These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_3921#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 803 fasta sequence [AGTCTATCTGCTATCGTATATTATGGTGATACAAACGTGTTTGAATGGATTAATTCTCTACGTGGTCTGTATGTGCAGTCTATTTCACACTGGGCTCCAGCTAATATTGGACCTTATAGTCAAGCAATAGCTGTTCCTATCTCAAATATTCAGTTGGATGATTTTTCTACTTGTGTTGCAGATTATTTTACATTCTATTCTGGCCAAATTGGTTTAATTCCTGAATTGGAAATAATACCATCAGAAACTGGATATTTTTCTGATCACTTCGAAGCATTGGAAGTTGAATCTTGGCTTTCATTAAGACATTGTCACCGAATAATGAAATATATGGCCCCGTCCAACATATGGATGAATCTGTTCCTTGGAATTTGCTACGCCATTGATGAAGTTTCGTTGAACCAGGCTCGAAATTGTTTTCACCAAGCTGTTTGTTTGCAAACATTGGATACTACTGATGCTATTAGTGAATGTCATTGCAATCAATGTATTGTATGGCTTGTCGTATCGAATCTACCTAAAAATGCCACAGTTGAATGGCAATGGATAACTGGACCATCATCACTATCATTGGTAATCACATCGTTAAATAAAGTACTTAGCAGGGAATCAATTATCCCTTCGAATACTNTTATGCTGTTCTATCGATATGATGTTAATCAATTGAATGTACGAGAACTATCCATTTTGCTCAATGGAT-ACTACACAGGATTTATGTTACCTGGNTGT-AAGTTTGCTGATCCCTCTGTAACTGCAGTAATTGTTTCTGTACAGTCTAAATAATGTTTAC-ATAAACTAAATGA] [+] EMBL CD079377 [AGTCTATCTGCTATCGTATATTATGGTGATACAAACGTGTTTGAATGGATTAATTCTCTACGTGGTCTGTATGTGCAGTCTATTTCACACTGGGCTCCAGCTAATATTGGACCTTATAGTCAAGCAATAGCTGTTCCTATCTCAAATATTCAGTTGGATGATTTTTCTACTTGTGTTGCAGATTATTTTACATTCTATTCTGGCCAAATTGGTTTAATTCCTGAATTGGAAATAATACCATCAGAAACTGGATATTTTTCTGATCACTTCGAAGCATTGGAAGTTGAATCTTGGCTTTCATTAAGACATTGTCACCGAATAATGAAATATATGGCCCCGTCCAACATATGGATGAATCTGTTCCTTGGAATTTGCTACGCCATTGATGAAGTTTCGTTGAACCAGGCTCGAAATTGTTTTCACCAAGCTGTTTGTTTGCAAACATTGGATACTACTGATGCTATTAGTGAATGTCATTGCAATCAATGTATTGTATGGCTTGTCGTATCGAATCTACCTAAAAATGCCACAGTTGAATGGCAATGGATAACTGGACCATCATCACTATCATTGGTAATCACATCGTTAAATAAAGTACTTAGCAGGGAATCAATTATCCCTTCGAATACTNTTATGCTGTTCTATCGATATGATGTTAATCAATTGAATGTACGAGAACTATCCATTTTGCTCAATGGAT ACTACACAGGATTTATGTTACCTGGNTGT AAGTTTGCTGATCCCTCTGTAACTGCAGTAATTGTTTCTGTACAGTCTAAATAATGTTTAC ATAAACTAAAT ] [-] EMBL CD073654 [ TATTTTACATTCTATTCTGGCCAAATTGGTTTAATTCCTGAATTGGAAATAATACCATCAGAAACTGGATATTTTTCTGATCACTTCGAAGCATTGGAAGTTGAATCTTGGCTTTCATTAAGACATTGTCACCGAATAATGAAATATATGGCCCCGTCCAACATATGGATGAATCTGTTCCTTGGAATTTGCTACGCCATTGATGAAGTTTCGTTGAACCAGGCTCGAAATTGTTTTCACCAAGCTGTTTGTTTGCAAACATTGGATACTACTGATGCTATTAGTGAATGTCATTGCAATCAATGTATTGTATGGCTTGTCGTATCGAATCTACCTAAAAATGCCACAGTTGAATGGCAATGGATAACTGGACCATCATCACTATCATTGGTAATCACATCGTTAAATAAAGTACTTAGCAGGGAATCAATTATCCCTTCGAATACTTTTATGCTGTTCTATCGATATGATGTTAATCAATTGAATGTACGAGAACTATCCATTTTGCTCAAT GATAACTACACAGGATTTATGTTACCT GTTGTAAAGTTTGCTGATCCCTCTGTAACTGCAGTATTTGTTTCTGTACAGTTTAAATAATGTTTACAATAAACTAAATGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||