cluster # 3848

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Schistosoma mansoni
cluster # 3848 cluster # 3848 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3848#0 length = 741 sequences # 2

consensusID : consensus_3848#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 741
fasta sequence

                              [TGGAAGGTGCCAGAATACATGAAGAAACGATATGGCGGAGAAAGAATACATATGTATCTCGCTCTTTTGTCTCTCATACTATATATTTTTACAAAGATTTCTGTTAATTTATATTCAGGTTCACTGTTTTTAACTGAAGCATTAAAATGGAATACTTGGGTATCAATAGTTTTGCTGCTTTTCCTCACTGGTCTTATTACTGTTACCGGTGGATTAGCAGCTGTTCTGTATACAGATACACTACAGTTTTTCGTGATGATAATTGGTGCTTTAATACTGGCTATAATAAGTTACATAAATGCTGGAGGCTTTGGTGGTGTCCTTTCTTCTTATGGTCGTGCTATAGCCCCGATAAATATCTCATCAAGTACAGATTCAGATTTAATAATCAGTTTGGCCAATGTTCTTAACACAACAAATTACACTTCATTAACTCAATTGGCAAGTTCACCAGATGTCCCTTCTAGTCTAAAATGTAGTCTACCACCTGAAAATGCATTTGTATTATTACGTGGAATTAATGATCCAGAAATGCCATGGCTTGGGTTTTTACTTGGTCAAACACCTGCATCTATATGGTATTGGTGTACTGATCAGATGATGGTACAACGTGTTTTAGCTGCAAAAAGTTTATCTCATGCTCAAGGTGCTACATTAATGGCGGGTTTGATTAAACAGCTACCTTTATTTCTAATTGTAATACCTGGGATGATAAGTCGAATACTGTTTCCAGATGTGATT]

[+] EMBL CD178294             [TGGAAGGTGCCAGAATACATGAAGAAACGATATGGCGGAGAAAGAATACATATGTATCTCGCTCTTTTGTCTCTCATACTATATATTTTTACAAAGATTTCTGTTAATTTATATTCAGGTTCACTGTTTTTAACTGAAGCATTAAAATGGAATACTTGGGTATCAATAGTTTTGCTGCTTTTCCTCACTGGTCTTATTACTGTTACCGGTGGATTAGCAGCTGTTCTGTATACAGATACACTACAGTTTTTCGTGATGATAATTGGTGCTTTAATACTGGCTATAATAAGTTACATAAATGCTGGAGGCTTTGGTGGTGTCCTTTCTTCTTATGGTCGTGCTATAGCCCCGATAAATATCTCATCAAGTACAGATTCAGATTTAATAATCAGTTTGGCCAATGTTCTTAACACAACAAATTACACTTCATTAACTCAATTGGCAAGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD188953             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGATTCAGATTTAATAATCAGTTTGGCCAATGTTCTTAACACAACAAATTACACTTCATTAACTCAATTGGCAAGTTCACCAGATGTCCCTTCTAGTCTAAAATGTAGTCTACCACCTGAAAATGCATTTGTATTATTACGTGGAATTAATGATCCAGAAATGCCATGGCTTGGGTTTTTACTTGGTCAAACACCTGCATCTATATGGTATTGGTGTACTGATCAGATGATGGTACAACGTGTTTTAGCTGCAAAAAGTTTATCTCATGCTCAAGGTGCTACATTAATGGCGGGTTTGATTAAACAGCTACCTTTATTTCTAATTGTAATACCTGGGATGATAAGTCGAATACTGTTTCCAGATGTGATT]




>consensus_3848#0
TGGAAGGTGCCAGAATACATGAAGAAACGATATGGCGGAGAAAGAATACATATGTATCTC
GCTCTTTTGTCTCTCATACTATATATTTTTACAAAGATTTCTGTTAATTTATATTCAGGT
TCACTGTTTTTAACTGAAGCATTAAAATGGAATACTTGGGTATCAATAGTTTTGCTGCTT
TTCCTCACTGGTCTTATTACTGTTACCGGTGGATTAGCAGCTGTTCTGTATACAGATACA
CTACAGTTTTTCGTGATGATAATTGGTGCTTTAATACTGGCTATAATAAGTTACATAAAT
GCTGGAGGCTTTGGTGGTGTCCTTTCTTCTTATGGTCGTGCTATAGCCCCGATAAATATC
TCATCAAGTACAGATTCAGATTTAATAATCAGTTTGGCCAATGTTCTTAACACAACAAAT
TACACTTCATTAACTCAATTGGCAAGTTCACCAGATGTCCCTTCTAGTCTAAAATGTAGT
CTACCACCTGAAAATGCATTTGTATTATTACGTGGAATTAATGATCCAGAAATGCCATGG
CTTGGGTTTTTACTTGGTCAAACACCTGCATCTATATGGTATTGGTGTACTGATCAGATG
ATGGTACAACGTGTTTTAGCTGCAAAAAGTTTATCTCATGCTCAAGGTGCTACATTAATG
GCGGGTTTGATTAAACAGCTACCTTTATTTCTAATTGTAATACCTGGGATGATAAGTCGA
ATACTGTTTCCAGATGTGATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case