Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4066 cluster # 4066       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4066#0 length = 645 sequences # 2  

consensusID : consensus_4066#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 645
fasta sequence
                              [AGGTATTTTCAGTCAAAGAGATTCCAGTTAATTTCGAAAACTCATGTACATCAACAGAGACCAACGGCAAGGAGATAAATGACCAAACTGTCCAATCAGATGATATAAAGACATGTTTAATTGGATTAAACGAATCTATTGATTGGTTTATTCACGAGTCTTGTTTAACTCCAGTAAATATCTCTGAATATATAGATAGTGGAAAGAAATTAGATGATTACTTTATGGACGATCGTTTCTGGTGTATAAAATCACAAACTAATCAATCTCCAAATAGTAATAGTACAAATAATAAACGAATTGAAGTCAATAATAATTATGTACAATTGAAATTGAAAGAACTTCATGATACTGAATGGAAAGCAATGGATTGGAGAAATTGTATAGAGATATTTAATGATAAATCTAAAGTGTTACTTAAATCAAGTACATTATCAGATCACAGTGCAGAATTGGGTAAATTAGAAGCAACATGTTCGAAATCACAAACTATTTTGAATTATGCTTTTAATTCATTACTAAAACATCCAGAAATTCTACACACATTTAAAACAGATTTGGCTAAGATTGAAGGATCTATACGGCANATTGAATTAATTAAAAATTCAGCTGAAGATCCAGATCAAATTATTCAAGAATTAAGTA]

[-] EMBL CD168748             [AGGTATTTTCAGTCAAAGAGATTCCAGTTAATTTCGAAAACTCATGTACATCAACAGAGACCAACGGCAAGGAGATAAATGACCAAACTGTCCAATCAGATGATATAAAGACATGTTTAATTGGATTAAACGAATCTATTGATTGGTTTATTCACGAGTCTTGTTTAACTCCAGTAAATATCTCTGAATATATAGATAGTGGAAAGAAATTAGATGATTACTTTATGGACGATCGTTTCTGGTGTATAAAATCACAAACTAATCAATCTCCAAATAGTAATAGTACAAATAATAAACGAATTGAAGTCAATAATAATTATGTACAATTGAAATTGAAAGAACTTCATGATACTGAATGGAAAGCAATGGATTGGAGAAATTGTATAGAGATATTTAATGATAAATCTAAAGTGTTACTTAAATCAAGTACATTATC                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD154648             [                                                         AGACCAACGGCAAGGAGATAAATGACCAAACTGTCCAATCAGATGATATAAAGACATGTTTAATTGGATTAAACGAATCTATTGATTGGTTTATTCACGAGTCTTGTTTAATTCCAGTTAATATCTCTGAATATATAGATAGTGGAAAGAAATTAGATGATTACTTTATGGACGATCGTTTCTGGTGTATAAAATCACAAACTAATCAATCTCCAAATAGTAATAGTACAAATAATAAACGAATTGAAGTCAATAATAATTATGTACAATTGAAATTGAAAGAACTTCATGATACTGAATGGAAAGCAATGGATTGGAGAAATTGTATAGAGATATTTAATGATAAATCTAAAGTGTTGCTTAAATCAAGTACATTATCAGATCACAGTGCAGAATTGGGTAAATTAGAAGCAACATGTTCGAAATCACAAACTATTTTGAATTATGCTTTTAATTCATTACTAAAACATCCAGAAATTCTACACACATTTAAAACAGATTTGGCTAAGATTGAAGGATCTATACGGCANATTGAATTAATTAAAAATTCAGCTGAAGATCCAGATCAAATTATTCAAGAATTAAGTA]


>consensus_4066#0 AGGTATTTTCAGTCAAAGAGATTCCAGTTAATTTCGAAAACTCATGTACATCAACAGAGA CCAACGGCAAGGAGATAAATGACCAAACTGTCCAATCAGATGATATAAAGACATGTTTAA TTGGATTAAACGAATCTATTGATTGGTTTATTCACGAGTCTTGTTTAACTCCAGTAAATA TCTCTGAATATATAGATAGTGGAAAGAAATTAGATGATTACTTTATGGACGATCGTTTCT GGTGTATAAAATCACAAACTAATCAATCTCCAAATAGTAATAGTACAAATAATAAACGAA TTGAAGTCAATAATAATTATGTACAATTGAAATTGAAAGAACTTCATGATACTGAATGGA AAGCAATGGATTGGAGAAATTGTATAGAGATATTTAATGATAAATCTAAAGTGTTACTTA AATCAAGTACATTATCAGATCACAGTGCAGAATTGGGTAAATTAGAAGCAACATGTTCGA AATCACAAACTATTTTGAATTATGCTTTTAATTCATTACTAAAACATCCAGAAATTCTAC ACACATTTAAAACAGATTTGGCTAAGATTGAAGGATCTATACGGCANATTGAATTAATTA AAAATTCAGCTGAAGATCCAGATCAAATTATTCAAGAATTAAGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)