cluster # 4031

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Schistosoma mansoni
cluster # 4031 cluster # 4031 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4031#0 length = 1057 sequences # 2

consensusID : consensus_4031#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1057
fasta sequence

                              [AGCCANAATTTGGCACGAGGTATCAAAGTGCATGAAGGATGATTTACTCAATAACATATCTACGTAATTATATTGTAGACAATACTTCAGGCACAAATTAATTGTCTATTATTGAATTGAAATGAGTGACAATGATTGATATATAAAAGAAAAATCGAATTTGAATGAATATATAAATATATGAGATTGTTATGCCACTTTACATTTTACTACACTAGTTCAAACTATTGTTATTACTATATATGGACGGACAGACGGACACCGGTCACTCGTCATGGAGGAGCATACGTCTTTAACCAGCATTCTCTATCTAAGTCTGTCCACTACTCTTCCATCTAATTGTTTCCAGTTACTATTCATTCTTTTGATATCTGTTTCCAATTTTCGACGCAATATGTTCTTTGGTCTTCATCTTTTACGTTTCCTTTAAGGATTCCAAGTTAGTGTTTGCCTTGTGATGCAGTTTGGTGATTTCTTCAATGTATGTGTTCTACACTTCCAGAGTCTTTTCCTATATAGAAATGGTCTAAACACGATATAACATCAATCTAAAAAGCTATGGTCTGTTGGACTTAACTGTATTGGTAGGTGAAAATTACTTAGTTGAGATTGACTGGTTTATCGTAACCAATGGTTGAAGACGATGGATGACAAGGTTCAGAAGTGATCGCAAATGATCTAATAAATTCTCTCCATTTCTTCTCCTAAATCTTGAGTTNTAATATTATCATGTACTTTTATACAGTGGATTGATTCTTTTCGAAGCATATTATTTATATCTAGAAATTCCTGCTACCATTACTAGTTATGGTAGCTGCTTTTGTTACTGTGATATTTGTCTTGATAATTTCATCTTGTTGTGCCAATATGATATGACAACATTGACCATAGCATTTATATGTCAGGTTTTCCATTGTTTTTAATTAAACTGATTGGTATGATACAAAATTACTTTTTTTAAAAAAATGTCATTTCTATATTATTTTTAATTTTGTAATATGGAATGTTAAATATGGTATCCAATGAAAACATATTGAAATTAACATATAATTATCCA]

[+] EMBL CD079620             [AGCCANAATTTGGCACGAGGTATCAAAGTGCATGAAGGATGATTTACTCAATAACATATCTACGTAATTATATTGTAGACAATACTTCAGGCACAAATTAATTGTCTATTATTGAATTGAAATGAGTGACAATGATTGATATATAAAAGAAAAATCGAATTTGAATGAATATATAAATATATGAGATTGTTATGCCACTTTACATTTTACTACACTAGTTCAAACTATTGTTATTACTATATATGGACGGACAGACGGACACCGGTCACTCGTCATGGAGGAGCATACGTCTTTAACCAGCATTCTCTATCTAAGTCTGTCCACTACTCTTCCATCTAATTGTTTCCAGTTACTATTCATTCTTTTGATATCTGTTTCCAATTTTCGACGCAATATGTTCTTTGGTCTTCATCTTTTACGTTTCCTTTAAGGATTCCAAGTTAGTGTTTGCCTTGTGATGCAGTTTGGTGATTTCTTCAATGTATGTGTTCTACACTTCCAGAGTCTTTTCCTATATAGAAATGGTCTAAACACGATATAACATCAATCTAAAAAGCTATGGTCTGTTGGACTTAACTGTATTGGTAGGTGAAAATTACTTAGTTGAGATTGACTGGTTTATCGTAACCAATGGTTGAAGACGATGGATGACAAGGTTCAGAAGTGATCGCAAATGATCTAATAAATTCTCTCCATTTCTTCTCCTAAATCTTGAGTTNTAATATTATCATGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD073884             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCGACGCAATATGTTCTTTGGTCTTCATCTTTTACGTTTCC TTAAGGATTCCAAGTTAGTGTTTGCCTTGTGATGCAGTTTGGTGATTTCTTCAATGTATGTGTTCTACACTTCCAGAGTCTTTTCCTATATAGAAATGGTCTAAACACGATATAACATCAATCTAAAAAGCTATGGTCTGTTGGACTTAACTGTATTGGTAGGTGAAAATTACTTAGTTGAGATTGACTGGTTTATCGTAACCAATGGTTGAAGACGATGGATGACAAGGTTCAGAAGTGATCGCAAATGATCTAATAAATTCTCTCCATTTCTTCTCCTAAATCTTGAGTTTTAATATTATCATGTACTTTTATACAGTGGATTGATTCTTTTCGAAGCATATTATTTATATCTAGAAATTCCTGCTACCATTACTAGTTATGGTAGCTGCTTTTGTTACTGTGATATTTGTCTTGATAATTTCATCTTGTTGTGCCAATATGATATGACAACATTGACCATAGCATTTATATGTCAGGTTTTCCATTGTTTTTAATTAAACTGATTGGTATGATACAAAATTACTTTTTTTAAAAAAATGTCATTTCTATATTATTTTTAATTTTGTAATATGGAATGTTAAATATGGTATCCAATGAAAACATATTGAAATTAACATATAATTATCCA]




>consensus_4031#0
AGCCANAATTTGGCACGAGGTATCAAAGTGCATGAAGGATGATTTACTCAATAACATATC
TACGTAATTATATTGTAGACAATACTTCAGGCACAAATTAATTGTCTATTATTGAATTGA
AATGAGTGACAATGATTGATATATAAAAGAAAAATCGAATTTGAATGAATATATAAATAT
ATGAGATTGTTATGCCACTTTACATTTTACTACACTAGTTCAAACTATTGTTATTACTAT
ATATGGACGGACAGACGGACACCGGTCACTCGTCATGGAGGAGCATACGTCTTTAACCAG
CATTCTCTATCTAAGTCTGTCCACTACTCTTCCATCTAATTGTTTCCAGTTACTATTCAT
TCTTTTGATATCTGTTTCCAATTTTCGACGCAATATGTTCTTTGGTCTTCATCTTTTACG
TTTCCTTTAAGGATTCCAAGTTAGTGTTTGCCTTGTGATGCAGTTTGGTGATTTCTTCAA
TGTATGTGTTCTACACTTCCAGAGTCTTTTCCTATATAGAAATGGTCTAAACACGATATA
ACATCAATCTAAAAAGCTATGGTCTGTTGGACTTAACTGTATTGGTAGGTGAAAATTACT
TAGTTGAGATTGACTGGTTTATCGTAACCAATGGTTGAAGACGATGGATGACAAGGTTCA
GAAGTGATCGCAAATGATCTAATAAATTCTCTCCATTTCTTCTCCTAAATCTTGAGTTNT
AATATTATCATGTACTTTTATACAGTGGATTGATTCTTTTCGAAGCATATTATTTATATC
TAGAAATTCCTGCTACCATTACTAGTTATGGTAGCTGCTTTTGTTACTGTGATATTTGTC
TTGATAATTTCATCTTGTTGTGCCAATATGATATGACAACATTGACCATAGCATTTATAT
GTCAGGTTTTCCATTGTTTTTAATTAAACTGATTGGTATGATACAAAATTACTTTTTTTA
AAAAAATGTCATTTCTATATTATTTTTAATTTTGTAATATGGAATGTTAAATATGGTATC
CAATGAAAACATATTGAAATTAACATATAATTATCCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case