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Schistosoma mansoni
cluster # 3747 cluster # 3747       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3747#0 length = 1838 sequences # 2  

consensusID : consensus_3747#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1838
fasta sequence
                              [TTTAGATAATGAGCTTAGGTGACGCCTATGCAAAAGATGTGACCAATTTCTATTTGTCTGTATTTAATAAACTAGAATCAACAAGTATTAATGTTTTAGCATACTAATATTCACGGCATTATGTATACTAGAGAGAAACAATAATCGTTGTTCTTTTAGAGATTTTATTTTCAATCTTAATTATTCATTTATTTACAGATAAATAACTCATAGTAATGTACTTTTGATTGAATCTTATATCAATGAAGTTCGCATTTAGGAATAGCTTGGATTAACCAATTTTATCACTATGAGATCTATAGACAGCTTTTTTTTCATAACAATTAATTTTTACATATAAAGTGCCTAGAGAATATTATAAATTTTAATTACAACGGTCATCATGAAACAAAACCTAACATTTGCTACTCTTTGGCCAGATGATAATGATTTTGCGTCAATCGTTCATTCACATTGGCATAAATTTATTCAACCTGATCCATTGTATTATTATCTAGTAGGAATTTATATTGGTATTGTTGGCATATTAGCAGTAATGGGAAATTCTTTGGTAATTACATTATTTCTTTTATGTAAACAATTACGAACACCACCAAATATGCTTATAGTTAGTTTAGCTATCTCTGATTTTTCTTTTGCACTTATCAATGGTTTCCCATTAAAAACAATCGCTGCATTTAATCACCGTTGGGGATGGGGTAAATTGGCTTGTGAGCTGTATGGATTTGCTGGTTCAATATTTGGATTTATTTCATTAACAACAATGGCCTTCATTGCTTTGGACAGATATTTAGTAATTGTACAACCTTTTGAAACATTTTCTCGTATCACTTACGGGAAAGTTATAGTTATGATTTTTATCACTTGG-ATCTGGTCAGCATTGTGGTCAATTCCACCATTTTTCGGTTATGGAAGTTATATACCCGAAGGTTTTCATACATCTTGTACTTTCGACTACCTATCAACTGACTTACCGAACTTAATATTTAATGCA-GGATTATACATATTGGGATTTCTTTGTCCTGTATTTATTATAATCTTCAGTTATTATCAAATTGTTAAAACAGTTAGACTCAATGAATTAGAATTAATGAAAATGGCACAATCATTAGATTTACAAAATCCATCGGCTATGAAAACAGGTGATAAGAAAGCAGATATTGAAGCAGCTAAAACGTCTATTATTCTTGTTCTTCTCTATTTAATGTCATGGTCTCCATATGCCATTGTTTGTTTAATGACACTGATTGGAAGTAGAGATTCGTTAACTCCATTCCACTCTGAACTCCCTGTGCTATTTGCAAAAACATCTGCTGTATACAATCCTATTGTATATGCAGTCAAACATCCTAAATTTCGTATGGAAATCGAAAAACGTTTTCCATTTCTTATTTGTTGTTGCCCACCTAAACCAAAGGAGCGATTGCAAAATACAATAGTATCAAAAATTCAAGTTTCACAGATTGGAATTGGTACCGTCAGCGGGGGTAATGAAAATACGTTGAACACAGTAAAACGAGAAGATTAACAAACGTTGGAATTTTATGACGGCCACACTAAAGTGAACCTACGAAAACTGACATAAAGCATAAAATAATTAGAATGAGGGAAACTATAGTATCTCACTATATAACGAGTCATTATTAAAAGATGAATATTTATCTGATATTATCATTTCTGTTTAGTATTTACTTCATTAACTAATAGCAGTGACCATTTTACTTTACCTCTTTAAATTAGTTTACGTTTCAACACTAATCTAATTATCATCTGTTGATGTATTTGGTTTATTCATATATTTGTTTATGTATAACATGTTAATTGTTAGATTCAAAAAA]

