cluster # 4158

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Schistosoma mansoni
cluster # 4158 cluster # 4158 Sequences # 3 consensus # 2

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consensus_4158#0 length = 900 sequences # 2

consensus_4158#1 length = 863 sequences # 1

consensusID : consensus_4158#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 900
fasta sequence

                              [TATATCAGAAATTGGATAATACTACCAAATCAGTAGCTGTGGATATCCAAGATGTGACATGGCGTTATACACAAAAGTTTTCAGAAGTTCAATCCCGTCGAAATATGATTAGGGAATCCGTATTGGCGTATAAATTAGCGGACATTCACACTGGTGCTGTCAAAAACTGGTCACTTAACAACAATCCGGCCGATATTGACCAAAAACCATACTGTTGGGATTCAATTATTGATGAATTGGTGAGTTTCCTTCATCCTTCAAAGTGTAATGATCAACTTCCGGGTCGTCAAACTGGATCGTTGGAATGGCGTCAAGCTCGTGGTGAACTGGGTCAGACTTCTCTGTCTGTTGAACCACTTCTTAAAGGATCAAAGTGTATTATTACCCCGTCTAATGCGGAACTTCAAAGTGGGATATTTCACTTACGTTATAATTCAGCTTTAAATATTTACCAACGTCCTTATTATTCTAATAATAATAGTAATAATGCAAAAACGGATACCTGATGTATTAGATTATCAATGTTCTACAAATTCACCAAAAGCGATTAATCAAGAGTCAACCAAATTGATTGAAAATGCTCGGAAAACCGGTTTATATGGATGGCAGTCTATGGTCTATCAGTGGAGAAATATTTTTCGAAAGGTGGAACTTGATTGGCACATGGTTTATTTAGCGCGTGAAGAGGACAGTAAACCTTCAGAAGATGGAATAATTATCTGGATGCTTGATTTAAGAAATACTAATTATCGTGTCGGTAAAGTTTCTATATTTACCAATATGGTATGTCATTCAACTGAATGTCATGCTCGTTTGGTACTTTGTTCCGGTGAATATCCGGCAAATAATAGTTGTAGTGGCCCAGAAGAAAATAAAAACCCACCATGTGTGCCTAACTCA]

[+] EMBL CD196519             [TATATCAGAAATTGGATAATACTACCAAATCAGTAGCTGTGGATATCCAAGATGTGACATGGCGTTATACACAAAAGTTTTCAGAAGTTCAATCCCGTCGAAATATGATTAGGGAATCCGTATTGGCGTATAAATTAGCGGACATTCACACTGGTGCTGTCAAAAACTGGTCACTTAACAACAATCCGGCCGATATTGACCAAAAACCATACTGTTGGGATTCAATTATTGATGAATTGGTGAGTTTCCTTCATCCTTCAAAGTGTAATGATCAACTTCCGGGTCGTCAAACTGGATCGTTGGAATGGCGTCAAGCTCGTGGTGAACTGGGTCAGACTTCTCTGTCTGTTGAACCACTTCTTAAAGGATCAAAGTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BF936037             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCGTTGGAATGGCGTCAAGCTCGTGGTGAACTGGGTCAGACTTCTCTGTCTGTTGAACCACTTCTTAAAGGATCAAAGTGTATTATTACCCCGTCTAATGCGGAACTTCAAAGTGGGATATTTCACTTACGTTATAATTCAGCTTTAAATATTTACCAACGTCCTTATTATTCTAATAATAATAGTAATAATGCAAAAACGGATACCTGATGTATTAGATTATCAATGTTCTACAAATTCACCAAAAGCGATTAATCAAGAGTCAACCAAATTGATTGAAAATGCTCGGAAAACCGGTTTATATGGATGGCAGTCTATGGTCTATCAGTGGAGAAATATTTTTCGAAAGGTGGAACTTGATTGGCACATGGTTTATTTAGCGCGTGAAGAGGACAGTAAACCTTCAGAAGATGGAATAATTATCTGGATGCTTGATTTAAGAAATACTAATTATCGTGTCGGTAAAGTTTCTATATTTACCAATATGGTATGTCATTCAACTGAATGTCATGCTCGTTTGGTACTTTGTTCCGGTGAATATCCGGCAAATAATAGTTGTAGTGGCCCAGAAGAAAATAAAAACCCACCATGTGTGCCTAACTCA]




