cluster # 3994

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Schistosoma mansoni
cluster # 3994 cluster # 3994 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3994#0 length = 667 sequences # 2

consensusID : consensus_3994#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 667
fasta sequence

                              [GCCACTCAATGTCTGCAGACGATGGAGAGAGGTTGGTCAGAGCGTCTTCAAGCTGCGTGAAAGTCTTAGTCTACCTGCATTTAAAATGCAGAGGCCATTGCAATGGGTATCTCCACAACAAACTACTTGTACAGAACGCTTCAAACACACATCCCCATCCAAGAGGTTTGGAGCAGCTATCCTATTGAAAGAGCAGTTACTGTATGTCTTTGGTGGTGCTACAAAGGAACTAACAGCCTTCAATGATTTATGGACATATGATTTATGCACCTTCAGCTGGCAGCGTTTGATTGGTAAAGGTGAGCTACCAACGCCAAGAGCACATGCTAAAGGTGGTTTTATTGGAAATCTACTTTATCTGTACGGGGGTTGTCAAAGCTTTCATAGAGCTGGATCGGAGCATACGGGCCGTATGGATTGGTTAACTGAATT-AAATAGTTTTAATATTTCGACAATGCATTGGTCACGTGTGCCGTTATACGAAGTAAACCACTTAAGTCCTGTATCACCACCTGCAATTGCCGGGCAATCTGGATGTTTTCTCCCTAAAGGTGGAGTAGGCGAACCTAGTGTATTGGTTTTATTTGGAGGAATGTGTCAATCTCTTGGATTGTGTGTTAACTACTTATTTGTCATATCTCCAGAANATGGTTGTTGGATTTCACTT]

[+] EMBL CD118508             [GCCACTCAATGTCTGCAGACGATGGAGAGAGGTTGGTCAGAGCGTCTTCAAGCTGCGTGAAAGTCTTAGTCTACCTGCATTTAAAATGCAGAGGCCATTGCAATGGGTATCTCCACAACAAACTACTTGTACAGAACGCTTCAAACACACATCCCCATCCAAGAGGTTTGGAGCAGCTATCCTATTGAAAGAGCAGTTACTGTATGTCTTTGGTGGTGCTACAAAGGAACTAACAGCCTTCAATGATTTATGGACATATGATTTATGCACCTTCAGCTGGCAGCGTTTGATTGGTAAAGGTGAGCTACCAACGCCAAGAGCACATGCTAAAGGTGGTTTTATTGGAAATCTACTTTATCTGTACGGGGGTTGTCAAAGCTTTCATAGAGCTGGATCGGAGCATACGGGCCGTATGGATTGGTTAACTGAATT AAATAGTTTTAATATTTCGACAATGCATTGGTCACGTGTGCCGTTATACGAAGTAAACCACTTAAGTCCTGTATCACCACCTGCAATTGCCGGGCAATCTGGATGTTTTCTCCCTAAAGGTG                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD170606             [                                                                                                                    AACAAACTACTTGTACAGAACGCTTCAAACACACATCCCCATCCAAGAGGTTTGGAGCAGCTATCCTATTGAAAGAGCAGTTACTGTATGTCTTTGGTGGTGCTACAAAGGAACTAACAGCCTTCAATGATTTATGGACATATGATTTATGCACCTTCAGCTGGCAGCGTCTGATTGGTAAAGGTGAGCTACCAACGCCAAGAGCACATGCTAAAGGTGGTTTTATTGGAAATCTACTTTATCTGTACGGAGGTTGTCAAAGCTTTCATAGAGCTGGATCGGAGCATACGGGCCGTATGGATTGGTTAACTGAATTAAAATAGTTTTAATATTTCGACAATGCATTGGTCACGTGTGCCGTTATACGAAGTAAACCACTTAAGTCCTGTATCACCACCTGCAATTGCCGGGCAATCTGGATGTTTTCTCCCTAAAGGTGGAGTAGGCGAACCTAGTGTATTGGTTTTATTTGGAGGAATGTGTCAATCTCTTGGATTGTGTGTTAACTACTTATTTGTCATATCTCCAGAANATGGTTGTTGGATTTCACTT]




>consensus_3994#0
GCCACTCAATGTCTGCAGACGATGGAGAGAGGTTGGTCAGAGCGTCTTCAAGCTGCGTGA
AAGTCTTAGTCTACCTGCATTTAAAATGCAGAGGCCATTGCAATGGGTATCTCCACAACA
AACTACTTGTACAGAACGCTTCAAACACACATCCCCATCCAAGAGGTTTGGAGCAGCTAT
CCTATTGAAAGAGCAGTTACTGTATGTCTTTGGTGGTGCTACAAAGGAACTAACAGCCTT
CAATGATTTATGGACATATGATTTATGCACCTTCAGCTGGCAGCGTTTGATTGGTAAAGG
TGAGCTACCAACGCCAAGAGCACATGCTAAAGGTGGTTTTATTGGAAATCTACTTTATCT
GTACGGGGGTTGTCAAAGCTTTCATAGAGCTGGATCGGAGCATACGGGCCGTATGGATTG
GTTAACTGAATTAAATAGTTTTAATATTTCGACAATGCATTGGTCACGTGTGCCGTTATA
CGAAGTAAACCACTTAAGTCCTGTATCACCACCTGCAATTGCCGGGCAATCTGGATGTTT
TCTCCCTAAAGGTGGAGTAGGCGAACCTAGTGTATTGGTTTTATTTGGAGGAATGTGTCA
ATCTCTTGGATTGTGTGTTAACTACTTATTTGTCATATCTCCAGAANATGGTTGTTGGAT
TTCACTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case