[+] EMBL AF155134             [TTTAGATAATGAGCTTAGGTGACGCCTATGCAAAAGATGTGACCAATTTCTATTTGTCTGTATTTAATAAACTAGAATCAACAAGTATTAATGTTTTAGCATACTAATATTCACGGCATTATGTATACTAGAGAGAAACAATAATCGTTGTTCTTTTAGAGATTTTATTTTCAATCTTAATTATTCATTTATTTACAGATAAATAACTCATAGTAATGTACTTTTGATTGAATCTTATATCAATGAAGTTCGCATTTAGGAATAGCTTGGATTAACCAATTTTATCACTATGAGATCTATAGACAGCTTTTTTTTCATAACAATTAATTTTTACATATAAAGTGCCTAGAGAATATTATAAATTTTAATTACAACGGTCATCATGAAACAAAACCTAACATTTGCTACTCTTTGGCCAGATGATAATGATTTTGCGTCAATCGTTCATTCACATTGGCATAAATTTATTCAACCTGATCCATTGTATTATTATCTAGTAGGAATTTATATTGGTATTGTTGGCATATTAGCAGTAATGGGAAATTCTTTGGTAATTACATTATTTCTTTTATGTAAACAATTACGAACACCACCAAATATGCTTATAGTTAGTTTAGCTATCTCTGATTTTTCTTTTGCACTTATCAATGGTTTCCCATTAAAAACAATCGCTGCATTTAATCACCGTTGGGGATGGGGTAAATTGGCTTGTGAGCTGTATGGATTTGCTGGTTCAATATTTGGATTTATTTCATTAACAACAATGGCCTTCATTGCTTTGGACAGATATTTAGTAATTGTACAACCTTTTGAAACATTTTCTCGTATCACTTACGGGAAAGTTATAGTTATGATTTTTATCACTTGG ATCTGGTCAGCATTGTGGTCAATTCCACCATTTTTCGGTTATGGAAGTTATATACCCGAAGGTTTTCATACATCTTGTACTTTCGACTACCTATCAACTGACTTACCGAACTTAATATTTAATGCA GGATTATACATATTGGGATTTCTTTGTCCTGTATTTATTATAATCTTCAGTTATTATCAAATTGTTAAAACAGTTAGACTCAATGAATTAGAATTAATGAAAATGGCACAATCATTAGATTTACAAAATCCATCGGCTATGAAAACAGGTGATAAGAAAGCAGATATTGAAGCAGCTAAAACGTCTATTATTCTTGTTCTTCTCTATTTAATGTCATGGTCTCCATATGCCATTGTTTGTTTAATGACACTGATTGGAAGTAGAGATTCGTTAACTCCATTCCACTCTGAACTCCCTGTGCTATTTGCAAAAACATCTGCTGTATACAATCCTATTGTATATGCAGTCAAACATCCTAAATTTCGTATGGAAATCGAAAAACGTTTTCCATTTCTTATTTGTTGTTGCCCACCTAAACCAAAGGAGCGATTGCAAAATACAATAGTATCAAAAATTCAAGTTTCACAGATTGGAATTGGTACCGTCAGCGGGGGTAATGAAAATACGTTGAACACAGTAAAACGAGAAGATTAACAAACGTTGGAATTTTATGACGGCCACACTAAAGTGAACCTACGAAAACTGACATAAAGCATAAAATAATTAGAATGAGGGAAACTATAGTATCTCACTATATAACGAGTCATTATTAAAAGATGAATATTTATCTGATATTATCATTTCTGTTTAGTATTTACTTCATTAACTAATAGCAGTGACCATTTTACTTTACCTCTTTAAATTAGTTTACGTTTCAACACTAATCTAATTATCATCTGTTGATGTATTTGGTTTATTCATATATTTGTTTATGTATAACATGTTAATTGTTAGATTCAAAAAA]
[+] EMBL AA559680             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCTGTATGGATTTGCTGGTTCAATATTTGGATTTATTTCATTAACAACAATGGCCTTCATTGCTTTGGACAGATATTTAGTAATTGTACAACCTTTTGAAACATTTTCTCGTATCACTTACGGGAAAGTTATAGTTATGATTTTTATCACATGGAATCTGGTCAGCATTGTGGTCAATNCCACCATTTTTCGGTTATGGAAGTTATATACCCGAAGGTTTTCATACATCTTGTACTTTCGACTACCTATCAACTGACTTACCGAACTTAATATTTAATGCAGGGATTATACATATTGGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]