>consensus_4158#0
TATATCAGAAATTGGATAATACTACCAAATCAGTAGCTGTGGATATCCAAGATGTGACAT
GGCGTTATACACAAAAGTTTTCAGAAGTTCAATCCCGTCGAAATATGATTAGGGAATCCG
TATTGGCGTATAAATTAGCGGACATTCACACTGGTGCTGTCAAAAACTGGTCACTTAACA
ACAATCCGGCCGATATTGACCAAAAACCATACTGTTGGGATTCAATTATTGATGAATTGG
TGAGTTTCCTTCATCCTTCAAAGTGTAATGATCAACTTCCGGGTCGTCAAACTGGATCGT
TGGAATGGCGTCAAGCTCGTGGTGAACTGGGTCAGACTTCTCTGTCTGTTGAACCACTTC
TTAAAGGATCAAAGTGTATTATTACCCCGTCTAATGCGGAACTTCAAAGTGGGATATTTC
ACTTACGTTATAATTCAGCTTTAAATATTTACCAACGTCCTTATTATTCTAATAATAATA
GTAATAATGCAAAAACGGATACCTGATGTATTAGATTATCAATGTTCTACAAATTCACCA
AAAGCGATTAATCAAGAGTCAACCAAATTGATTGAAAATGCTCGGAAAACCGGTTTATAT
GGATGGCAGTCTATGGTCTATCAGTGGAGAAATATTTTTCGAAAGGTGGAACTTGATTGG
CACATGGTTTATTTAGCGCGTGAAGAGGACAGTAAACCTTCAGAAGATGGAATAATTATC
TGGATGCTTGATTTAAGAAATACTAATTATCGTGTCGGTAAAGTTTCTATATTTACCAAT
ATGGTATGTCATTCAACTGAATGTCATGCTCGTTTGGTACTTTGTTCCGGTGAATATCCG
GCAAATAATAGTTGTAGTGGCCCAGAAGAAAATAAAAACCCACCATGTGTGCCTAACTCA

consensusID : consensus_4158#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 863
fasta sequence

                              [CATTAATTCGGCACGACGGGGATAATTATCTGGATGCTTGATTTAAGAAATACTAATTATCGTGTCGGTAAAGTTTCTATATTTACCAATATGGTATGTCATTCAACTGAATGTCATGCTCGTTTGGTACTTTGTTCCGGTGAATATCCGGCAAATAATAGTTTGTAGTGGCCCAGAAGAAAATAAAAACCCACCATGTGTGCCTAACTCATGTTTATGTCTTCAACCAGGTTCTGCTTCATTATTCAATTCAGAAGCTATGAGTGGAGCTGATTTTTTGACTTTAAAAGCTCGTCTATGGAATGATGATGAATCTACTGGGAAGCCATCTTCTGTGGCTTGGCAGCAAGCCCAACTATTTCGGCAAAAGGATAGTGATTTTGATACTTGGTCATTGGAATGGAAAGTTGAATTGGTGAAAATTAATGAAACAGTTAATTAAATAGAACTGGAAACGTGAACTGTATTATCGTTTCACGCGCACTTACACACACACACACACATACACAGTGACCTGGTTAACTATGCTGTTTTATTCATGAAGTCTTATATTTAAACAAATGTGTCAATTTTTTTTGGTAATGTAGATAAGTGTAACAGTACGCATATATATATGCATATTACTGTCAAGTTAATTCGTATGTTTCTTTCTTTCTCTCTTGTTTGTTTATCTTTTCATCTCATCTAATCATCCATTCTTTTTATCCCGAATTTTGTTATAATCTCAATCATATCATCTTTTTTTAATACTTAAACTGGGACTATTCTCAAGAATTTCTACTTTCTTATTGGCTGTTGTTTTGAGAACTACTTNCTTCCTTCTTTCTTTTGNTTTCTTGTTCTTTTTGCTAAAGTATTCCCTG]

