cluster # 3747

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Schistosoma mansoni
cluster # 3747 cluster # 3747 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3747#0 length = 1838 sequences # 2
consensusID : consensus_3747#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1838
fasta sequence
                              [TTTAGATAATGAGCTTAGGTGACGCCTATGCAAAAGATGTGACCAATTTCTATTTGTCTGTATTTAATAAACTAGAATCAACAAGTATTAATGTTTTAGCATACTAATATTCACGGCATTATGTATACTAGAGAGAAACAATAATCGTTGTTCTTTTAGAGATTTTATTTTCAATCTTAATTATTCATTTATTTACAGATAAATAACTCATAGTAATGTACTTTTGATTGAATCTTATATCAATGAAGTTCGCATTTAGGAATAGCTTGGATTAACCAATTTTATCACTATGAGATCTATAGACAGCTTTTTTTTCATAACAATTAATTTTTACATATAAAGTGCCTAGAGAATATTATAAATTTTAATTACAACGGTCATCATGAAACAAAACCTAACATTTGCTACTCTTTGGCCAGATGATAATGATTTTGCGTCAATCGTTCATTCACATTGGCATAAATTTATTCAACCTGATCCATTGTATTATTATCTAGTAGGAATTTATATTGGTATTGTTGGCATATTAGCAGTAATGGGAAATTCTTTGGTAATTACATTATTTCTTTTATGTAAACAATTACGAACACCACCAAATATGCTTATAGTTAGTTTAGCTATCTCTGATTTTTCTTTTGCACTTATCAATGGTTTCCCATTAAAAACAATCGCTGCATTTAATCACCGTTGGGGATGGGGTAAATTGGCTTGTGAGCTGTATGGATTTGCTGGTTCAATATTTGGATTTATTTCATTAACAACAATGGCCTTCATTGCTTTGGACAGATATTTAGTAATTGTACAACCTTTTGAAACATTTTCTCGTATCACTTACGGGAAAGTTATAGTTATGATTTTTATCACTTGG-ATCTGGTCAGCATTGTGGTCAATTCCACCATTTTTCGGTTATGGAAGTTATATACCCGAAGGTTTTCATACATCTTGTACTTTCGACTACCTATCAACTGACTTACCGAACTTAATATTTAATGCA-GGATTATACATATTGGGATTTCTTTGTCCTGTATTTATTATAATCTTCAGTTATTATCAAATTGTTAAAACAGTTAGACTCAATGAATTAGAATTAATGAAAATGGCACAATCATTAGATTTACAAAATCCATCGGCTATGAAAACAGGTGATAAGAAAGCAGATATTGAAGCAGCTAAAACGTCTATTATTCTTGTTCTTCTCTATTTAATGTCATGGTCTCCATATGCCATTGTTTGTTTAATGACACTGATTGGAAGTAGAGATTCGTTAACTCCATTCCACTCTGAACTCCCTGTGCTATTTGCAAAAACATCTGCTGTATACAATCCTATTGTATATGCAGTCAAACATCCTAAATTTCGTATGGAAATCGAAAAACGTTTTCCATTTCTTATTTGTTGTTGCCCACCTAAACCAAAGGAGCGATTGCAAAATACAATAGTATCAAAAATTCAAGTTTCACAGATTGGAATTGGTACCGTCAGCGGGGGTAATGAAAATACGTTGAACACAGTAAAACGAGAAGATTAACAAACGTTGGAATTTTATGACGGCCACACTAAAGTGAACCTACGAAAACTGACATAAAGCATAAAATAATTAGAATGAGGGAAACTATAGTATCTCACTATATAACGAGTCATTATTAAAAGATGAATATTTATCTGATATTATCATTTCTGTTTAGTATTTACTTCATTAACTAATAGCAGTGACCATTTTACTTTACCTCTTTAAATTAGTTTACGTTTCAACACTAATCTAATTATCATCTGTTGATGTATTTGGTTTATTCATATATTTGTTTATGTATAACATGTTAATTGTTAGATTCAAAAAA]