>consensus_3747#0 TTTAGATAATGAGCTTAGGTGACGCCTATGCAAAAGATGTGACCAATTTCTATTTGTCTG TATTTAATAAACTAGAATCAACAAGTATTAATGTTTTAGCATACTAATATTCACGGCATT ATGTATACTAGAGAGAAACAATAATCGTTGTTCTTTTAGAGATTTTATTTTCAATCTTAA TTATTCATTTATTTACAGATAAATAACTCATAGTAATGTACTTTTGATTGAATCTTATAT CAATGAAGTTCGCATTTAGGAATAGCTTGGATTAACCAATTTTATCACTATGAGATCTAT AGACAGCTTTTTTTTCATAACAATTAATTTTTACATATAAAGTGCCTAGAGAATATTATA AATTTTAATTACAACGGTCATCATGAAACAAAACCTAACATTTGCTACTCTTTGGCCAGA TGATAATGATTTTGCGTCAATCGTTCATTCACATTGGCATAAATTTATTCAACCTGATCC ATTGTATTATTATCTAGTAGGAATTTATATTGGTATTGTTGGCATATTAGCAGTAATGGG AAATTCTTTGGTAATTACATTATTTCTTTTATGTAAACAATTACGAACACCACCAAATAT GCTTATAGTTAGTTTAGCTATCTCTGATTTTTCTTTTGCACTTATCAATGGTTTCCCATT AAAAACAATCGCTGCATTTAATCACCGTTGGGGATGGGGTAAATTGGCTTGTGAGCTGTA TGGATTTGCTGGTTCAATATTTGGATTTATTTCATTAACAACAATGGCCTTCATTGCTTT GGACAGATATTTAGTAATTGTACAACCTTTTGAAACATTTTCTCGTATCACTTACGGGAA AGTTATAGTTATGATTTTTATCACTTGGATCTGGTCAGCATTGTGGTCAATTCCACCATT TTTCGGTTATGGAAGTTATATACCCGAAGGTTTTCATACATCTTGTACTTTCGACTACCT ATCAACTGACTTACCGAACTTAATATTTAATGCAGGATTATACATATTGGGATTTCTTTG TCCTGTATTTATTATAATCTTCAGTTATTATCAAATTGTTAAAACAGTTAGACTCAATGA ATTAGAATTAATGAAAATGGCACAATCATTAGATTTACAAAATCCATCGGCTATGAAAAC AGGTGATAAGAAAGCAGATATTGAAGCAGCTAAAACGTCTATTATTCTTGTTCTTCTCTA TTTAATGTCATGGTCTCCATATGCCATTGTTTGTTTAATGACACTGATTGGAAGTAGAGA TTCGTTAACTCCATTCCACTCTGAACTCCCTGTGCTATTTGCAAAAACATCTGCTGTATA CAATCCTATTGTATATGCAGTCAAACATCCTAAATTTCGTATGGAAATCGAAAAACGTTT TCCATTTCTTATTTGTTGTTGCCCACCTAAACCAAAGGAGCGATTGCAAAATACAATAGT ATCAAAAATTCAAGTTTCACAGATTGGAATTGGTACCGTCAGCGGGGGTAATGAAAATAC GTTGAACACAGTAAAACGAGAAGATTAACAAACGTTGGAATTTTATGACGGCCACACTAA AGTGAACCTACGAAAACTGACATAAAGCATAAAATAATTAGAATGAGGGAAACTATAGTA TCTCACTATATAACGAGTCATTATTAAAAGATGAATATTTATCTGATATTATCATTTCTG TTTAGTATTTACTTCATTAACTAATAGCAGTGACCATTTTACTTTACCTCTTTAAATTAG TTTACGTTTCAACACTAATCTAATTATCATCTGTTGATGTATTTGGTTTATTCATATATT TGTTTATGTATAACATGTTAATTGTTAGATTCAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)