[+] EMBL CD081666             [CATTAATTCGGCACGACGGGGATAATTATCTGGATGCTTGATTTAAGAAATACTAATTATCGTGTCGGTAAAGTTTCTATATTTACCAATATGGTATGTCATTCAACTGAATGTCATGCTCGTTTGGTACTTTGTTCCGGTGAATATCCGGCAAATAATAGTTTGTAGTGGCCCAGAAGAAAATAAAAACCCACCATGTGTGCCTAACTCATGTTTATGTCTTCAACCAGGTTCTGCTTCATTATTCAATTCAGAAGCTATGAGTGGAGCTGATTTTTTGACTTTAAAAGCTCGTCTATGGAATGATGATGAATCTACTGGGAAGCCATCTTCTGTGGCTTGGCAGCAAGCCCAACTATTTCGGCAAAAGGATAGTGATTTTGATACTTGGTCATTGGAATGGAAAGTTGAATTGGTGAAAATTAATGAAACAGTTAATTAAATAGAACTGGAAACGTGAACTGTATTATCGTTTCACGCGCACTTACACACACACACACACATACACAGTGACCTGGTTAACTATGCTGTTTTATTCATGAAGTCTTATATTTAAACAAATGTGTCAATTTTTTTTGGTAATGTAGATAAGTGTAACAGTACGCATATATATATGCATATTACTGTCAAGTTAATTCGTATGTTTCTTTCTTTCTCTCTTGTTTGTTTATCTTTTCATCTCATCTAATCATCCATTCTTTTTATCCCGAATTTTGTTATAATCTCAATCATATCATCTTTTTTTAATACTTAAACTGGGACTATTCTCAAGAATTTCTACTTTCTTATTGGCTGTTGTTTTGAGAACTACTTNCTTCCTTCTTTCTTTTGNTTTCTTGTTCTTTTTGCTAAAGTATTCCCTG]




>consensus_4158#1
CATTAATTCGGCACGACGGGGATAATTATCTGGATGCTTGATTTAAGAAATACTAATTAT
CGTGTCGGTAAAGTTTCTATATTTACCAATATGGTATGTCATTCAACTGAATGTCATGCT
CGTTTGGTACTTTGTTCCGGTGAATATCCGGCAAATAATAGTTTGTAGTGGCCCAGAAGA
AAATAAAAACCCACCATGTGTGCCTAACTCATGTTTATGTCTTCAACCAGGTTCTGCTTC
ATTATTCAATTCAGAAGCTATGAGTGGAGCTGATTTTTTGACTTTAAAAGCTCGTCTATG
GAATGATGATGAATCTACTGGGAAGCCATCTTCTGTGGCTTGGCAGCAAGCCCAACTATT
TCGGCAAAAGGATAGTGATTTTGATACTTGGTCATTGGAATGGAAAGTTGAATTGGTGAA
AATTAATGAAACAGTTAATTAAATAGAACTGGAAACGTGAACTGTATTATCGTTTCACGC
GCACTTACACACACACACACACATACACAGTGACCTGGTTAACTATGCTGTTTTATTCAT
GAAGTCTTATATTTAAACAAATGTGTCAATTTTTTTTGGTAATGTAGATAAGTGTAACAG
TACGCATATATATATGCATATTACTGTCAAGTTAATTCGTATGTTTCTTTCTTTCTCTCT
TGTTTGTTTATCTTTTCATCTCATCTAATCATCCATTCTTTTTATCCCGAATTTTGTTAT
AATCTCAATCATATCATCTTTTTTTAATACTTAAACTGGGACTATTCTCAAGAATTTCTA
CTTTCTTATTGGCTGTTGTTTTGAGAACTACTTNCTTCCTTCTTTCTTTTGNTTTCTTGT
TCTTTTTGCTAAAGTATTCCCTG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_4158#0      TATATCAGAAATTGGATAATACTACCAAATCAGTAGCTGTGGATATCCAAGATGTGACAT 60
consensus_4158#1      -----CATTAATTCGGCACGACGG--GGATAATTATCT--GGATGCTTGATTTAAGAAAT 51
                           **  **** *  *  **      ** * ** **  ****     *  *  ** **

consensus_4158#0      GGCGTTATACACAAAAGTTTTCAGAAGTTCAATCCCGTCGAAATATGATTAGGGAATCCG 120
consensus_4158#1      ACTAATTATCGT----GTCGGTAAAGTTTCTATATT-TACCAATATGGT-ATGTCATTCA 105
                           *   *      **    * *  *** **    *   ****** * * *  ** * 

