cluster # 3656

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Schistosoma mansoni
cluster # 3656 cluster # 3656 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3656#0 length = 786 sequences # 2

consensusID : consensus_3656#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 786
fasta sequence

                              [GGTATGACAGTAAACCTAATGGAAGCATTCTTTTAAATAGATCCCATGCATCTTGATTATTTTCAGACCATAATGCAACTAACTGACGACTAAGCTGTTGCACAGCTAAACTTCGTGGATCA-TTTCCTTGAG-TAAAACAAGCAGTCCAAAAA-TGA-TGTAATAGTGCACCTTCAGTTAAAGCTAAACTGCGTAATTCTTTAGCAACGTCTGTTCCACCTTCTTCAA-TTAATGCACGCATTATCATACCTCCACCACGAACAATAGCTAAGCTTGGATGAAGATATAATCGAAATAATGCACGACCACGATTAGCTAATAAACGTAGTAAATTATCAAATAATCCACCTTCAGATGTTTCAGAATATGGTAAACAAACACCATAAGTAAAAAAGTCTAATAAAGCACAAAGTACTAGTGAACCACTTCCACGTAAAGCATGTAATGTGAATATATCAACAAGATGTGCTAAAAATATTTCACTAGACATAATAGATGCTTTATTCAATTGTTCTTGTCTAATATCTGGTTGATCATGCATTGGATGCATTAATGTATTAATAGCATCTAAAACAGAATGTGTAACAGCATCATTACGTAGTTNTAATGCATTCACTACAAGTTGACCTAATGTTACACGTATTCCGGGTAGTTGAGTGAAAGCATTAAATCCCGCTTTTGATGCTACCAGTCGACGTAATGCATNNGAATGTGCTTCATTTAAAATTAACTCGTATAGTATATTATTAGTAGTAGAAGTAGTAATACTATCAGTAGTCCATGGTAAGA]

[+] EMBL CD122500             [GGTATGACAGTAAACCTAATGGAAGCATTCTTTTAAATAGATCCCATGCATCTTGATTATTTTCAGACCATAATGCAACTAACTGACGACTAAGCTGTTGCACAGCTAAACTTCGTGGATCA TTTCCTTGAG TAAAACAAGCAGTCCAAAAA TGA TGTAATAGTGCACCTTCAGTTAAAGCTAAACTGCGTAATTCTTTAGCAACGTCTGTTCCACCTTCTTCAA TTAATGCACGCATTATCATACCTCCACCACGAACAATAGCTAAGCTTGGATGAAGATATAATCGAAATAATGCACGACCACGATTAGCTAATAAACGTAGTAAATTATCAAATAATCCACCTTCAGATGTTTCAGAATATGGTAAACAAACACCATAAGTAAAAAAGTCTAATAAAGCACAAAGTACTAGTGAACCACTTCCACGTAAAGCATGTAATGTGAATATATCAACAAGATGTGCTAAAAATATTTCACTAGACATAATAGATGCTTTATTCAATTGTTCTTGTCTAATATCTGGTTGATCATGCATTGGATGCATTAATGTATTAATAGCATCTAAAACAGAATGTGTAACAGCATCATTACGTAGTTNTAATGCATTCACTACAAGTTGACCTAATGTTACACGTATTCCGGGTAGTTGAGTGAAAGCATTAAATCCCGCTTTTGATGCTACCAGTCGACGTAATGCATNNGAATGTGCTTCATTTAAAATTAACTCGTATAGTATATTATTAGTAGTAGAAGTAGTAATACTATCAGTAGTCCATGGTAAGA]
[-] EMBL CD171477             [                                                                                                                      tTCATTTTCCTTGAGTTAAAACAAGCAGTCCAAAAATTGATTGTAATAGTGCACCTTCAGTTAAAGCTAAACTGCGTAATTCTTTAGCAACGTCTGTTCCACCTTCTTCAATTTAATGCACGCATTATCATACCTCCACCACGAACAATAGCTAAGCTTGGATGAAGATATAATCGAAATAATGCACGACCACGATTAGCCAATAAACGTAGTAAATTATCAAATAATCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]




>consensus_3656#0
GGTATGACAGTAAACCTAATGGAAGCATTCTTTTAAATAGATCCCATGCATCTTGATTAT
TTTCAGACCATAATGCAACTAACTGACGACTAAGCTGTTGCACAGCTAAACTTCGTGGAT
CATTTCCTTGAGTAAAACAAGCAGTCCAAAAATGATGTAATAGTGCACCTTCAGTTAAAG
CTAAACTGCGTAATTCTTTAGCAACGTCTGTTCCACCTTCTTCAATTAATGCACGCATTA
TCATACCTCCACCACGAACAATAGCTAAGCTTGGATGAAGATATAATCGAAATAATGCAC
GACCACGATTAGCTAATAAACGTAGTAAATTATCAAATAATCCACCTTCAGATGTTTCAG
AATATGGTAAACAAACACCATAAGTAAAAAAGTCTAATAAAGCACAAAGTACTAGTGAAC
CACTTCCACGTAAAGCATGTAATGTGAATATATCAACAAGATGTGCTAAAAATATTTCAC
TAGACATAATAGATGCTTTATTCAATTGTTCTTGTCTAATATCTGGTTGATCATGCATTG
GATGCATTAATGTATTAATAGCATCTAAAACAGAATGTGTAACAGCATCATTACGTAGTT
NTAATGCATTCACTACAAGTTGACCTAATGTTACACGTATTCCGGGTAGTTGAGTGAAAG
CATTAAATCCCGCTTTTGATGCTACCAGTCGACGTAATGCATNNGAATGTGCTTCATTTA
AAATTAACTCGTATAGTATATTATTAGTAGTAGAAGTAGTAATACTATCAGTAGTCCATG
GTAAGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case