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Schistosoma mansoni
cluster # 4016 cluster # 4016       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4016#0 length = 1232 sequences # 2  

consensusID : consensus_4016#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1232
fasta sequence
                              [ANAATTCGGCACGAGGGACATCTAGTTCCATCCATTAAATACCAATGTGCCCGGTTAATGGCATTATTAAGGAGCCAATAATAGTAACAGTCAAAGTTTGTGATGAGGCTAAAGGAGTTGAACAAGATTTCAGATGTGAGCTGGACGTTCTTATGATTGAGATGCCGTACTTCAAAGACTTTTTAATTAAGGATGGTCAGTTTATCAGCGAAGTTGAAATACTTGTTCACTGTGACCTGAAAATATTCGAGTGGCTATTACTTTATGCTAGGAAACATATTGATCCTGATGCGTATAAAGAATGCATTTTGACAACTTCGAATGTCCTTGCATTATTAGTTTCATCAAACTTTCTTAAAATGGAACATTTGACCTCCGAATGTTTAGAATATTTTTGCAAGCATGCTGGAGCTATAATAGCAAGCCCTTTCTCTTTAGATTGTTTAGGCGATAGCTTAGTTGAACGCATCTCCCTCGGGTTGAACTTGGAGGAACTGGATAAGATCAAGGATAAAAAGGACAAAATAAAAAGCAAAATCTTTCTCAAGAAAATTGAACATTTGTTTGATCCTCAGTGTACTTCTTCATACTGTCCTAACAATGCAGCTTATCTATTTCGACATTATGTAAACTTGCGTTCGTGTATATGTATCTAGAAACTTACAGGTTNTCTGGATCACAAGAGATGGAAGTCTTAACATTGAAAATCCATATACAAGTAAAATGCTTATCTATTATGATTAACTAACATAGATAATTCTATTAATTCATTTTGCATCAATTTATTTTAATACAATCAAAATATCTTTAAAGATGTCAAAAATGTGGTAAATTACTGACGAGGAACATTTCAATTATCATACCTTGTCTTCCAAATCGTTTTATAATTAGTCAAAGTGGCGATATGATACCTGTTCATGACCCTATGGGATCAAGTGAAAGCGAATTAATATCAGCAGATGAATCATCTCATCAATGTATTGAAGATAATGAATATTCGAAATATTCATATAAACCTAAATCATCAATGACATTTTCGAATTTACATTGTCGTTCATTAGTCACTTCAAATACTAATGGGCAAACACCAATGCCAGTTATTGAAAAACTAACACATTTTTCATGTACAGAACTTTTAATTCAATGGTTTATGGAATCAGGGAATTGGCGTGATGTAGTTTGGAAACTGTGGGNCAACAATAAATCTTCAAGTTAGTGTAAAAAAAAAGTAA]

