cluster # 3804

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3804 cluster # 3804 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3804#0 length = 513 sequences # 2

consensusID : consensus_3804#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 513
fasta sequence

                              [ACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATGACAATATTATTATTATTATATTTAAATTTGTAGTGTGTTTCCTACTTAAAATTATAAACAAAATGATGCAAAAAAAGATCATCATTCTCCATCCAATGGCAATGAAAGCTTCAAAAAGTATAAATTATATGTACTTGAATCAGTTTAGATATCAGGGTAAAATGAAATGAAGTTATCAATAAGAAAATTGAATGGATATTAAAATGAATTACACTAATAAGAATAATAATAGTGATAATGAAAGCACCAAAATGAACGTGTACATTGTCCTAATGTGTTATATTATATATTAATAAAGTGTAATGCTTCATCGGACTTAAAATGTATCGTATTTAATGATCTAAAATGCGTAGATTTCCTGAAACAATTTTATTTTCTAATATTGAACCTGGTGGTATATTAATGAGATTACCAAAATTGGCAATTATAATAACTGTACCCTTTAAAACTA]

[+] EMBL AI977477             [ACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATGACAATATTATTATTATTATATTTAAATTTGTAGTGTGTTTCCTACTTAAAATTATAAACAAAATGATGCAAAAAAAGATCATCATTCTCCATCCAATGGCAATGAAAGCTTCAAAAAGTATAAATTATATGTACTTGAATCAGTTTAGATATCAGGGTAAAATGAAATGAAGTTATCAATAAGAAAATTGAATGGATATTAAAATGAATTACACTAATAAGAATAATAATAGTGATAATGAAAGCACCAAAATGAACGTGTACATTGTCCTAATGTGTTATATTATATATTAATAAAGTGTAATGCTTCATCGGACTTAAAATGTATCGTATTTAATGATCTAAAATGCGTAGATTTCCTGAAACAATTTTATTTTCTAATATTGAACCTGGTGGTATATTAATGAGATTACCAAAATTGGCAATTATAATAACTGTACCCTTTAAAACTA]
[-] EMBL AA774380             [                                                                                                                                                                            gctcAAAGTATAA  TATATG ACTTG ATCAG TTAGATATCA GGT AAATG AATG AGTTATCAAT AGAAAATTGAATGGATATTAAAATGAATTACACTAATAAGAATAATAATAGTGATAATGAAAGCACCAAAATGAACGTGTACATTGTCCTAATGTGTTATATTATATATTAATAAAGTGTAATGCTTCATCGGACTTAAAATGTATCGTATTTAATGATCTAAA                                                                                                          ]




>consensus_3804#0
ACGCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAA
TGACAATATTATTATTATTATATTTAAATTTGTAGTGTGTTTCCTACTTAAAATTATAAA
CAAAATGATGCAAAAAAAGATCATCATTCTCCATCCAATGGCAATGAAAGCTTCAAAAAG
TATAAATTATATGTACTTGAATCAGTTTAGATATCAGGGTAAAATGAAATGAAGTTATCA
ATAAGAAAATTGAATGGATATTAAAATGAATTACACTAATAAGAATAATAATAGTGATAA
TGAAAGCACCAAAATGAACGTGTACATTGTCCTAATGTGTTATATTATATATTAATAAAG
TGTAATGCTTCATCGGACTTAAAATGTATCGTATTTAATGATCTAAAATGCGTAGATTTC
CTGAAACAATTTTATTTTCTAATATTGAACCTGGTGGTATATTAATGAGATTACCAAAAT
TGGCAATTATAATAACTGTACCCTTTAAAACTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case