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Schistosoma mansoni
cluster # 3722 cluster # 3722       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3722#0 length = 929 sequences # 2  

consensusID : consensus_3722#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 929
fasta sequence
                              [AATAACCAATTCAATATAAGATCAACACATACATTCACCGGACGTTTAATTGAACCAATTAGATAATGCTTTCTACGTCTCATTGTATTTCGTCGACCACGATTAATACTACTCATATCTTTATTGTTATTATAATTGTTAACTTGCATAATTGTGCATACAGGTAGACTAGAACTTCGATTATCTTCACTTAATGTATTTTCATTTTCTATTGTATGACTGCATGGATCACGAACAGGAGTTTTAGTCAATTTTCTACTATTTTCAGGTTCAGCTGATGGGGAAGAAAATAATGTTGATTTACTCGGGCGTGATGTTGAAGATGAACGTAGAAAACTTCCCATACAATTTCTTGAATGATTTTGAGATTCAATTGTACTTGATTTTAATTCACAATCGGAAGGTCGTGAACCTGGTAGTGTTGAATAACGTTCATTAATACCATCCTTCAAGTTGGAATTAGAACCATGAGTGTTATTTAGACATGATTCATTTACTTTCGAATTATCTGCATCGACTCCAGAACTATGTCCATAAGAACTATCAGTTGTAGGTTTTTGATTATGATTATTTAATCCGTACAAAGTTCTTGTATGATTAAACAATTGAAGTAAATAATCAATAATTTGAGGTACACTGATCATACGATCAAATGGATCAGTTGTTTGTTGACCAAGCATAGGATTACTTAGTGTTTGTGAATGACCAATATGTTTCANACATTCGGNNCACATCGAGATGCTTATCGAATCAAAACATATTCTTTNTGTAACGCCGTAGTTNTAACCAGTTCGATAGTCAGAGAATCGTACAGTATTAAACTGTTTCATAGATTTCATTAGATCACATAAAATTGGATGATCCCATTGAGTCTCCTGAGGTTCGTGATTTTTATTATATGGAACTTGTGTACCAGGATGGATGAACAC]

[+] EMBL CD170840             [AATAACCAATTCAATATAAGATCAACACATACATTCACCGGACGTTTAATTGAACCAATTAGATAATGCTTTCTACGTCTCATTGTATTTCGTCGACCACGATTAATACTACTCATATCTTTATTGTTATTATAATTGTTAACTTGCATAATTGTGCATACAGGTAGACTAGAACTTCGATTATCTTCACTTAATGTATTTTCATTTTCTATTGTATGACTGCATGGATCACGAACAGGAGTTTTAGTCAATTTTCTACTATTTTCAGGTTCAGCTGATGGGGAAGAAAATAATGTTGATTTACTCGGGCGTGATGTTGAAGATGAACGTAGAAAACTTCCCATACAATTTCTTGAATGATTTTGAGATTCAATTGTACTTGATTTTAATTCACAATCGGAAGGTCGTGAACCTGGTAGTGTTGAATAACGTTCATTAATACCATCCTTCAAGTTGGAATTAGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD202479             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGCGTGATGTTGAAGATGAACGTAGAAAACTTCCCATACAATTTCTTGAATGATTTTGAGATTCAATTGTACTTGATTTTAATTCACAATCGGAAGGTCGTGAACCTGGTAGTGTTGAATAACGTTCATTAATACCATCCTTCAAGTTGGAATTAGAACCATGAGTGTTATTTAGACATGATTCATTTACTTTCGAATTATCTGCATCGACTCCAGAACTATGTCCATAAGAACTATCAGTTGTAGGTTTTTGATTATGATTATTTAATCCGTACAAAGTTCTTGTATGATTAAACAATTGAAGTAAATAATCAATAATTTGAGGTACACTGATCATACGATCAAATGGATCAGTTGTTTGTTGACCAAGCATAGGATTACTTAGTGTTTGTGAATGACCAATATGTTTCANACATTCGGNNCACATCGAGATGCTTATCGAATCAAAACATATTCTTTNTGTAACGCCGTAGTTNTAACCAGTTCGATAGTCAGAGAATCGTACAGTATTAAACTGTTTCATAGATTTCATTAGATCACATAAAATTGGATGATCCCATTGAGTCTCCTGAGGTTCGTGATTTTTATTATATGGAACTTGTGTACCAGGATGGATGAACAC]


>consensus_3722#0 AATAACCAATTCAATATAAGATCAACACATACATTCACCGGACGTTTAATTGAACCAATT AGATAATGCTTTCTACGTCTCATTGTATTTCGTCGACCACGATTAATACTACTCATATCT TTATTGTTATTATAATTGTTAACTTGCATAATTGTGCATACAGGTAGACTAGAACTTCGA TTATCTTCACTTAATGTATTTTCATTTTCTATTGTATGACTGCATGGATCACGAACAGGA GTTTTAGTCAATTTTCTACTATTTTCAGGTTCAGCTGATGGGGAAGAAAATAATGTTGAT TTACTCGGGCGTGATGTTGAAGATGAACGTAGAAAACTTCCCATACAATTTCTTGAATGA TTTTGAGATTCAATTGTACTTGATTTTAATTCACAATCGGAAGGTCGTGAACCTGGTAGT GTTGAATAACGTTCATTAATACCATCCTTCAAGTTGGAATTAGAACCATGAGTGTTATTT AGACATGATTCATTTACTTTCGAATTATCTGCATCGACTCCAGAACTATGTCCATAAGAA CTATCAGTTGTAGGTTTTTGATTATGATTATTTAATCCGTACAAAGTTCTTGTATGATTA AACAATTGAAGTAAATAATCAATAATTTGAGGTACACTGATCATACGATCAAATGGATCA GTTGTTTGTTGACCAAGCATAGGATTACTTAGTGTTTGTGAATGACCAATATGTTTCANA CATTCGGNNCACATCGAGATGCTTATCGAATCAAAACATATTCTTTNTGTAACGCCGTAG TTNTAACCAGTTCGATAGTCAGAGAATCGTACAGTATTAAACTGTTTCATAGATTTCATT AGATCACATAAAATTGGATGATCCCATTGAGTCTCCTGAGGTTCGTGATTTTTATTATAT GGAACTTGTGTACCAGGATGGATGAACAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)