Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3808 cluster # 3808       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3808#0 length = 602 sequences # 2  

consensusID : consensus_3808#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 602
fasta sequence
                              [GTTTTAATGTAAACCGTTAATATTAAGCCATATTACATAACAAGCTATATTAATGTATAGAAATTACATTCAAATTACTAAGAGAAAAACAAACAATAGACATTGAAGATCAAATAGTAGATGATAAAAATAATTGAAGATTTGATATGATACTGTACAAATTTCCACAAGTTGGTTTACATGTTTTAAAATATTCTTCCAGTTTTTCAGTACTTAAGTTTCCTCTTAAAACTTCATATTCAACAGATCCTTGACTGGAATCCATATAATCCAAAGACATTAAAGTGAATCGTACCATTATACGATAGTTACGTGTAGAAACTCTTACAGTTATACTAAATGGTCCAGATGGTGTTAAGTATTCATAGAACGATAATGACTTTTTAACAGGTATTATACTTTCACCAATAAACGATTGCTGATGTAATTGTTTTGATTGAAATGGTGTTCTATGTGAAGATTGAACCGCTGTAGATCGTGGTGTTTGTCCAATTAAATGACGTAATTTCTTTGGTGTAAAATAACAAGCAGTAAATAGTTGATCATCTATTGATGTCATACCAAAATTCACATCATATTTAGCTAACCATAAACAACGTANA]

[+] EMBL CD201827             [GTTTTAATGTAAACCGTTAATATTAAGCCATATTACATAACAAGCTATATTAATGTATAGAAATTACATTCAAATTACTAAGAGAAAAACAAACAATAGACATTGAAGATCAAATAGTAGATGATAAAAATAATTGAAGATTTGATATGATACTGTACAAATTTCCACAAGTTGGTTTACATGTTTTAAAATATTCTTCCAGTTTTTCAGTACTTAAGTTTCCTCTTAAAACTTCATATTCAACAGATCCTTGACTGGAATCCATATAATCCAAAGACATTAAAGTGAATCGTACCATTATACGATAGTTACGTGTAGAAACTCTTACAGTTATACTAAATGGTCCAGATGGTGTTAAGTATTCATAGAACGATAATGACTTTTTAACAGGTATTATACTTTCACCAATAAACGATTGCTGATGTAATTGTTTTGATTGAAATGGTGTTCTATGTGAAGATTGAACCGCTGTAGATCGTGGTGTTTGTCCAATTAAATGACGTAATTTCTTTGGTGTAAAATAACAAGCAGTAAATAGTTGATCATCTATTGATGTCATACCAAAATTCACATCATATTTAGCTAACCATAAACAACGTANA]
[+] EMBL CD152613             [GTTTTAATGTAAACCGTTCATATTAAGCCATATTACATAACAAGCTATATTAATGTATAGAAATTACATTCAAATTACTAATAGAAAAACAAACAATAGACATTGAAGATCAAATAGTAGATGATAAAAATAATTGAAGATTTGATATGATACTGTACAAATTTCCACAAGTTGGTTTACATGTTTTAAAATATTCTTCCAGTATTTCACTACTTAAGTGTCCTCTTAAAACTTCATATTCAACAGATCCTTGACTGGAATCCATATAATCCAGAGACATTAAAGTGAATCGAACCATTATACGATAGATACGTGTAGAAACTCTTACAGTTATACTAAATGGTCCAGATGGTGTTAAGTATTCATAGAACGATAATGACTTTTTAACAGGTATTATACTTTCACCAATAAACGATAGCTGATGTAATTGATTTGATTGAAATGGTGCTTTATGTGA                                                                                                                                                 ]


>consensus_3808#0 GTTTTAATGTAAACCGTTAATATTAAGCCATATTACATAACAAGCTATATTAATGTATAG AAATTACATTCAAATTACTAAGAGAAAAACAAACAATAGACATTGAAGATCAAATAGTAG ATGATAAAAATAATTGAAGATTTGATATGATACTGTACAAATTTCCACAAGTTGGTTTAC ATGTTTTAAAATATTCTTCCAGTTTTTCAGTACTTAAGTTTCCTCTTAAAACTTCATATT CAACAGATCCTTGACTGGAATCCATATAATCCAAAGACATTAAAGTGAATCGTACCATTA TACGATAGTTACGTGTAGAAACTCTTACAGTTATACTAAATGGTCCAGATGGTGTTAAGT ATTCATAGAACGATAATGACTTTTTAACAGGTATTATACTTTCACCAATAAACGATTGCT GATGTAATTGTTTTGATTGAAATGGTGTTCTATGTGAAGATTGAACCGCTGTAGATCGTG GTGTTTGTCCAATTAAATGACGTAATTTCTTTGGTGTAAAATAACAAGCAGTAAATAGTT GATCATCTATTGATGTCATACCAAAATTCACATCATATTTAGCTAACCATAAACAACGTA NA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)