAATCGTGTAGTCATTTCTTTTGGAAGATATGATAATTCTTGTTCAGTAAATTGATTCAAAAAATTTGGCGCCGGTTTACCACTAGGTAAATAACCTGTTGCATCGATTGAATGACCAGGAGGTGGCAAGATGAGATCATTAAAAAAACAGCAACTCAAAATATTACAAGCAGTCATACGAGTTTTAGGACTGTAAACTAACAACTTTCCAAGTACATAGAATGCTGCTGTGTTGGTACTTCGATTACGAATAAGTTTTTCCCATGAACATCCTTGAATATTTGGAAATTTGAATTCACTATAATGAGGATTCATTTCATGGATTTGTTCACGCGTTGGAGTACCAAGAACTTTAATAATTTCAACTAATTGATCAACTCCTGATTCACCTGGAAAAAGTGGTCGACCTAATAAAAGTTCACCAATAACGCAACCAGCTGACCACATATCTATTTGTACAGTATAGTG]




>consensus_3426#0
AGTTTGACTCGTTCCGATTTTGGTATAGATGATGGTGTTGGTGCTGGTACTGGTGTAGAT
GAATTATTTTTCTTACATATATTTGATTCACACTTTTCCAGGGTTGAAAGATTGACAACA
GATTGACTTTTTGAAGCTTTTAATGCTCGTAATCGTGTAGTCATTTCTTTTGGAAGATAT
GATAATTCTTGTTCAGTAAATTGACTCAAAAAATTTGGCGCCGGTTTACCACTAGGTAAA
TAACCTGTTGCATCGATTGAATGACCAGGAGGTGGCAAGATGAGATCATTAAAAAGACAG
CAACTCAAAATATTACAAGCAGTCATACGAGTTTTAGGACTGTAAACTAACAACTTTCCA
AGTACATAGAATGCTGCTGTGTTGGTACTTCGATTACGAATAAGTTTTTCCCATGAACAT
CCTTGAATATTTGGAAATTTGAATTCACTATAATGAGGATTCATTTCATGGATTTGTTCA
CGCGTTGGAGTACCAAGAACTTTAATAATTTCAACTAATTGATCAACTCCTGATTCACCT
GGAAAAAGTGGTCGACCTAATAAAAGTTCACCAATAACGCAACCAGCTGACCACATATCT
ATTTGTACAGTATAGTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case