cluster # 3829

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Schistosoma mansoni
cluster # 3829 cluster # 3829 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3829#0 length = 700 sequences # 2

consensusID : consensus_3829#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 700
fasta sequence

                              [TCATTACTATGATGACTATTATTATTTTTGTTTACTCTTCCATTGTTCTTTATAGTTTTTAAATCATGACATTTTATTTACTTTTCTATATTTATGTATAGTGTCAATTATTCCTAATAAATAAGTCTTCTATAAATCATCCTGTTCATGGGTTCTCTCCTTCCTCTCATGTAACAGTTCACCTTTCTCTATAGATCACTAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTTTTTGTATAAGGTGCAATGAAAGGGAACTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTCTCCTTCCTCTCATGTATTAATCTTTCTCTATAGATCAATAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTATGTATATGTATAAGGTGCAATGAAAGGGGAACCTTTTTTTCTTCCTCTTTTATCATTACTTAAACGTTGAATAAAAATGCATTTTCCTTCTATGTTAATGTATCATTATGGGTTTTTTTCTTTTTTTTAATTTAATGTACAATAATGATTTAATTATCCTTTTTAAGTTTTTATGAATAAAAGAAAAAAATTGGTGGAGGGAGGGGGTTGTTGCTTTTTTTCCAATGTTTCTCCTCTATAGTAACTAGTTGAATTGTTCATCTTTTTTCTTTTTCTTCGACTAAAAGTTGTTTTACTTATTAGTTCTTTTCTATTTTGAGTAGTATAAAACGAATAAATCA]

[-] EMBL CD119990             [TCATTACTATGATGACTATTATTATTTTTGTTTACTCTTCCATTGTTCTTTATAGTTTTTAAATCATGACATTTTATTTACTTTTCTATATTTATGTATAGTGTCAATTATTCCTAATAAATAAGTCTTCTATAAATCATCCTGTTCATGGGTTCTCTCCTTCCTCTCATGTAACAGTTCACCTTTCTCTATAGATCACTAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTTTTTGTATAAGGTGCAATGAAAGGGAACTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTCTCCTTCCTCTCATGTATTAATCTTTCTCTATAGATCAATAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD145725             [                                                                                                                                                                                                               GGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTTTTTGTATAAGGTGCAATGAAAGGGAACTTTTTTTCTT  TTTTTTCTCTCCTTCCTCTCATGTATTAATCTTTCTCTATAGATCAATAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTATGTATATGTATAAGGTGCAATGAAAGGGGAACCTTTTTTTCTTCCTCTTTTATCATTACTTAAACGTTGAATAAAAATGCATTTTCCTTCTATGTTAATGTATCATTATGGGTTTTTTTCTTTTTTTTAATTTAATGTACAATAATGATTTAATTATCCTTTTTAAGTTTTTATGAATAAAAGAAAAAAATTGGTGGAGGGAGGGGGTTGTTGCTTTTTTTCCAATGTTTCTCCTCTATAGTAACTAGTTGAATTGTTCATCTTTTTTCTTTTTCTTCGACTAAAAGTTGTTTTACTTATTAGTTCTTTTCTATTTTGAGTAGTATAAAACGAATAAATCA]




>consensus_3829#0
TCATTACTATGATGACTATTATTATTTTTGTTTACTCTTCCATTGTTCTTTATAGTTTTT
AAATCATGACATTTTATTTACTTTTCTATATTTATGTATAGTGTCAATTATTCCTAATAA
ATAAGTCTTCTATAAATCATCCTGTTCATGGGTTCTCTCCTTCCTCTCATGTAACAGTTC
ACCTTTCTCTATAGATCACTAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTTTTTG
TATAAGGTGCAATGAAAGGGAACTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTCTCCTTCCTCTCATGTA
TTAATCTTTCTCTATAGATCAATAGTAACTGGGTATATGGACTCGTATCTATGTATGTAT
GTATATGTATAAGGTGCAATGAAAGGGGAACCTTTTTTTCTTCCTCTTTTATCATTACTT
AAACGTTGAATAAAAATGCATTTTCCTTCTATGTTAATGTATCATTATGGGTTTTTTTCT
TTTTTTTAATTTAATGTACAATAATGATTTAATTATCCTTTTTAAGTTTTTATGAATAAA
AGAAAAAAATTGGTGGAGGGAGGGGGTTGTTGCTTTTTTTCCAATGTTTCTCCTCTATAG
TAACTAGTTGAATTGTTCATCTTTTTTCTTTTTCTTCGACTAAAAGTTGTTTTACTTATT
AGTTCTTTTCTATTTTGAGTAGTATAAAACGAATAAATCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case