cluster # 3446

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Schistosoma mansoni
cluster # 3446 cluster # 3446 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3446#0 length = 733 sequences # 2

consensusID : consensus_3446#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 733
fasta sequence

                              [TATGCTTAATATTGTAAACTATCTATAACCATTGAAATCGATGGAATTTTGAAATTAGGATCATCTGACAATTGAAACTAGAAATTCAAAGAGTAGGAATTTTAATGTTTTATATGATTGTGTATATGTATGAGTGCATCAAAGTCAAATGTAAACTTCAAACAACCGTCTCATTTAACTAGTAAGATCGATCAGCCAGTTGAACATGGCTATTATAAATCATGTATACTACTTTACGATATAAGTTGTCAATACTCATAAATACAGATCAGTACTTTTGAAAAAATATTCCTTTCAATCATTTCACTTGCGATTTTTTAGTCATCTAAATGTTACATAATAGGTTTCTCTTCATAATATCATCTGCTCCAATTATTTTGGACTTAAACTTGTTGACAGTAAAAATCAAAAGCTTTTATCCAGTTTGATAGGCTTAGAAGTTTTATTGGATGGTATATTTTCGATTAGATATTATGTGGCTATTGAACTGAAGATCTATAAGATACTGAGTTTGTTATTTTCTACACATGAACATGTAAAAACATACTGTGTTTTTAGTTGAAAAGCTAGCTACTAACAAATAAGTGTGGTAGTAAACTTGTATATCGTTTTACTTTAAGCCTGTCAATATTCAACGAAGCANAGTTTAGAAACTGAAAAATATTATTCGAAAAATCAACTGTTTAATCTATTAAACAACTGGGTCATATTTTGAATAACACATTTTTTGATT]

[+] EMBL CD149646             [TATGCTTAATATTGTAAACTATCTATAACCATTGAAATCGATGGAATTTTGAAATTAGGATCATCTGACAATTGAAACTAGAAATTCAAAGAGTAGGAATTTTAATGTTTTATATGATTGTGTATATGTATGAGTGCATCAAAGTCAAATGTAAACTTCAAACAACCGTCTCATTTAACTAGTAAGATCGATCAGCCAGTTGAACATGGCTATTATAAATCATGTATACTACTTTACGATATAAGTTGTCAATACTCATAAATACAGATCAGTACTTTTGAAAAAATATTCCTTTCAATCATTTCACTTGCGATTTTTTAGTCATCTAAATGTTACATAATAGGTTTCTCTTCATAATATCATCTGCTCCAATTATTTTGGACTTAAACTTGTTGACAGTAAAAATCAAAAGCTTTTATCCAGTTTGATAGGCTTAGAAGTTTTATTGGATGGTATATTTTCGATTAGATATTATGTGGCTATTGAACTGAAGATCTATAAGATACTGAGTTTGTTATTTTCTACACATGAACATGTAAAAACATACTGTGTTTTTAGTTGAAAAGCTAGCTACTAACAAATAAGTGTGGTAGTAAACTTGTATATCGTTTTACTTTAAGCCTGTCAATATTCAACGAAGCANAGTTTAGAAACTGAAAAATATTATTCGAAAAATCAACTGTTTAATCTATTAAACAACTGGGTCATATTTTGAATAACACATTTTTTGATT]
[+] EMBL CD149363             [TATGCTTAATATTGTAAACTATCTATAACCATTGAAATCGATGGAATTTTGAAATTAGGATCATCTGACAATTGAAACTAGAAATTCAAAGAGTAGGAATTTTAATGTTTTATATGATTGTGTATATGTATGAGTGCATCAAAGTCAAATGTAAATTTCAAACAACCGTCTCATTTAACTAGTAAGATCGATCAGCCAGTTGAACATGGCTATTATAAATCATGTATACTACTTTACGATATAAGTTGTCAATACTCATAAATACAGATCAGTACTTTTGAAAAAATATTCCTTTCAATCATTTCACTTGTGATTNTTTAGTCATCTAAATGTTACATAATAGGTTTCTCTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_3446#0
TATGCTTAATATTGTAAACTATCTATAACCATTGAAATCGATGGAATTTTGAAATTAGGA
TCATCTGACAATTGAAACTAGAAATTCAAAGAGTAGGAATTTTAATGTTTTATATGATTG
TGTATATGTATGAGTGCATCAAAGTCAAATGTAAACTTCAAACAACCGTCTCATTTAACT
AGTAAGATCGATCAGCCAGTTGAACATGGCTATTATAAATCATGTATACTACTTTACGAT
ATAAGTTGTCAATACTCATAAATACAGATCAGTACTTTTGAAAAAATATTCCTTTCAATC
ATTTCACTTGCGATTTTTTAGTCATCTAAATGTTACATAATAGGTTTCTCTTCATAATAT
CATCTGCTCCAATTATTTTGGACTTAAACTTGTTGACAGTAAAAATCAAAAGCTTTTATC
CAGTTTGATAGGCTTAGAAGTTTTATTGGATGGTATATTTTCGATTAGATATTATGTGGC
TATTGAACTGAAGATCTATAAGATACTGAGTTTGTTATTTTCTACACATGAACATGTAAA
AACATACTGTGTTTTTAGTTGAAAAGCTAGCTACTAACAAATAAGTGTGGTAGTAAACTT
GTATATCGTTTTACTTTAAGCCTGTCAATATTCAACGAAGCANAGTTTAGAAACTGAAAA
ATATTATTCGAAAAATCAACTGTTTAATCTATTAAACAACTGGGTCATATTTTGAATAAC
ACATTTTTTGATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case