cluster # 4132

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Schistosoma mansoni
cluster # 4132 cluster # 4132 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4132#0 length = 847 sequences # 3

consensusID : consensus_4132#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 847
fasta sequence

                              [AGGCCAGACTCGGCA-GTAGCTGACCAGAAAGATGGTTCAAGCGAAATGGCAGTAGGACGCATGAGCAGCCAATGAGTTTGATTACCGGTTGGTGAAAATATATACTACACTTCTTTACCTTTTCAAGGTCGCTCAAGCTCGCGTTTGGTTAAATATAGCTCCGATTCTCGTAAGAACATGAAAAATGACTTACCGAAGAACTACAAAACAGGCTACAGAACTGAGCACAGATTGAGGAAATGTTTATCCTGTGATAAATTTCACTTACATAATTCATGTGTCTTGCATCATGCTAAGTGTTTTAAATGTTGTAAAATTGGACACATCCAGTCGGCGTGTAAAACTACTCTTCGTTTAGAACTCTGTAAATCGGATCTGATTAATTTGGATAACTTTAATAATCATATTCTGTCCTTATTTACGGCTTCCAATAATTCACTGCATACTCAAAATCGATTGGATTTGTTCACTGTAGTTGCATGGCACTTTACACGATTTTATTGTTGACACTGACAGAATTAAGTCCATCATTTAAGTTGGGAGGTTGTAGTCATTAAATTCATCTTCTATAATTAAGAATGCTTCAAGAACAACTTCCCTCACTAACCTCTGAAGACTGTTCTAATGAAATGCGGTTTGAGCATAACTGCAACGCCCTCTCACTCTGATGCTCAAGC-AAAAATATCAAGACCTTGAACACAAGCACCAATTCTATTACTGCTGCANAATTCAAAGACCCGGAGAGGAGATAAAGTCTTTCATTGTAGAATCGCCAGACCGTAAGCAAATGAAACAGTGATAGTAGCTTCTCGCCTAGCCCTGACTGTTGAGTCCAAAAAGCAATATC]

