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Schistosoma mansoni
cluster # 4102 cluster # 4102       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4102#0 length = 675 sequences # 3  

consensusID : consensus_4102#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 675
fasta sequence
                              [CGAGGACAACTTTTGTAATTTAATTTATGTTTGTTGCTATCGTTACACTTGGCTAGCAGTAGTAGTAGTATTATCACAACCATATCGTATATATTCTGTCTTATTTTTATAAGCATGTAATTACATATCATTATCATTAACAACAACAACAAAACGACTTTACTTATGATCCTCGTTCCTACTCTCTCATCTTGTATTAATCGGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGTAAATCTCAGATCTCAAATCATGCCTTTTACTCTATTTTTTTCCCCAATGATCAAAACATTTTGTATTTGGAATCATTGTTGCTCTCCCTCTCTATCTCCCTTTAATATACATATCATGATAAATATGTAGTAAGTATATACAAAGTGGGTTTTTATTTTGTATACGGACTTGCTTTTTAATGCTTCATAATGCTCTGTCCTCCTAACTTACTTACTACTTTCACTATTTCCAATTATAGTTGTAACCAGTGTTGTCATGAAGGTTCTCAATATCTTTATTCAGAATTATTGATCCATATATTGTTTCCAGTAATGGATGATAAACATTCCATACACCTTTGATATTCCACATTTCTTTTTTCTTCGTTTGATATTTGTCATCCTTTGATGGCCTCTTTACTCTTGAACTACTTCGACTGTTTCATAGCATTTATTTATTGACTTTGA]

[+] EMBL CD082311             [CGAGGACAACTTTTGTAATTTAATTTATGTTTGTTGCTATCGTTACACTTGGCTAGCAGTAGTAGTAGTATTATCACAACCATATCGTATATATTCTGTCTTATTTTTATAAGCATGTAATTACATATCATTATCATTAACAACAACAACAAAACGACTTTACTTATGATCCTCGTTCCTACTCTCTCATCTTGTATTAATCGGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGTAAATCTCAGATCTCAAATCATGCCTTTTACTCTATTTTTTTCCCCAATGATCAAAACATTTTGTATTTGGAATCATTGTTGCTCTCCCTCTCTATCTCCCTTTAATATACATATCATGATAAATATGTAGTAAGTATATACAAAGTGGGTTTTTATTTTGTATACGGACTTGCTTTTTAATGCTTCATAATGCTCTGTCCTCCTAACTTACTTACTACTTTCACTATTTCCAATTATAGTTGTAACCAGTGTTGTCATGAAGGTTCTCAATATCTTTATTCAGAATTATTGATCCATATATTGTTTCCAGTAATGGATGATAAACATTCCATACACCTTTGATATTCCACATTTCTTTTTTCTTCGTTTGATATTTGTCATCCTTTGA                                                           ]
[-] EMBL CD092701             [                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCAAAACATAGTGTATTTGGAATCATTGTTGCTCTCCCTCTCTATCTCCCTTTAATATACATATCATGATAAATATGTAGTAAGTATATACAAAGTGGGTTTTTATTTTGTATACGGACTTGCTTTTTAATGCTTCATAATGCTCTGTCCTCCTAACTTACTTACTACTTTCACTATTTCCAATTATAGTTGTAACCAGTGTTGTCATGAAGGTTCTCAATATCTTTATTCAGAATTATTGATCCATATATTGTTTCCAGTAATGGATGATAAACATTCCATACACCTTTGATATTCCACATTTCTTTTTTCTTCGTTTGATATTTGTCATCCTTTGATGGCCTCTTTACTCTTGAACTACTTCGACTGTTTCATAGCATTTATTTATTGACTTTGA]
[-] EMBL CD092659             [                                                                                                                                                                                                                                                                                       CAAAACATTTTGTATTTGGAATCATTGTTGCTCTCCCTCTCTATCTCCCTTTAATATACATATCATGATAAATATGTGGTAAGTATATACAAAGTGGGTTTTTATTTTGTATACGGACTTGCTTTTTAATGCTCCATAATGCTCTGTCCTCCTAACTTACTTACTACTTTCACTATTTCCAATTATAGTTGTAACCAGTGTTGTCATGAAGGTTCTCAATATCTTTATTCAGAATTATTGATCCATATATTGTTTCCAGTAATGGATGATAAACATTCCATACACCTTTGATATTCCACATTTCTTTTTTCTTCGTTTGATATTTGTCATCCTTTGATGGCCTCTTTACTCTTGAACTACTTCGACTGTTTCATGGCATTTATTTATTGACTTTGA]


>consensus_4102#0 CGAGGACAACTTTTGTAATTTAATTTATGTTTGTTGCTATCGTTACACTTGGCTAGCAGT AGTAGTAGTATTATCACAACCATATCGTATATATTCTGTCTTATTTTTATAAGCATGTAA TTACATATCATTATCATTAACAACAACAACAAAACGACTTTACTTATGATCCTCGTTCCT ACTCTCTCATCTTGTATTAATCGGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGTAAATCTCAGATC TCAAATCATGCCTTTTACTCTATTTTTTTCCCCAATGATCAAAACATTTTGTATTTGGAA TCATTGTTGCTCTCCCTCTCTATCTCCCTTTAATATACATATCATGATAAATATGTAGTA AGTATATACAAAGTGGGTTTTTATTTTGTATACGGACTTGCTTTTTAATGCTTCATAATG CTCTGTCCTCCTAACTTACTTACTACTTTCACTATTTCCAATTATAGTTGTAACCAGTGT TGTCATGAAGGTTCTCAATATCTTTATTCAGAATTATTGATCCATATATTGTTTCCAGTA ATGGATGATAAACATTCCATACACCTTTGATATTCCACATTTCTTTTTTCTTCGTTTGAT ATTTGTCATCCTTTGATGGCCTCTTTACTCTTGAACTACTTCGACTGTTTCATAGCATTT ATTTATTGACTTTGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)