cluster # 3956

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Schistosoma mansoni
cluster # 3956 cluster # 3956 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3956#0 length = 559 sequences # 2

consensusID : consensus_3956#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 559
fasta sequence

                              [TAGTTGTATCTGGTTTTGACATTTGTTCACAATTAAATTGTTCAGCACCAATGAATTTAGAAAATCCAAGCATTGTAT-CCGAGATATTGCCTAATAGCATAGGAAGAAATTGTAAATTACTTAGTCTTGGTCTGTTGATTTTACAAATTCAAGGTATCGATGTCTCTACCAAAGGCCCAAATTATGTCAATGCTTATCTGCAGTATCTATCGGATCAGCCTGATCTACATGAAATTCACATAGTTGTATGCCATTTTAATGATGATTGTACTGGTGAGATATTTAATCCAGTCAATCAAGTTAATATTACCAACTATACTAATAATGCCAATAATAATAATTCAGATTTTACTGAGAAAATGGAGTTATCCAACTATTTAAATATCTTCACACCTATCAATGATCAACAATCACGTGATCATATAGTCCACTCAGGAACAACTCCGAGTTCCAGTGATATGGAAGATCCTGAACCACTGACTGGTATGGAGTCTCGTGATGTGGTGGATATTTTATCTCTATCAGTGCCGTCACCAGATCCGAATAATTCTTCCGATTC]

[+] EMBL CD117324             [TAGTTGTATCTGGTTTTGACATTTGTTCACAATTAAATTGTTCAGCACCAATGAATTTAGAAAATCCAAGCATTGTAT CCGAGATATTGCCTAATAGCATAGGAAGAAATTGTAAATTACTTAGTCTTGGTCTGTTGATTTTACAAATTCAAGGTATCGATGTCTCTACCAAAGGCCCAAATTATGTCAATGCTTATCTGCAGTATCTATCGGATCAGCCTGATCTACATGAAATTCACATAGTTGTATGCCATTTTAATGATGATTGTACTGGTGAGATATTTAATCCAGTCAATCAAGTTAATATTACCAACTATACTAATAATGCCAATAATAATAATTCAGATTTTACTGAGAAAATGGAGTTATCCAACTATTTAAATATCTTCACACCTATCAATGATCAACAATCACGTGATCATATAGTCCACTCAGGAACAACTCCGAGTTCCAGTGATATGGAAGATCCTGAACCACTGACTGGTATGGAGTCTCGTGATGTGGTGGATATTTTATCTCTATCAGTGCCGTCACCAGATCCGAATAATTCTTCCGATTC]
[-] EMBL CD197724             [                           CACAATTAAATTGTTCAGCACCAATGAATTTAGAAAATCCAAGCATTGTATCCCGAGATATTGCCTAATAGCATAGGAAGAAATTGTAAATTACTTAGTCTTGGTCTGTTGATTTTACAAATTCAAGGTATCGATGTCTCTACCAAAGGCCCAAATTATGTCAATGCTTATCTGCAGTATCTATCGGATCAGCCTGATCTACATGAAATTCACATAGTTGTATGCCATTTTAATGATGATTGTACTGGTGAGATATTTAATCCAGTCAATCAAGTTAATATTACCAACTATACTAATAATGCCAATAATAATAATTCAGATTTTACTGAGAAAATGGAGTTATCCAACTATTTAAATATCTTCACACCTATCAATGATCccata                                                                                                                                                     ]




>consensus_3956#0
TAGTTGTATCTGGTTTTGACATTTGTTCACAATTAAATTGTTCAGCACCAATGAATTTAG
AAAATCCAAGCATTGTATCCGAGATATTGCCTAATAGCATAGGAAGAAATTGTAAATTAC
TTAGTCTTGGTCTGTTGATTTTACAAATTCAAGGTATCGATGTCTCTACCAAAGGCCCAA
ATTATGTCAATGCTTATCTGCAGTATCTATCGGATCAGCCTGATCTACATGAAATTCACA
TAGTTGTATGCCATTTTAATGATGATTGTACTGGTGAGATATTTAATCCAGTCAATCAAG
TTAATATTACCAACTATACTAATAATGCCAATAATAATAATTCAGATTTTACTGAGAAAA
TGGAGTTATCCAACTATTTAAATATCTTCACACCTATCAATGATCAACAATCACGTGATC
ATATAGTCCACTCAGGAACAACTCCGAGTTCCAGTGATATGGAAGATCCTGAACCACTGA
CTGGTATGGAGTCTCGTGATGTGGTGGATATTTTATCTCTATCAGTGCCGTCACCAGATC
CGAATAATTCTTCCGATTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case