[+] EMBL CD084419             [AGGCCAGACTCGGCA GTAGCTGACCAGAAAGATGGTTCAAGCGAAATGGCAGTAGGACGCATGAGCAGCCAATGAGTTTGATTACCGGTTGGTGAAAATATATACTACACTTCTTTACCTTTTCAAGGTCGCTCAAGCTCGCGTTTGGTTAAATATAGCTCCGATTCTCGTAAGAACATGAAAAATGACTTACCGAAGAACTACAAAACAGGCTACAGAACTGAGCACAGATTGAGGAAATGTTTATCCTGTGATAAATTTCACTTACATAATTCATGTGTCTTGCATCATGCTAAGTGTTTTAAATGTTGTAAAATTGGACACATCCAGTCGGCGTGTAAAACTACTCTTCGTTTAGAACTCTGTAAATCGGATCTGATTAATTTGGATAACTTTAATAATCATATTCTGTCCTTATTTACGGCTTCCAATAATTCACTGCATACTCAAAATCGATTGGATTTGTTCACTGTAGTTGCATGGCACTTTACACGATTTTATTGTTGACACTGACAGAATTAAGTCCATCATTTAAGTTGGGAGGTTGTAGTCct                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD081687             [   CCATATTCGGCACGACGCTGACCANAAAGATGGTTCAAGCGAAATGGCAGTCGGACGCATGAGCAGCCAATGAGTTTGATTACCGGTTGGTGAAAATATATACTACACTTCTTTACCTTTTCAAGGTCGCTCAAGCTCGCGTTTGGTTAAATATAGCTCCGATTCTCGTAAGAACATGAAAAATGACTTACCGAAGAACTACAAAACAGGCTACAGAACTGAGCACAGATTGAGGAAATGTTTATCCTGTGATAAATTTCACTTACATAATTCATGTGTCTTGCATCATGCTAAGTGTTTTAAATGTTGTAAAATTGGACACATCCAGTCGGCGTGTAAAACTACTCTTCGTTTAGAACTCTGTAAATCGGATCTGATTAATTTGGATAACTTTAATAATCATATTCTGTCCTTATTTACGGCTTCCAATAATTCACTGCATACTCAAAATCGATTGGATTTGTTCACTGTAGTTGCATGGCACTTTACACGATTTTATTGTTGACACTGACAGAATTAAGTCCATCATTTAAGTTGGGAGGTTGTAGTCATTAAATTCATCTTCTATAATTAAGAATGCTTCAAGAACAACTTCCCTCACTAACCTCTGAAGACTGTTCTAATGAAATGCGGTTTGAGCATAACTGCAACGCCCTCTCACTCTGATGCTCAAGC AAAAATATCAAGACCTTGAACACAAGCACCAATTCTATTACTGCTGCANAATTCAAAGACCCGGAGAGGAGATAAAGTCTTTCATTGTAGAATCGCCAGACCGTAAGCAAATGAAACAGTGATAGTAGCTTCTCGCCTAGCCCTGACTGTTGAGTCCAAAAAGCAATATC]
[+] EMBL CD200941             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGTTTTAAATGTTGTAAAATTGGACACATCCAGTCGGCGTGTAAAACTACTCTTCGTTTAAAACTCTGTAAATCGGATCTGATTAATTTGGATAACTTTAATAATCATATTCTGTCCTTATTTACGGCTTCCAATAATTCACTGCATACTCAAAATCGATTGGATTTGTTCACTGTAGTTGCATGGCACTTTACACGGTTTTATTGTTGACACTGACAGAATTAAGTCCATCATTTAAGTTGGGAGGTTGTAGTCATTAAATTCATCTTCTATAATTAAGAATGCTTCAAGAACAACTTCCCTCACTAACCTCTGAAGACTGTTCTAATGAAATGCGGTTTGAGCATAACTGCAACGCCCTCTCACTCTGATGCTCAAGCAAAAAATATCAAGACCTTGAACACAAGCACCAATTCTATTACTGCTGCAAAATTCA                                                                                                                   ]




>consensus_4132#0
AGGCCAGACTCGGCAGTAGCTGACCAGAAAGATGGTTCAAGCGAAATGGCAGTAGGACGC
ATGAGCAGCCAATGAGTTTGATTACCGGTTGGTGAAAATATATACTACACTTCTTTACCT
TTTCAAGGTCGCTCAAGCTCGCGTTTGGTTAAATATAGCTCCGATTCTCGTAAGAACATG
AAAAATGACTTACCGAAGAACTACAAAACAGGCTACAGAACTGAGCACAGATTGAGGAAA
TGTTTATCCTGTGATAAATTTCACTTACATAATTCATGTGTCTTGCATCATGCTAAGTGT
TTTAAATGTTGTAAAATTGGACACATCCAGTCGGCGTGTAAAACTACTCTTCGTTTAGAA
CTCTGTAAATCGGATCTGATTAATTTGGATAACTTTAATAATCATATTCTGTCCTTATTT
ACGGCTTCCAATAATTCACTGCATACTCAAAATCGATTGGATTTGTTCACTGTAGTTGCA
TGGCACTTTACACGATTTTATTGTTGACACTGACAGAATTAAGTCCATCATTTAAGTTGG
GAGGTTGTAGTCATTAAATTCATCTTCTATAATTAAGAATGCTTCAAGAACAACTTCCCT
CACTAACCTCTGAAGACTGTTCTAATGAAATGCGGTTTGAGCATAACTGCAACGCCCTCT
CACTCTGATGCTCAAGCAAAAATATCAAGACCTTGAACACAAGCACCAATTCTATTACTG
CTGCANAATTCAAAGACCCGGAGAGGAGATAAAGTCTTTCATTGTAGAATCGCCAGACCG
TAAGCAAATGAAACAGTGATAGTAGCTTCTCGCCTAGCCCTGACTGTTGAGTCCAAAAAG
CAATATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case