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Schistosoma mansoni
cluster # 4091 cluster # 4091       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4091#0 length = 1051 sequences # 2  

consensusID : consensus_4091#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1051
fasta sequence
                              [GAGGATCATTCTTACTATACCGCGTCCTAAAGCTTTTCATCCATCTGACCAACCAGATGATTTACCTGTTCGATTATCTTCTATAAACTCAGCGAAACCTATTGATGAGTATATAAATTCAGACAATGCTTACTCATCATCTGGTTCACGTAGTAGACGTTCAATGATTCTTAAATCAAAACGTCCTTGCCCAACATCTACGTAAACAACTTTTCTTACATGTCCTATGTTAATAAATACATATATACGGAAATTAAACTGAGTTATGTTTAGCATGTTATTTATACTACATAAATTTCTTACTCATCTTGTACATAAAAACATATATAGTTATTATTAAACAGGAACTGTATCAAAAAAATGAATACCTCGAATCGTAAAAAAATTTACTTGCAAATGCATTATTAGTTATCAAAACTTCTTTGTATCATAAATGTTTCATAGCTTTTTTCTTAATTTCACTTTTTACTTAGTGACATTGTTTTGTAATGTGTTTAAAGCAACAGTATAAACTATCAATATATATCCTTTTGTATTCAGTATATACATAACGATAGTAATAATGCTTTCCCTAATAAACAATTTATAGATAATTAATCAAATTAGTGATGTATTGATGTTAATGTGGATTTCTATCAAGTTATCGTCAGTAATTTCTGTCGTCTTTTTTAAATAGTTTCATGTGTTCGTTNTATGTTCCATCATTTCACTTTAATCTACACTTGTAGCACACAAACTTCTGTTTTCTTCCAAGCACGCCTCCTTTTTGTTCTACTGATATCTTATTATGCATATAAGACATTCCATTCCACAATTTTTGTTAATATGTATTTATGTTCATGTATTAATCCTCCTCTAAAATGAAAACTGATAATTTTGTGATCCTCTTGGCGATTTGATTAATTAGATTTTGTTTTCCTTGTGAAATCTGAATTCATACTTCTGATTGGTCGTTTGGATAACATGTAAATCATTTAGGAAACCTTATTCGCAGACGGAGATGTAAATTTCAATTTGGTCTAACAGCCCAAATTATTAAGCTGAAATAAGA]

[+] EMBL CD079745             [GAGGATCATTCTTACTATACCGCGTCCTAAAGCTTTTCATCCATCTGACCAACCAGATGATTTACCTGTTCGATTATCTTCTATAAACTCAGCGAAACCTATTGATGAGTATATAAATTCAGACAATGCTTACTCATCATCTGGTTCACGTAGTAGACGTTCAATGATTCTTAAATCAAAACGTCCTTGCCCAACATCTACGTAAACAACTTTTCTTACATGTCCTATGTTAATAAATACATATATACGGAAATTAAACTGAGTTATGTTTAGCATGTTATTTATACTACATAAATTTCTTACTCATCTTGTACATAAAAACATATATAGTTATTATTAAACAGGAACTGTATCAAAAAAATGAATACCTCGAATCGTAAAAAAATTTACTTGCAAATGCATTATTAGTTATCAAAACTTCTTTGTATCATAAATGTTTCATAGCTTTTTTCTTAATTTCACTTTTTACTTAGTGACATTGTTTTGTAATGTGTTTAAAGCAACAGTATAAACTATCAATATATATCCTTTTGTATTCAGTATATACATAACGATAGTAATAATGCTTTCCCTAATAAACAATTTATAGATAATTAATCAAATTAGTGATGTATTGATGTTAATGTGGATTTCTATCAAGTTATCGTCAGTAATTTCTGTCGTCTTTTTTAAATAGTTTCATGTGTTCGTTNTATGTTCCATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD074003             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAANAATGAATACCTCGAATCGTAAAAAAATTTACTTGCAAATGCATTATTAGTTATCAAAACTTCTTTGTATCATAAATGTTTCATAGCTTTTTTCTTAATTTCACTTTTTACTTAGTGACATTGTTTTGTAATGTGTTTAAAGCAACAGTATAAACTATCAATATATATCCTTTTGTATTCAGTATATACATAACGATAGTAATAATGCTTTCCCTAATAAACAATTTATAGATAATTAATCAAATTAGTGATGTATTGATGTTAATGTGGATTTCTATCAAGTTATCGTCAGTAATTTCTGTCGTCTTTTTTAAATAGTTTCATGTGTTCGTTTTATGTTCCATCATTTCACTTTAATCTACACTTGTAGCACACAAACTTCTGTTTTCTTCCAAGCACGCCTCCTTTTTGTTCTACTGATATCTTATTATGCATATAAGACATTCCATTCCACAATTTTTGTTAATATGTATTTATGTTCATGTATTAATCCTCCTCTAAAATGAAAACTGATAATTTTGTGATCCTCTTGGCGATTTGATTAATTAGATTTTGTTTTCCTTGTGAAATCTGAATTCATACTTCTGATTGGTCGTTTGGATAACATGTAAATCATTTAGGAAACCTTATTCGCAGACGGAGATGTAAATTTCAATTTGGTCTAACAGCCCAAATTATTAAGCTGAAATAAGA]


>consensus_4091#0 GAGGATCATTCTTACTATACCGCGTCCTAAAGCTTTTCATCCATCTGACCAACCAGATGA TTTACCTGTTCGATTATCTTCTATAAACTCAGCGAAACCTATTGATGAGTATATAAATTC AGACAATGCTTACTCATCATCTGGTTCACGTAGTAGACGTTCAATGATTCTTAAATCAAA ACGTCCTTGCCCAACATCTACGTAAACAACTTTTCTTACATGTCCTATGTTAATAAATAC ATATATACGGAAATTAAACTGAGTTATGTTTAGCATGTTATTTATACTACATAAATTTCT TACTCATCTTGTACATAAAAACATATATAGTTATTATTAAACAGGAACTGTATCAAAAAA ATGAATACCTCGAATCGTAAAAAAATTTACTTGCAAATGCATTATTAGTTATCAAAACTT CTTTGTATCATAAATGTTTCATAGCTTTTTTCTTAATTTCACTTTTTACTTAGTGACATT GTTTTGTAATGTGTTTAAAGCAACAGTATAAACTATCAATATATATCCTTTTGTATTCAG TATATACATAACGATAGTAATAATGCTTTCCCTAATAAACAATTTATAGATAATTAATCA AATTAGTGATGTATTGATGTTAATGTGGATTTCTATCAAGTTATCGTCAGTAATTTCTGT CGTCTTTTTTAAATAGTTTCATGTGTTCGTTNTATGTTCCATCATTTCACTTTAATCTAC ACTTGTAGCACACAAACTTCTGTTTTCTTCCAAGCACGCCTCCTTTTTGTTCTACTGATA TCTTATTATGCATATAAGACATTCCATTCCACAATTTTTGTTAATATGTATTTATGTTCA TGTATTAATCCTCCTCTAAAATGAAAACTGATAATTTTGTGATCCTCTTGGCGATTTGAT TAATTAGATTTTGTTTTCCTTGTGAAATCTGAATTCATACTTCTGATTGGTCGTTTGGAT AACATGTAAATCATTTAGGAAACCTTATTCGCAGACGGAGATGTAAATTTCAATTTGGTC TAACAGCCCAAATTATTAAGCTGAAATAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)