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Schistosoma mansoni
cluster # 3947 cluster # 3947       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3947#0 length = 328 sequences # 2  

consensusID : consensus_3947#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 328
fasta sequence
                              [GANNGGTTGGTGGATAAATACTACTACTAGGTGCTAAAAATGTATGCCCATCTACGGTAGTTAATAGGATAAAACTATTTGCATTCAATGGATTGACTGGATTAACAATAATTCGATCATTATCATGAACAAAAGTTTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGCTGTTGAACTGGTGAGGTTTCGTATAACATTTGATTACGAAAGTCAGCTAATGTTGATGATGACGATGATGATGTTTGTGCTGGGGGCGGTGGTGCTGGTGGTGACAATTTACCGGATAGAGGAGTAATCATAGATGATAAAGATTTATTATTATTATCATTATTATTTGT]

[-] EMBL CD182103             [GANNGGTTGGTGGATAAATACTACTACTAGGTGCTAAAAATGTATGCCCATCTACGGTAGTTAATAGGATAAAACTATTTGCATTCAATGGATTGACTGGATTAACAATAATTCGATCATTATCATGAACAAAAGTTTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGCTGTTGAACTGGTGAGGTTTCGTATAACATTTGATTACGAAAGTCAGCTAATGTTGATGATGACGATGATGATGTTTGTGCTGGGGGCGGTGGTGCTGGTGGTGACAATTTACCGGATAGAGGAGTAA                                           ]
[+] EMBL CD128059             [                    CTACTACTAGGTGCTAAAAATGTATGCCCATCTACGGTAGTTAATAGGATAAAACTATTTGCATTCAATGGATTGACTGGATTAACAATAATTCGATCATTATCATGAACAAAAGTTTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGCTGTTGAACTGGTGAGGTTTCGTATAACATTTGATTACGAAAGTCAGCTAATGTTGATGATGACGATGATGATGTTTGTGCTGGGGGCGGTGGTGCTGGTGGTGACAATTTACCGGATAGTGGAGTAATCATAGATGATAAAGATTTATTATTATTATCATTATTATTTGT]


>consensus_3947#0 GANNGGTTGGTGGATAAATACTACTACTAGGTGCTAAAAATGTATGCCCATCTACGGTAG TTAATAGGATAAAACTATTTGCATTCAATGGATTGACTGGATTAACAATAATTCGATCAT TATCATGAACAAAAGTTTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGCTGTTGAACTGGTGAGGTTTCGT ATAACATTTGATTACGAAAGTCAGCTAATGTTGATGATGACGATGATGATGTTTGTGCTG GGGGCGGTGGTGCTGGTGGTGACAATTTACCGGATAGAGGAGTAATCATAGATGATAAAG ATTTATTATTATTATCATTATTATTTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)