cluster # 3803

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Schistosoma mansoni
cluster # 3803 cluster # 3803 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3803#0 length = 853 sequences # 2

consensusID : consensus_3803#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 853
fasta sequence

                              [CAGGTTTATTCAATATGCATAATTATGATGATCGAGTTACTTTTTTAAATGTAAATAAATAAAAAAATATAGTGAAATATGGCAACATTCAAGCAAAACTATTTTGATCACTTTAATTGTATAAACACTTTTCAAGCGCTAATACCGATCGAATTGTTTAAGAAACAACGACAACAAGTATTTCCGCTTATATAGATTCAAGCGTAACGTTTATAGTATATTTATTTGTAAACGGAAGTTTTGATGTTTTTGACCGATGATAACCAGTAGGAAACAATCTTGATTGTCTTCAAGTGGTTCCAGATATAATGAGTCAGTACCTTCTGTGTACATGGTTCTGCCACCTTATGCTTTAAATCGAAAATTTAAGAGCTCTTTCATCACGTGAAAATTGACTCGCGTTGTTGAACTGACTGAAAATTCCGTAGAACTTAATTATTTTCAATTGATAAAAGTTTATCTGTATCAAAATTTATTTTGCGATATAAGTCAATCAATCATACATGGGTAGTATGAAACTTTGTATGGACAATATACCATAAGCCTTATTTCAGTTAACCACTTTAAGCCGTTCTCTAAAAGTCTCATTGTATCAATGATTTCGGTTACTATACACCACGGGATGATCCGAAAATAGGGTTGGAGAGTATTATGTAGTTTTCTTAAGACTAGTGAGACTGTTTATATTAATTTCTCTACTGATCAAAAAATAACCATAATGTGCTGTATCGCCCATACTAATTCATCGTAATTATCGTGAGGATCTGTCACTAAGACTAGTTTTACGATATCATGATCACGCTGCAGTCCACTAACTTAATATTTCTCGACAATATTTTGGCGAATAGATCTC]

[+] EMBL AI977343             [CAGGTTTATTCAATATGCATAATTATGATGATCGAGTTACTTTTTTAAATGTAAATAAATAAAAAAATATAGTGAAATATGGCAACATTCAAGCAAAACTATTTTGATCACTTTAATTGTATAAACACTTTTCAAGCGCTAATACCGATCGAATTGTTTAAGAAACAACGACAACAAGTATTTCCGCTTATATAGATTCAAGCGTAACGTTTATAGTATATTTATTTGTAAACGGAAGTTTTGATGTTTTTGACCGATGATAACCAGTAGGAAACAATCTTGATTGTCTTCAAGTGGTTCCAGATATAATGAGTCAGTACCTTCTGTGTACATGGTTCTGCCACCTTATGCTTTAAATCGAAAATTTAAGAGCTCTTTCATCACGTGAAAATTGACTCGCGTTGTTGAACTGACTGAAAATTCCGTAGAACTTAATTATTTTCAATTGATAAAAGTTTATCTGTATCAAAATTTATTTTGCGATATAAGTCAATCAATCATACATGGGTAGTATGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD135484             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGAACTGACTGAAAATTCCGTAGAACTTAATTATTTTCAAGTGATAAAAGTTTATCTGTATCAAAATTTATTTTGCGATATAAGTTAATCAATCATACATGGGTAGTATGAAACTTTGTATGGACAATATACCATAAGCCTTATTTCAGTTAACCACTTTAAGCCGTTCTCTAAAAGTCTCATTGTATCAATGATTTCGGTTACTATACACCACGGGATGATCCGAAAATAGGGTTGGAGAGTATTATGTAGTTTTCTTAAGACTAGTGAGACTGTTTATATTAATTTCTCTACTGATCAAAAAATAACCATAATGTGCTGTATCGCCCATACTAATTCATCGTAATTATCGTGAGGATCTGTCACTAAGACTAGTTTTACGATATCATGATCACGCTGCAGTCCACTAACTTAATATTTCTCGACAATATTTTGGCGAATAGATCTC]




>consensus_3803#0
CAGGTTTATTCAATATGCATAATTATGATGATCGAGTTACTTTTTTAAATGTAAATAAAT
AAAAAAATATAGTGAAATATGGCAACATTCAAGCAAAACTATTTTGATCACTTTAATTGT
ATAAACACTTTTCAAGCGCTAATACCGATCGAATTGTTTAAGAAACAACGACAACAAGTA
TTTCCGCTTATATAGATTCAAGCGTAACGTTTATAGTATATTTATTTGTAAACGGAAGTT
TTGATGTTTTTGACCGATGATAACCAGTAGGAAACAATCTTGATTGTCTTCAAGTGGTTC
CAGATATAATGAGTCAGTACCTTCTGTGTACATGGTTCTGCCACCTTATGCTTTAAATCG
AAAATTTAAGAGCTCTTTCATCACGTGAAAATTGACTCGCGTTGTTGAACTGACTGAAAA
TTCCGTAGAACTTAATTATTTTCAATTGATAAAAGTTTATCTGTATCAAAATTTATTTTG
CGATATAAGTCAATCAATCATACATGGGTAGTATGAAACTTTGTATGGACAATATACCAT
AAGCCTTATTTCAGTTAACCACTTTAAGCCGTTCTCTAAAAGTCTCATTGTATCAATGAT
TTCGGTTACTATACACCACGGGATGATCCGAAAATAGGGTTGGAGAGTATTATGTAGTTT
TCTTAAGACTAGTGAGACTGTTTATATTAATTTCTCTACTGATCAAAAAATAACCATAAT
GTGCTGTATCGCCCATACTAATTCATCGTAATTATCGTGAGGATCTGTCACTAAGACTAG
TTTTACGATATCATGATCACGCTGCAGTCCACTAACTTAATATTTCTCGACAATATTTTG
GCGAATAGATCTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case