[+] EMBL CD079592             [ANAATTCGGCACGAGGGACATCTAGTTCCATCCATTAAATACCAATGTGCCCGGTTAATGGCATTATTAAGGAGCCAATAATAGTAACAGTCAAAGTTTGTGATGAGGCTAAAGGAGTTGAACAAGATTTCAGATGTGAGCTGGACGTTCTTATGATTGAGATGCCGTACTTCAAAGACTTTTTAATTAAGGATGGTCAGTTTATCAGCGAAGTTGAAATACTTGTTCACTGTGACCTGAAAATATTCGAGTGGCTATTACTTTATGCTAGGAAACATATTGATCCTGATGCGTATAAAGAATGCATTTTGACAACTTCGAATGTCCTTGCATTATTAGTTTCATCAAACTTTCTTAAAATGGAACATTTGACCTCCGAATGTTTAGAATATTTTTGCAAGCATGCTGGAGCTATAATAGCAAGCCCTTTCTCTTTAGATTGTTTAGGCGATAGCTTAGTTGAACGCATCTCCCTCGGGTTGAACTTGGAGGAACTGGATAAGATCAAGGATAAAAAGGACAAAATAAAAAGCAAAATCTTTCTCAAGAAAATTGAACATTTGTTTGATCCTCAGTGTACTTCTTCATACTGTCCTAACAATGCAGCTTATCTATTTCGACATTATGTAAACTTGCGTTCGTGTATATGTATCTAGAAACTTACAGGTTNTCTGGATCACAAGAGATGGAAGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD073854             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTGAACATTTGTTTGATCCTCAGTGTACTTCTTCATACTGTCCTAACAATGCAGCTTATCTATTTCGACATTATGTAAACTTGCGTTCGTGTATATGTATCTAGAAACTTACAGGTTTTCTGGATCACAAGAGATGGAAGTCTTAACATTGAAAATCCATATACAAGTAAAATGCTTATCTATTATGATTAACTAACATAGATAATTCTATTAATTCATTTTGCATCAATTTATTTTAATACAATCAAAATATCTTTAAAGATGTCAAAAATGTGGTAAATTACTGACGAGGAACATTTCAATTATCATACCTTGTCTTCCAAATCGTTTTATAATTAGTCAAAGTGGCGATATGATACCTGTTCATGACCCTATGGGATCAAGTGAAAGCGAATTAATATCAGCAGATGAATCATCTCATCAATGTATTGAAGATAATGAATATTCGAAATATTCATATAAACCTAAATCATCAATGACATTTTCGAATTTACATTGTCGTTCATTAGTCACTTCAAATACTAATGGGCAAACACCAATGCCAGTTATTGAAAAACTAACACATTTTTCATGTACAGAACTTTTAATTCAATGGTTTATGGAATCAGGGAATTGGCGTGATGTAGTTTGGAAACTGTGGGNCAACAATAAATCTTCAAGTTAGTGTAAAAAAAAAGTAA]


>consensus_4016#0 ANAATTCGGCACGAGGGACATCTAGTTCCATCCATTAAATACCAATGTGCCCGGTTAATG GCATTATTAAGGAGCCAATAATAGTAACAGTCAAAGTTTGTGATGAGGCTAAAGGAGTTG AACAAGATTTCAGATGTGAGCTGGACGTTCTTATGATTGAGATGCCGTACTTCAAAGACT TTTTAATTAAGGATGGTCAGTTTATCAGCGAAGTTGAAATACTTGTTCACTGTGACCTGA AAATATTCGAGTGGCTATTACTTTATGCTAGGAAACATATTGATCCTGATGCGTATAAAG AATGCATTTTGACAACTTCGAATGTCCTTGCATTATTAGTTTCATCAAACTTTCTTAAAA TGGAACATTTGACCTCCGAATGTTTAGAATATTTTTGCAAGCATGCTGGAGCTATAATAG CAAGCCCTTTCTCTTTAGATTGTTTAGGCGATAGCTTAGTTGAACGCATCTCCCTCGGGT TGAACTTGGAGGAACTGGATAAGATCAAGGATAAAAAGGACAAAATAAAAAGCAAAATCT TTCTCAAGAAAATTGAACATTTGTTTGATCCTCAGTGTACTTCTTCATACTGTCCTAACA ATGCAGCTTATCTATTTCGACATTATGTAAACTTGCGTTCGTGTATATGTATCTAGAAAC TTACAGGTTNTCTGGATCACAAGAGATGGAAGTCTTAACATTGAAAATCCATATACAAGT AAAATGCTTATCTATTATGATTAACTAACATAGATAATTCTATTAATTCATTTTGCATCA ATTTATTTTAATACAATCAAAATATCTTTAAAGATGTCAAAAATGTGGTAAATTACTGAC GAGGAACATTTCAATTATCATACCTTGTCTTCCAAATCGTTTTATAATTAGTCAAAGTGG CGATATGATACCTGTTCATGACCCTATGGGATCAAGTGAAAGCGAATTAATATCAGCAGA TGAATCATCTCATCAATGTATTGAAGATAATGAATATTCGAAATATTCATATAAACCTAA ATCATCAATGACATTTTCGAATTTACATTGTCGTTCATTAGTCACTTCAAATACTAATGG GCAAACACCAATGCCAGTTATTGAAAAACTAACACATTTTTCATGTACAGAACTTTTAAT TCAATGGTTTATGGAATCAGGGAATTGGCGTGATGTAGTTTGGAAACTGTGGGNCAACAA TAAATCTTCAAGTTAGTGTAAAAAAAAAGTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)