cluster # 4098

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Schistosoma mansoni
cluster # 4098 cluster # 4098 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4098#0 length = 1085 sequences # 2

consensusID : consensus_4098#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1085
fasta sequence

                              [TCCNAGGCCANAATTTGGCACGAGGAGAACAGTAACTTTATCATATGCCAAAAATTTCGTTGCGTCTGGTGGGATTATTTATAAGTCCTTTAAGGTGGGCGAAATATCAGAAACGAGTGAAAATGTGGATTACCCTATTTTGATCAAGAACGTTAATAGTGGATCAAACAATTCAACTCATATTTCACAGGTCACATGTAAGTATGTGATTACTTGTACAGGTTTGCAGTCTGATCGTGTTGCTAAGATGTCTGGCTGTTCTCCAAATCCTGTCATAGTACCATTTCGAGGTGATTATCTAGTTTTGAAACCTGAAAATTCTTCTTTAATAAATGGAAATATATATCCTGTTCCTGATTCTCGTTTCCCGTTCTTGGGTGTCCACTTCACTCCACGTTTAGATGGATCCGTTTTGCTGGGACCGAATGCTATCCTTTCATTAGATCGGGAAGGTTATGGACGTTTCGATTTTAACTTCAAAGACTACTTTGATCTCGCATCTAGCCCTGGACTTCGGAAACTCATTTTCCGTTATTTACGTTTTGGTATAAATGAAATAATTGATGGTTTATTTATTCATCGCCAGGTCAAACGGCTTAAAAAATATGTACCTAGCTTAAATGTTAAAGATGTCGTCAGGGGCCCATCTGGAATAAGAGCCCAAGC-ATTGATTCAGATGGTACGTTAGTGGATGATTNTGTAATTCATTTTGGTGATGGTGAGATTGGTAAAAG-ATCATGCATGTACGTAATGCACCATCACCAACCGCGACAGCTTTTTTGGCTATTGGTTGTGTTTTGGCCGATAAAGCCCAAGAGTACTTTGATTTATCTCTTGGTGAATCAAAAAGTTTTGTTTAGTACTCTTTGCACGTTCCTTGATGCAACTTTTACCTCTTCTGTTTTAAATTCTTTCCCCTAAAAAAACACGACCTCTTGTTTTTTGTTCATTCACTTTGATTTTGCGTCTATCATTTCAGGGAAATTGAACATTACTGAGTTGTTCGTGGTTACTGTAATAATAATTCTCACTCCCTTAAAGTATTTGGTTTGTATTATTGCAAATGACCAAAAATTACGATAATT]

