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Schistosoma mansoni
cluster # 3829 cluster # 3829       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3829#0 length = 700 sequences # 2  

consensusID : consensus_3829#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 700
fasta sequence
                              [TCATTACTATGATGACTATTATTATTTTTGTTTACTCTTCCATTGTTCTTTATAGTTTTTAAATCATGACATTTTATTTACTTTTCTATATTTATGTATAGTGTCAATTATTCCTAATAAATAAGTCTTCTATAAATCATCCTGTTCATGGGTTCTCTCCTTCCTCTCATGTAACAGTTCACCTTTCTCTATAGATCACTAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTTTTTGTATAAGGTGCAATGAAAGGGAACTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTCTCCTTCCTCTCATGTATTAATCTTTCTCTATAGATCAATAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTATGTATATGTATAAGGTGCAATGAAAGGGGAACCTTTTTTTCTTCCTCTTTTATCATTACTTAAACGTTGAATAAAAATGCATTTTCCTTCTATGTTAATGTATCATTATGGGTTTTTTTCTTTTTTTTAATTTAATGTACAATAATGATTTAATTATCCTTTTTAAGTTTTTATGAATAAAAGAAAAAAATTGGTGGAGGGAGGGGGTTGTTGCTTTTTTTCCAATGTTTCTCCTCTATAGTAACTAGTTGAATTGTTCATCTTTTTTCTTTTTCTTCGACTAAAAGTTGTTTTACTTATTAGTTCTTTTCTATTTTGAGTAGTATAAAACGAATAAATCA]

[-] EMBL CD119990             [TCATTACTATGATGACTATTATTATTTTTGTTTACTCTTCCATTGTTCTTTATAGTTTTTAAATCATGACATTTTATTTACTTTTCTATATTTATGTATAGTGTCAATTATTCCTAATAAATAAGTCTTCTATAAATCATCCTGTTCATGGGTTCTCTCCTTCCTCTCATGTAACAGTTCACCTTTCTCTATAGATCACTAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTTTTTGTATAAGGTGCAATGAAAGGGAACTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTCTCCTTCCTCTCATGTATTAATCTTTCTCTATAGATCAATAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD145725             [                                                                                                                                                                                                               GGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTTTTTGTATAAGGTGCAATGAAAGGGAACTTTTTTTCTT  TTTTTTCTCTCCTTCCTCTCATGTATTAATCTTTCTCTATAGATCAATAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTATGTATATGTATAAGGTGCAATGAAAGGGGAACCTTTTTTTCTTCCTCTTTTATCATTACTTAAACGTTGAATAAAAATGCATTTTCCTTCTATGTTAATGTATCATTATGGGTTTTTTTCTTTTTTTTAATTTAATGTACAATAATGATTTAATTATCCTTTTTAAGTTTTTATGAATAAAAGAAAAAAATTGGTGGAGGGAGGGGGTTGTTGCTTTTTTTCCAATGTTTCTCCTCTATAGTAACTAGTTGAATTGTTCATCTTTTTTCTTTTTCTTCGACTAAAAGTTGTTTTACTTATTAGTTCTTTTCTATTTTGAGTAGTATAAAACGAATAAATCA]


>consensus_3829#0 TCATTACTATGATGACTATTATTATTTTTGTTTACTCTTCCATTGTTCTTTATAGTTTTT AAATCATGACATTTTATTTACTTTTCTATATTTATGTATAGTGTCAATTATTCCTAATAA ATAAGTCTTCTATAAATCATCCTGTTCATGGGTTCTCTCCTTCCTCTCATGTAACAGTTC ACCTTTCTCTATAGATCACTAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTTTTTG TATAAGGTGCAATGAAAGGGAACTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTCTCCTTCCTCTCATGTA TTAATCTTTCTCTATAGATCAATAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTAT GTATATGTATAAGGTGCAATGAAAGGGGAACCTTTTTTTCTTCCTCTTTTATCATTACTT AAACGTTGAATAAAAATGCATTTTCCTTCTATGTTAATGTATCATTATGGGTTTTTTTCT TTTTTTTAATTTAATGTACAATAATGATTTAATTATCCTTTTTAAGTTTTTATGAATAAA AGAAAAAAATTGGTGGAGGGAGGGGGTTGTTGCTTTTTTTCCAATGTTTCTCCTCTATAG TAACTAGTTGAATTGTTCATCTTTTTTCTTTTTCTTCGACTAAAAGTTGTTTTACTTATT AGTTCTTTTCTATTTTGAGTAGTATAAAACGAATAAATCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)