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Schistosoma mansoni
cluster # 3835 cluster # 3835       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3835#0 length = 542 sequences # 2  

consensusID : consensus_3835#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 542
fasta sequence
                              [CCAGCGTCTGGATTAGCTTGTCAACAAACAGATTTAGTTGCTCGACTGTTATCAACTGCTGCTGCTGGTTTGTTAATACCTTTGTTTATGAAACGCTCAAGTGTAACACTGCCTAAAGTTAAGAGAGCACAGTCTGCATCATCTAAATTATCACGTACATCTGTAAATAATGCTGGAGGTGCTGGAACACCAGCTGCATGCAAAAGATTATTATCTGAACAAAAATTTATAAATACTATTTTTCGTCATTTAGAAAGCCCACATGCCATGATACGTGCTAAAGCTTTTCTGCTTAGTTCTGCTATAATAGCTAATTCACCACAAGATACTCTATCAGTTGCATGTCATTATCGTTTGCCAACTTTACTTGAACGTAATTTAAAAGCAACTAGAACATTAAATCATAGGTACAATGATGCATTTGATTATAGTTTAACGAAATCTTCGAATATTTCATCATCATCTGGCCAAAATACTGAATCACCTTGTACAGTGTATTTGGCTGCATGTGTAACTCATATGGCTGATATTTTAGTCTGTGA]

[+] EMBL CD122828             [CCAGCGTCTGGATTAGCTTGTCAACAAACAGATTTAGTTGCTCGACTGTTATCAACTGCTGCTGCTGGTTTGTTAATACCTTTGTTTATGAAACGCTCAAGTGTAACACTGCCTAAAGTTAAGAGAGCACAGTCTGCATCATCTAAATTATCACGTACATCTGTAAATAATGCTGGAGGTGCTGGAACACCAGCTGCATGCAAAAGATTATTATCTGAACAAAAATTTATAAATACTATTTTTCGTCATTTAGAAAGCCCACATGCCATGATACGTGCTAAAGCTTTTCTGCTTAGTTCTGCTATAATAGCTAATTCACCACAAGATACTCTATCAGTTGCATGTCATTATCGTTTGCCAACTTTACTTGAACGTAATTTAAAAGCAACTAGAACATTAAATCATAGGTACAATGATGCATTTGATTATAGTTTAACGAAATCTTCGAATATTTCATCATCATCTGGCCAAAATACTGAATCACCTTGTACAGTGTATTTGGCTGCATGTGTAACTCATATGGCTGATATTTTAGTCTGTGA]
[-] EMBL CD122776             [ CAGCGTCTGGATTAACTTGTCAACAAACAGATTTAGTTGCTCGACTGTTATCAACTGCTGCTGCTGGTTTGTTAATACCTTTGTTTATGAAACGCTCAAGTGTAACACTGCCTAAAGTTAAGAGAGCACAGTCTGCATCATCTAAATTATCACGTACATCTGTAAATAATGCTGGAGGTGCTGGAACACCAGCTGCATGCAAAAGATTATTATCTGAACAAAAATTTATAAATACTATTTTTCGTCATTTAGAAAGCCCACATGCCATGATACGTGCTAAAGCTTTTCTGCTTAGTTCTGCTATAATAGCTAATTCACCACAAGATACTCTATCAGTTGCATGTCATTATCGTTTGCCAACTTTACTTGAACGTAATTTAAAAGCAACTAGAACATTAAATCATAGGTACAATGATGCATTTGATTATAGTTTAACGAAATCTTCGAATATTTCATCATCATCTGGCCAAAATACTGAATCACCTTGTACAGTGTATTTGGCTGCATGTGTAACTCATATGGCTGATATTTTAGTCTGTG ]


>consensus_3835#0 CCAGCGTCTGGATTAGCTTGTCAACAAACAGATTTAGTTGCTCGACTGTTATCAACTGCT GCTGCTGGTTTGTTAATACCTTTGTTTATGAAACGCTCAAGTGTAACACTGCCTAAAGTT AAGAGAGCACAGTCTGCATCATCTAAATTATCACGTACATCTGTAAATAATGCTGGAGGT GCTGGAACACCAGCTGCATGCAAAAGATTATTATCTGAACAAAAATTTATAAATACTATT TTTCGTCATTTAGAAAGCCCACATGCCATGATACGTGCTAAAGCTTTTCTGCTTAGTTCT GCTATAATAGCTAATTCACCACAAGATACTCTATCAGTTGCATGTCATTATCGTTTGCCA ACTTTACTTGAACGTAATTTAAAAGCAACTAGAACATTAAATCATAGGTACAATGATGCA TTTGATTATAGTTTAACGAAATCTTCGAATATTTCATCATCATCTGGCCAAAATACTGAA TCACCTTGTACAGTGTATTTGGCTGCATGTGTAACTCATATGGCTGATATTTTAGTCTGT GA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)