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Schistosoma mansoni
cluster # 3629 cluster # 3629       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3629#0 length = 853 sequences # 2  

consensusID : consensus_3629#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 853
fasta sequence
                              [TTGAACGCAATTTCGAGTCTGGTTGACTGACCCTCGGATTTCATGCTATGCCACCTTTAAAAGTGTTGTGTCTACATGGATACAGGCAAAACTCGGATGTTTTTCGCGAAAAAACAGGCGGATTTAGAAAATCACTAAAGAAGTTTTGTGAATTTAAATTTATGTCTGCCCCAAATATTATCAACTGCTCTTCAAATGGTTGTGCCTGGTGGTTTTCTAAACCTATGGAATTTTCAGCACAAGAAAGTAGTGCGTATGATGCTGGCTTTCGCGAATCCCTGTTGGCTGTCAAAAAACACATTAAAGAAGAGGGTCCTTTCGATGGGATGTTTGGTTTCAGCCAAGGTGCAGCATTCTTACTTTTGCTACAAATTATGATGGAGCATAAATTAGATGATTTCTCAGATTACGATATGGAGCCGATCAAATTTACTATATTGGTTGCACCTTTTATCAGTCGTTGTTTACTTCATCAAGCTATTTATGTTCATAAAACATCGATACCGAGCCTAGTCATTTATGGTGAAACAGATTCTGTTATCCCCCGAGAAATGTCTGAGGAGACACTAAATGTATTGGTATTTAAACCAAAAGTATTAGTACATGACGGCGGTCATTACATTCCTACACACGCTGATGCAAAGAAAATATATGCTGATATTGTTTCACAATTTATAGAAAAACAGATACAACTTCCAGAATTTAGTTTTCATCATCCTGTACCTGAAACCTCATTTTCTATAGATTAATTTTTGTAACGCTGTAACGATTTTTTGTTAATCCAGATAATTGATTATAAGTGGTGCATTTTTCAACAGTTAAAAACGTAAATCAATTTATTAAATCTAGCACA]

[+] EMBL CD078599             [TTGAACGCAATTTCGAGTCTGGTTGACTGACCCTCGGATTTCATGCTATGCCACCTTTAAAAGTGTTGTGTCTACATGGATACAGGCAAAACTCGGATGTTTTTCGCGAAAAAACAGGCGGATTTAGAAAATCACTAAAGAAGTTTTGTGAATTTAAATTTATGTCTGCCCCAAATATTATCAACTGCTCTTCAAATGGTTGTGCCTGGTGGTTTTCTAAACCTATGGAATTTTCAGCACAAGAAAGTAGTGCGTATGATGCTGGCTTTCGCGAATCCCTGTTGGCTGTCAAAAAACACATTAAAGAAGAGGGTCCTTTCGATGGGATGTTTGGTTTCAGCCAAGGTGCAGCATTCTTACTTTTGCTACAAATTATGATGGAGCATAAATTAGATGATTTCTCAGATTACGATATGGAGCCGATCAAATTTACTATATTGGTTGCACCTTTTATCAGTCGTTGTTTACTTCATCAAGCTATTTATGTTCATAAAACATCGATACCGAGCCTAGTCATTTATGGTGAAACAGATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD073063             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAGCCAAGGTGCAGCATTCTTACTTTTGGTACAAATTATGATGGAGCATNAATTAGATGATTTTTCAGATTACGATATGGAGCCGATCAAATTTACTATATTGGTTGCACCTTTTATCAGTCGTTGTTTACTTCATCAAGCTATTTATGTTCATAAAACATCGATACCGAGCCTAGTCATTTATGGTGAAACAGATTCTGTTATCCCCCGAGAAATGTCTGAGGAGACACTAAATGTATTGGTATTTAAACCAAAAGTATTAGTACATGACGGCGGTCATTACATTCCTACACACGCTGATGCAAAGAAAATATATGCTGATATTGTTTCACAATTTATAGAAAAACAGATACAACTTCCAGAATTTAGTTTTCATCATCCTGTACCTGAAACCTCATTTTCTATAGATTAATTTTTGTAACGCTGTAACGATTTTTTGTTAATCCAGATAATTGATTATAAGTGGTGCATTTTTCAACAGTTAAAAACGTAAATCAATTTATTAAATCTAGCACA]


>consensus_3629#0 TTGAACGCAATTTCGAGTCTGGTTGACTGACCCTCGGATTTCATGCTATGCCACCTTTAA AAGTGTTGTGTCTACATGGATACAGGCAAAACTCGGATGTTTTTCGCGAAAAAACAGGCG GATTTAGAAAATCACTAAAGAAGTTTTGTGAATTTAAATTTATGTCTGCCCCAAATATTA TCAACTGCTCTTCAAATGGTTGTGCCTGGTGGTTTTCTAAACCTATGGAATTTTCAGCAC AAGAAAGTAGTGCGTATGATGCTGGCTTTCGCGAATCCCTGTTGGCTGTCAAAAAACACA TTAAAGAAGAGGGTCCTTTCGATGGGATGTTTGGTTTCAGCCAAGGTGCAGCATTCTTAC TTTTGCTACAAATTATGATGGAGCATAAATTAGATGATTTCTCAGATTACGATATGGAGC CGATCAAATTTACTATATTGGTTGCACCTTTTATCAGTCGTTGTTTACTTCATCAAGCTA TTTATGTTCATAAAACATCGATACCGAGCCTAGTCATTTATGGTGAAACAGATTCTGTTA TCCCCCGAGAAATGTCTGAGGAGACACTAAATGTATTGGTATTTAAACCAAAAGTATTAG TACATGACGGCGGTCATTACATTCCTACACACGCTGATGCAAAGAAAATATATGCTGATA TTGTTTCACAATTTATAGAAAAACAGATACAACTTCCAGAATTTAGTTTTCATCATCCTG TACCTGAAACCTCATTTTCTATAGATTAATTTTTGTAACGCTGTAACGATTTTTTGTTAA TCCAGATAATTGATTATAAGTGGTGCATTTTTCAACAGTTAAAAACGTAAATCAATTTAT TAAATCTAGCACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)