[+] EMBL AF155134             [TTTAGATAATGAGCTTAGGTGACGCCTATGCAAAAGATGTGACCAATTTCTATTTGTCTGTATTTAATAAACTAGAATCAACAAGTATTAATGTTTTAGCATACTAATATTCACGGCATTATGTATACTAGAGAGAAACAATAATCGTTGTTCTTTTAGAGATTTTATTTTCAATCTTAATTATTCATTTATTTACAGATAAATAACTCATAGTAATGTACTTTTGATTGAATCTTATATCAATGAAGTTCGCATTTAGGAATAGCTTGGATTAACCAATTTTATCACTATGAGATCTATAGACAGCTTTTTTTTCATAACAATTAATTTTTACATATAAAGTGCCTAGAGAATATTATAAATTTTAATTACAACGGTCATCATGAAACAAAACCTAACATTTGCTACTCTTTGGCCAGATGATAATGATTTTGCGTCAATCGTTCATTCACATTGGCATAAATTTATTCAACCTGATCCATTGTATTATTATCTAGTAGGAATTTATATTGGTATTGTTGGCATATTAGCAGTAATGGGAAATTCTTTGGTAATTACATTATTTCTTTTATGTAAACAATTACGAACACCACCAAATATGCTTATAGTTAGTTTAGCTATCTCTGATTTTTCTTTTGCACTTATCAATGGTTTCCCATTAAAAACAATCGCTGCATTTAATCACCGTTGGGGATGGGGTAAATTGGCTTGTGAGCTGTATGGATTTGCTGGTTCAATATTTGGATTTATTTCATTAACAACAATGGCCTTCATTGCTTTGGACAGATATTTAGTAATTGTACAACCTTTTGAAACATTTTCTCGTATCACTTACGGGAAAGTTATAGTTATGATTTTTATCACTTGG ATCTGGTCAGCATTGTGGTCAATTCCACCATTTTTCGGTTATGGAAGTTATATACCCGAAGGTTTTCATACATCTTGTACTTTCGACTACCTATCAACTGACTTACCGAACTTAATATTTAATGCA GGATTATACATATTGGGATTTCTTTGTCCTGTATTTATTATAATCTTCAGTTATTATCAAATTGTTAAAACAGTTAGACTCAATGAATTAGAATTAATGAAAATGGCACAATCATTAGATTTACAAAATCCATCGGCTATGAAAACAGGTGATAAGAAAGCAGATATTGAAGCAGCTAAAACGTCTATTATTCTTGTTCTTCTCTATTTAATGTCATGGTCTCCATATGCCATTGTTTGTTTAATGACACTGATTGGAAGTAGAGATTCGTTAACTCCATTCCACTCTGAACTCCCTGTGCTATTTGCAAAAACATCTGCTGTATACAATCCTATTGTATATGCAGTCAAACATCCTAAATTTCGTATGGAAATCGAAAAACGTTTTCCATTTCTTATTTGTTGTTGCCCACCTAAACCAAAGGAGCGATTGCAAAATACAATAGTATCAAAAATTCAAGTTTCACAGATTGGAATTGGTACCGTCAGCGGGGGTAATGAAAATACGTTGAACACAGTAAAACGAGAAGATTAACAAACGTTGGAATTTTATGACGGCCACACTAAAGTGAACCTACGAAAACTGACATAAAGCATAAAATAATTAGAATGAGGGAAACTATAGTATCTCACTATATAACGAGTCATTATTAAAAGATGAATATTTATCTGATATTATCATTTCTGTTTAGTATTTACTTCATTAACTAATAGCAGTGACCATTTTACTTTACCTCTTTAAATTAGTTTACGTTTCAACACTAATCTAATTATCATCTGTTGATGTATTTGGTTTATTCATATATTTGTTTATGTATAACATGTTAATTGTTAGATTCAAAAAA]
[+] EMBL AA559680             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCTGTATGGATTTGCTGGTTCAATATTTGGATTTATTTCATTAACAACAATGGCCTTCATTGCTTTGGACAGATATTTAGTAATTGTACAACCTTTTGAAACATTTTCTCGTATCACTTACGGGAAAGTTATAGTTATGATTTTTATCACATGGAATCTGGTCAGCATTGTGGTCAATNCCACCATTTTTCGGTTATGGAAGTTATATACCCGAAGGTTTTCATACATCTTGTACTTTCGACTACCTATCAACTGACTTACCGAACTTAATATTTAATGCAGGGATTATACATATTGGGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]