[+] EMBL CD079763             [TCCNAGGCCANAATTTGGCACGAGGAGAACAGTAACTTTATCATATGCCAAAAATTTCGTTGCGTCTGGTGGGATTATTTATAAGTCCTTTAAGGTGGGCGAAATATCAGAAACGAGTGAAAATGTGGATTACCCTATTTTGATCAAGAACGTTAATAGTGGATCAAACAATTCAACTCATATTTCACAGGTCACATGTAAGTATGTGATTACTTGTACAGGTTTGCAGTCTGATCGTGTTGCTAAGATGTCTGGCTGTTCTCCAAATCCTGTCATAGTACCATTTCGAGGTGATTATCTAGTTTTGAAACCTGAAAATTCTTCTTTAATAAATGGAAATATATATCCTGTTCCTGATTCTCGTTTCCCGTTCTTGGGTGTCCACTTCACTCCACGTTTAGATGGATCCGTTTTGCTGGGACCGAATGCTATCCTTTCATTAGATCGGGAAGGTTATGGACGTTTCGATTTTAACTTCAAAGACTACTTTGATCTCGCATCTAGCCCTGGACTTCGGAAACTCATTTTCCGTTATTTACGTTTTGGTATAAATGAAATAATTGATGGTTTATTTATTCATCGCCAGGTCAAACGGCTTAAAAAATATGTACCTAGCTTAAATGTTAAAGATGTCGTCAGGGGCCCATCTGGAATAAGAGCCCAAGC ATTGATTCAGATGGTACGTTAGTGGATGATTNTGTAATTCATTTTGGTGATGGTGAGATTGGTAAAAG ATCATGCATGTACGTAATGCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD074023             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTAGCCCTGGACTTCGGAAACTCATTTTCCGTTATTTACGTTTTGGTATAAATGAAATAATTGATGGTTTATTTATTCATCGCCAGGTCAAACGGCTTAAAAAATATGTACCTAGCTTAAATGTTAAAGATGTCGTCAGGGGCCCATTTGGAATAAGAGCCCAAGCAATTGATTCAGATGGTACGTTAGTGGATGATTTTGTAATTCATTTTGGTGATGGTGAGATTGGTAAAAGAATCATGCATGTACGTAATGCACCATCACCAACCGCGACAGCTTTTTTGGCTATTGGTTGTGTTTTGGCCGATAAAGCCCAAGAGTACTTTGATTTATCTCTTGGTGAATCAAAAAGTTTTGTTTAGTACTCTTTGCACGTTCCTTGATGCAACTTTTACCTCTTCTGTTTTAAATTCTTTCCCCTAAAAAAACACGACCTCTTGTTTTTTGTTCATTCACTTTGATTTTGCGTCTATCATTTCAGGGAAATTGAACATTACTGAGTTGTTCGTGGTTACTGTAATAATAATTCTCACTCCCTTAAAGTATTTGGTTTGTATTATTGCAAATGACCAAAAATTACGATAATT]




>consensus_4098#0
TCCNAGGCCANAATTTGGCACGAGGAGAACAGTAACTTTATCATATGCCAAAAATTTCGT
TGCGTCTGGTGGGATTATTTATAAGTCCTTTAAGGTGGGCGAAATATCAGAAACGAGTGA
AAATGTGGATTACCCTATTTTGATCAAGAACGTTAATAGTGGATCAAACAATTCAACTCA
TATTTCACAGGTCACATGTAAGTATGTGATTACTTGTACAGGTTTGCAGTCTGATCGTGT
TGCTAAGATGTCTGGCTGTTCTCCAAATCCTGTCATAGTACCATTTCGAGGTGATTATCT
AGTTTTGAAACCTGAAAATTCTTCTTTAATAAATGGAAATATATATCCTGTTCCTGATTC
TCGTTTCCCGTTCTTGGGTGTCCACTTCACTCCACGTTTAGATGGATCCGTTTTGCTGGG
ACCGAATGCTATCCTTTCATTAGATCGGGAAGGTTATGGACGTTTCGATTTTAACTTCAA
AGACTACTTTGATCTCGCATCTAGCCCTGGACTTCGGAAACTCATTTTCCGTTATTTACG
TTTTGGTATAAATGAAATAATTGATGGTTTATTTATTCATCGCCAGGTCAAACGGCTTAA
AAAATATGTACCTAGCTTAAATGTTAAAGATGTCGTCAGGGGCCCATCTGGAATAAGAGC
CCAAGCATTGATTCAGATGGTACGTTAGTGGATGATTNTGTAATTCATTTTGGTGATGGT
GAGATTGGTAAAAGATCATGCATGTACGTAATGCACCATCACCAACCGCGACAGCTTTTT
TGGCTATTGGTTGTGTTTTGGCCGATAAAGCCCAAGAGTACTTTGATTTATCTCTTGGTG
AATCAAAAAGTTTTGTTTAGTACTCTTTGCACGTTCCTTGATGCAACTTTTACCTCTTCT
GTTTTAAATTCTTTCCCCTAAAAAAACACGACCTCTTGTTTTTTGTTCATTCACTTTGAT
TTTGCGTCTATCATTTCAGGGAAATTGAACATTACTGAGTTGTTCGTGGTTACTGTAATA
ATAATTCTCACTCCCTTAAAGTATTTGGTTTGTATTATTGCAAATGACCAAAAATTACGA
TAATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case