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Schistosoma mansoni
cluster # 4044 cluster # 4044       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4044#0 length = 635 sequences # 2  

consensusID : consensus_4044#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 635
fasta sequence
                              [GCTTTGCATCAATTTACTTTTTTAGTTTGAGTTCATCACTTCTAGTTCGATCTTATTTGTCAAGAGATACCAATAAAGACAATAGTAATGGCAAAAGTTCACTGAGCAAGAAGGAATTTTCGTTATTCAGCATATATTTCATCTGTAGTTTCATGATCCTATGCTTATTAGGTTGTTTCTACTTACTAGGTGGTAGTCAAATGACATCCAGACGTTTTGCAAATTCTAACTATATATTACTTATTATATTTCTCTCAATCATATGCTTTCTTTTTCTTATTTTGATGATTTCATTATTAATACACTTTAAATCGCTTTTCAACCTAAATTTAAGCTATTCCCCATTATCTTTGATAATTAATGATAAAGGCTTTTTATATTTCATCATTTCGAATTTATTGACTGGTTTCTTCAATGTGTTTTGTTTGAATACTCTACAGTTGTTGCCTGAAGGAGCAAGATTAAATGTTATCATGGGTACGTATGATGATTTGAGTTGGTCTTCGTCATTATTACAATTTTCAGTGCTCTTAGCCTATTCGAGTTTATCAGTTATTTTTGTTTTAATCGGTACTTATTACGATCGCCTTAAACTTTCTTCTCCCAGTATGTTTGGTATTTCTAAATAAATGATT]

[+] EMBL CD079655             [GCTTTGCATCAATTTACTTTTTTAGTTTGAGTTCATCACTTCTAGTTCGATCTTATTTGTCAAGAGATACCAATAAAGACAATAGTAATGGCAAAAGTTCACTGAGCAAGAAGGAATTTTCGTTATTCAGCATATATTTCATCTGTAGTTTCATGATCCTATGCTTATTAGGTTGTTTCTACTTACTAGGTGGTAGTCAAATGACATCCAGACGTTTTGCAAATTCTAACTATATATTACTTATTATATTTCTCTCAATCATATGCTTTCTTTTTCTTATTTTGATGATTTCATTATTAATACACTTTAAATCGCTTTTCAACCTAAATTTAAGCTATTCCCCATTATCTTTGATAATTAATGATAAAGGCTTTTTATATTTCATCATTTCGAATTTATTGACTGGTTTCTTCAATGTGTTTTGTTTGAATACTCTACAGTTGTTGCCTGAAGGAGCAAGATTAAATGTTATCATGGGTACGTATGATGATTTGAGTTGGTCTTCGTCATTATTACAATTTTCAGTGCTCTTAGCCTATTCGAGTTTATCAGTTATTTTTGTTTTAATCGGTACTTATTACGATCGCCTTAAACTTTCTTCTCCCAGTATGTTTGGTATTTCTAAATAAATGATT]
[-] EMBL CD073915             [                                                    TTATTTGTCAAGAGATACCAATAAAGCCAATAGTAATGGCAAAAGTTCACTGAGCAAGAAGGAATTTTCGTTATTCAGCATATATTTCATCTGTAGTTTCATGATCCTATGCTTATTAGGTTGTTTCTACTTACTAGGTGGTAGTCAAATGACATCCAGACGTTTTGCAAATTCTAACTATATATTACTTATTATATTTCTCTCAATCATATGCTTTCTTTTTCTTATTTTGATGATTTCATTATTAATACACTTTAAATCGCTTTTCAACCTAAATTTAAGCTATTCCCCATTATCTTTGATAATTAATGATAAAGGCTTTTTATATTTCATCATTTCGAATTTATTGACTGGTTTCTTCAATGTGTTTTGTTTGAATACTCTACAGTTGTTGCCTGAAGGAGCAAGATTAAATGTTATCATGGGTACGTATGATGATTTGAGTTGGTCTTCGTCATTATTACAATTTTCAGTGCTCTTAGCCTATTCGAGTTTATCAGTTATTTTTGTTTTAATCGGTACTTATTACGATCGCCTTAAACTTTTTTCTCCCAGTATGTTTGGTATTGTTAAATA       ]


>consensus_4044#0 GCTTTGCATCAATTTACTTTTTTAGTTTGAGTTCATCACTTCTAGTTCGATCTTATTTGT CAAGAGATACCAATAAAGACAATAGTAATGGCAAAAGTTCACTGAGCAAGAAGGAATTTT CGTTATTCAGCATATATTTCATCTGTAGTTTCATGATCCTATGCTTATTAGGTTGTTTCT ACTTACTAGGTGGTAGTCAAATGACATCCAGACGTTTTGCAAATTCTAACTATATATTAC TTATTATATTTCTCTCAATCATATGCTTTCTTTTTCTTATTTTGATGATTTCATTATTAA TACACTTTAAATCGCTTTTCAACCTAAATTTAAGCTATTCCCCATTATCTTTGATAATTA ATGATAAAGGCTTTTTATATTTCATCATTTCGAATTTATTGACTGGTTTCTTCAATGTGT TTTGTTTGAATACTCTACAGTTGTTGCCTGAAGGAGCAAGATTAAATGTTATCATGGGTA CGTATGATGATTTGAGTTGGTCTTCGTCATTATTACAATTTTCAGTGCTCTTAGCCTATT CGAGTTTATCAGTTATTTTTGTTTTAATCGGTACTTATTACGATCGCCTTAAACTTTCTT CTCCCAGTATGTTTGGTATTTCTAAATAAATGATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)