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Schistosoma mansoni
cluster # 3745 cluster # 3745       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3745#0 length = 533 sequences # 2  

consensusID : consensus_3745#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 533
fasta sequence
                              [GGCATAGGAAATGTTATAGAAACAGTTCTGACATCGTCAGGTGTATCCTTAGAAAATGTCCGTGTTGTTTCAAATTTTATGGACTTCAATCCTGAAGGTCGTTTAGTTGGGTTTCAAGATCCTGTTATTCATTCTCTTAATAAAGTGTATAATGTAATACAAAATTCTGAATATTTTGAAACCGTTCTGTCGAAAAGAATTTGTATTCTACTTGTTGGTGATTCAACTAGTGATGCAAAGATGATTGATGATATGGAAAAATTTTCTTATGAACAAGTTATAGTTATTCGTATAGGATTTTTAAATGAAAAAAATGACAAAAAAGTGGAATTATTCAGTTCATTATACGATCTGGTTCTTTTAAATGACGAAACATTTGATATTCCTTTGTTCATTTTATCATCTATTGTTAATTCTAATGAACTATGTAAACATGAGAGCAGCAATAAGACCTCAAATATCCGATAGTAATACTTTTAAAGAGTTGGTTATTTTGACAAAAATTTGTTCTAATTATTTAAATAAAAAAACAA]

[+] EMBL CD078823             [GGCATAGGAAATGTTATAGAAACAGTTCTGACATCGTCAGGTGTATCCTTAGAAAATGTCCGTGTTGTTTCAAATTTTATGGACTTCAATCCTGAAGGTCGTTTAGTTGGGTTTCAAGATCCTGTTATTCATTCTCTTAATAAAGTGTATAATGTAATACAAAATTCTGAATATTTTGAAACCGTTCTGTCGAAAAGAATTTGTATTCTACTTGTTGGTGATTCAACTAGTGATGCAAAGATGATTGATGATATGGAAAAATTTTCTTATGAACAAGTTATAGTTATTCGTATAGGATTTTTAAATGAAAAAAATGACAAAAAAGTGGAATTATTCAGTTCATTATACGATCTGGTTCTTTTAAATGACGAAACATTTGATATTCCTTTGTTCATTTTATCATCTATTGTTAATTCTAATGAACTATGTAAACATGAGAGCAGCAATAAGACCTCAAATATCCGATAGTAATACTTTTAAAGAGTTGGTTATTTTGACAAAAATTTGTTCTAATTATTTAAATAAAAAAACA ]
[-] EMBL CD073283             [ GCATAGGAAATGTTATAGAAACAGTTCTGACATCGTCAGGTGTATCCTTAGAAAATGTCCGTGTTGTTTCAAATTTTATGGACTTCAATCCTGAAGGTCGTTTAGTTGGGTTTCAAGATCCTGTTATTCATTCTCTTAATAAAGTGTATAATGTAATACAAAATTCTGAATATTTTGAAACCGTTCTGTCGAAAAGAATTTGTATTCTACTTGTTGGTGATTCAACTAGTGATGCAAAGATGATTGATGATATGGAAAAATTTTCTTATGAACAAGTTATAGTTATTCGTATAGGATTTTTAAATGAAAAAAATGACAAAAAAGTGGAATTATTCAGTTCATTATACGATCTGGTTCTTTTAAATGACGAAACATTTGATATTCCTTTGTTCATTTTATCATCTATTGTTAATTCTAATGAACTATGTAAACATGAGAGCAGCAATAAGACCTCAAATATCCGATAGTAATACTTTTAAAGAGTTGGTTATTTTGACAAAAATTTGTTCTAATTATTTAAATAAAAAAACAA]


>consensus_3745#0 GGCATAGGAAATGTTATAGAAACAGTTCTGACATCGTCAGGTGTATCCTTAGAAAATGTC CGTGTTGTTTCAAATTTTATGGACTTCAATCCTGAAGGTCGTTTAGTTGGGTTTCAAGAT CCTGTTATTCATTCTCTTAATAAAGTGTATAATGTAATACAAAATTCTGAATATTTTGAA ACCGTTCTGTCGAAAAGAATTTGTATTCTACTTGTTGGTGATTCAACTAGTGATGCAAAG ATGATTGATGATATGGAAAAATTTTCTTATGAACAAGTTATAGTTATTCGTATAGGATTT TTAAATGAAAAAAATGACAAAAAAGTGGAATTATTCAGTTCATTATACGATCTGGTTCTT TTAAATGACGAAACATTTGATATTCCTTTGTTCATTTTATCATCTATTGTTAATTCTAAT GAACTATGTAAACATGAGAGCAGCAATAAGACCTCAAATATCCGATAGTAATACTTTTAA AGAGTTGGTTATTTTGACAAAAATTTGTTCTAATTATTTAAATAAAAAAACAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)