cluster # 3560

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Schistosoma mansoni
cluster # 3560 cluster # 3560 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3560#0 length = 871 sequences # 2

consensusID : consensus_3560#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 871
fasta sequence

                              [CCTGATATGATTATTAGAATCATTTAATATAAAAGATTAGGATTAAATGCCGCTTTTTCGGATTTTCATTCGTTTTTCATTCAATTAAATTTAATTCATACATAGAAAATAAATGAACAACTAAACATGTATGAACAAATACCACGTAAAATTTGTCTACATTGGTACCGATCAGATTCCTTTCAATTTTCGGAAAAGTCCTTTTTCGACTTAACTGATCGCTTGTGTAATATGGTAACGCGAACCTACCTAGAAATTAATAATGATGGTTATATCTATAAGCAACCTGTATCATACTTCACACCGAATTCACAAAATTTCCAACGACAATGGAAAAGTCATCAGAATTTACATGAATCACGCTTGCTTAATCGTCATGTGTCCGATCAGTACATTACCATACCAACAACACGTTTAAATAATGATTCCCATAAAAATGTAAAGGGATGTTGTAATATTACTTTAAGTATTAATACTAATAATGATCATAACAATAATAACAGTCACTGTAATAGCAATTATAGTATTAATAGTGCAAACAACCATTGTCTGCAACAACATTGTCACAAGCCTTCATTAAATGTATATAACAACATAAATAATCATCGCCTAGTATCAAAAGAAAACCCCTCTACCATGAGGTTCGGTGAAAAATTACGTTCTACATCCCTGCCACCACTATCACTTCCCATAAATTATTTTACTTCCCAAAAATCAATAATTGCCAATACTGGCCACACCTCACCGTCATTGGTCAATCAGATGTGTCATAAATTCTCCTCCACCTCCGCATGTCAACATAGTGGTGCAGATTGGGAAGATTGCCGTATTAGCATAGATTGTTTTGGTATTAAAGGAAAACACTGTAAAT]

[+] EMBL AI977681             [CCTGATATGATTATTAGAATCATTTAATATAAAAGATTAGGATTAAATGCCGCTTTTTCGGATTTTCATTCGTTTTTCATTCAATTAAATTTAATTCATACATAGAAAATAAATGAACAACTAAACATGTATGAACAAATACCACGTAAAATTTGTCTACATTGGTACCGATCAGATTCCTTTCAATTTTCGGAAAAGTCCTTTTTCGACTTAACTGATCGCTTGTGTAATATGGTAACGCGAACCTACCTAGAAATTAATAATGATGGTTATATCTATAAGCAACCTGTATCATACTTCACACCGAATTCACAAAATTTCCAACGACAATGGAAAAGTCATCAGAATTTACATGAATCACGCTTGCTTAATCGTCATGTGTCCGATCAGTACATTACCATACCAACAACACGTTTAAATAATGATTCCCATAAAAATGTAAAGGGATGTTGTAATATTACTTTAAGTATTAATACTAATAATGATCATAACAATAATAACAGTCACTGTAATAGCAATTATAGTATTAATAGTGCAAACAACCATTGTCTGCAACAACATTGTCACAAGCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD168865             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTAATAGTGCAAACAACCATTGTCTGCAACAACATTTTCACAAGCCTCCATTAAATGTATATAACAACATAAATAATCATCGCCTAGTATCAAAAGAAAACCCCTCTACCATGAGGTTCGGTGAAAAATTACGTTCTACATCCCTGCCACCACTATCACTTCCCATAAATTATTTTACTTCCCAAAAATCAATAATTGCCAATACTGGCCACACCTCACCGTCATTGGTCAATCAGATGTGTCATAAATTCTCCTCCACCTCCGCATGTCAACATAGTGGTGCAGATTGGGAAGATTGCCGTATTAGCATAGATTGTTTTGGTATTAAAGGAAAACACTGTAAAT]




>consensus_3560#0
CCTGATATGATTATTAGAATCATTTAATATAAAAGATTAGGATTAAATGCCGCTTTTTCG
GATTTTCATTCGTTTTTCATTCAATTAAATTTAATTCATACATAGAAAATAAATGAACAA
CTAAACATGTATGAACAAATACCACGTAAAATTTGTCTACATTGGTACCGATCAGATTCC
TTTCAATTTTCGGAAAAGTCCTTTTTCGACTTAACTGATCGCTTGTGTAATATGGTAACG
CGAACCTACCTAGAAATTAATAATGATGGTTATATCTATAAGCAACCTGTATCATACTTC
ACACCGAATTCACAAAATTTCCAACGACAATGGAAAAGTCATCAGAATTTACATGAATCA
CGCTTGCTTAATCGTCATGTGTCCGATCAGTACATTACCATACCAACAACACGTTTAAAT
AATGATTCCCATAAAAATGTAAAGGGATGTTGTAATATTACTTTAAGTATTAATACTAAT
AATGATCATAACAATAATAACAGTCACTGTAATAGCAATTATAGTATTAATAGTGCAAAC
AACCATTGTCTGCAACAACATTGTCACAAGCCTTCATTAAATGTATATAACAACATAAAT
AATCATCGCCTAGTATCAAAAGAAAACCCCTCTACCATGAGGTTCGGTGAAAAATTACGT
TCTACATCCCTGCCACCACTATCACTTCCCATAAATTATTTTACTTCCCAAAAATCAATA
ATTGCCAATACTGGCCACACCTCACCGTCATTGGTCAATCAGATGTGTCATAAATTCTCC
TCCACCTCCGCATGTCAACATAGTGGTGCAGATTGGGAAGATTGCCGTATTAGCATAGAT
TGTTTTGGTATTAAAGGAAAACACTGTAAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case