>consensus_3747#0
TTTAGATAATGAGCTTAGGTGACGCCTATGCAAAAGATGTGACCAATTTCTATTTGTCTG
TATTTAATAAACTAGAATCAACAAGTATTAATGTTTTAGCATACTAATATTCACGGCATT
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TTATTCATTTATTTACAGATAAATAACTCATAGTAATGTACTTTTGATTGAATCTTATAT
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AGACAGCTTTTTTTTCATAACAATTAATTTTTACATATAAAGTGCCTAGAGAATATTATA
AATTTTAATTACAACGGTCATCATGAAACAAAACCTAACATTTGCTACTCTTTGGCCAGA
TGATAATGATTTTGCGTCAATCGTTCATTCACATTGGCATAAATTTATTCAACCTGATCC
ATTGTATTATTATCTAGTAGGAATTTATATTGGTATTGTTGGCATATTAGCAGTAATGGG
AAATTCTTTGGTAATTACATTATTTCTTTTATGTAAACAATTACGAACACCACCAAATAT
GCTTATAGTTAGTTTAGCTATCTCTGATTTTTCTTTTGCACTTATCAATGGTTTCCCATT
AAAAACAATCGCTGCATTTAATCACCGTTGGGGATGGGGTAAATTGGCTTGTGAGCTGTA
TGGATTTGCTGGTTCAATATTTGGATTTATTTCATTAACAACAATGGCCTTCATTGCTTT
GGACAGATATTTAGTAATTGTACAACCTTTTGAAACATTTTCTCGTATCACTTACGGGAA
AGTTATAGTTATGATTTTTATCACTTGGATCTGGTCAGCATTGTGGTCAATTCCACCATT
TTTCGGTTATGGAAGTTATATACCCGAAGGTTTTCATACATCTTGTACTTTCGACTACCT
ATCAACTGACTTACCGAACTTAATATTTAATGCAGGATTATACATATTGGGATTTCTTTG
TCCTGTATTTATTATAATCTTCAGTTATTATCAAATTGTTAAAACAGTTAGACTCAATGA
ATTAGAATTAATGAAAATGGCACAATCATTAGATTTACAAAATCCATCGGCTATGAAAAC
AGGTGATAAGAAAGCAGATATTGAAGCAGCTAAAACGTCTATTATTCTTGTTCTTCTCTA
TTTAATGTCATGGTCTCCATATGCCATTGTTTGTTTAATGACACTGATTGGAAGTAGAGA
TTCGTTAACTCCATTCCACTCTGAACTCCCTGTGCTATTTGCAAAAACATCTGCTGTATA
CAATCCTATTGTATATGCAGTCAAACATCCTAAATTTCGTATGGAAATCGAAAAACGTTT
TCCATTTCTTATTTGTTGTTGCCCACCTAAACCAAAGGAGCGATTGCAAAATACAATAGT
ATCAAAAATTCAAGTTTCACAGATTGGAATTGGTACCGTCAGCGGGGGTAATGAAAATAC
GTTGAACACAGTAAAACGAGAAGATTAACAAACGTTGGAATTTTATGACGGCCACACTAA
AGTGAACCTACGAAAACTGACATAAAGCATAAAATAATTAGAATGAGGGAAACTATAGTA
TCTCACTATATAACGAGTCATTATTAAAAGATGAATATTTATCTGATATTATCATTTCTG
TTTAGTATTTACTTCATTAACTAATAGCAGTGACCATTTTACTTTACCTCTTTAAATTAG
TTTACGTTTCAACACTAATCTAATTATCATCTGTTGATGTATTTGGTTTATTCATATATT
TGTTTATGTATAACATGTTAATTGTTAGATTCAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case