consensus_4158#0      TATTGGCGTATAAATTAGCGGACA-TTCACACTGGTGC-TGTCAAAAACTGGTCACTTAA 178
consensus_4158#1      ACTGAATGTCATGCTCGTTTGGTACTTTGTTCCGGTGAATATCCGGCAAATAATAGTTTG 165
                        *    **     *     *  * **    * ****  * **    *      * **  

consensus_4158#0      CAACAATCCGGCCGATATTGACCAAAAACCATACTGTTGGGATTCAATTATTGATGAATT 238
consensus_4158#1      TAGTGGCCCAGAAGAAAATAAAAACCCACCATGTGTGCCTAACTCA--TGTTTATGTCTT 223
                       *     ** *  ** * * *  *   *****         * ***  * ** ***  **

consensus_4158#0      -GGTGAGTTTC--CTTCATCCTTCAA----AGTGTAATGA------TCAACTTCCGGGTC 285
consensus_4158#1      CAACCAGGTTCTGCTTCATTATTCAATTCAGAAGCTATGAGTGGAGCTGATTTTTTGACT 283
                           ** ***  ******  *****       *  ****         * **   *   

consensus_4158#0      GTCAAACTGGATCGTTGGAATGGCG-TCAAGCTCGTGGTGAACTGGGTCA---GACTTCT 341
consensus_4158#1      TTAAAAGCTCGTCTATGGAATGATGATGAATCTACTGGGAAGCCATCTTCTGTGGCTTGG 343
                       * ***     **  *******  * * ** **  ***  * *    *     * ***  

consensus_4158#0      CTGTCTGTTGAACCACTTCTTAAAGGATCAAAGTGTATTATTACCCCGTC--TAATGCGG 399
consensus_4158#1      CAGCAAGCCCAACTATTTCGGCAAAAGGATAGTGATTTTGATACTTGGTCATTGGAATGG 403
                      * *   *   *** * ***   **      *    * **  ***   ***  *     **

consensus_4158#0      AACTTCAAAGTGGGATATTTCACTTACGTTATAATTCAGCTTTAAATATTTACCAACGTC 459
consensus_4158#1      AAAGTTGAATTGGTGAAAATTAATGAAACAGTTAATTAAATAGAACTGGA-AACGTGAAC 462
                      **  *  ** ***   *  * * * *     * * * *  *  ** *    * *     *

consensus_4158#0      CTTATTATTCTAATAATAATAGTAATA-ATGCAAAAACGGATACCTGATGTATTAGATTA 518
consensus_4158#1      TGTATTATCGTTTCACGCGCACTTACACACACACACACACATACACAGTG-ACCTGGTTA 521
                        ******  *   *     * * * * *  ** * **  ****    ** *   * ***

consensus_4158#0      TCAATGTTCTACAAATTCACCAAAAGCGAT---TAATCAA--GAGTCAACCAAATTGATT 573
consensus_4158#1      ACTATGCTGTTTTA-TTCATGAAGTCTTATATTTAAACAAATGTGTCAATTTTTTTTGGT 580
                       * *** * *   * ****  **     **   *** ***  * *****     **   *

consensus_4158#0      GAAAATGCTCGGAAAACCGGTTTATATGGATGGCAGTCTATGGTCTATCAGTGGAGAAAT 633
consensus_4158#1      AATGTAGATAAGTGTAACAGTACGCATATATATATGCATATTACTGTCAAGTTAATTCGT 640
                       *    * *  *   * * **    **  **    *  ***        ***  *    *

consensus_4158#0      ATTTTTCGAAAGGTGGAACTTGATTGGCACATGGTTTATTTAGCGCGTGAAGAGGACAGT 693
consensus_4158#1      ATGTTTCTTTCTTTCTCTCTTGTTTGTTTATCTTTTCATCTCATCTAATCATCCATTCTT 700
                      ** ****      *    **** ***        ** ** *         *        *

consensus_4158#0      AAACCTTCAGAAGATGGAATAATTATCTGGATGCTTGATTTAAGAAATACT--AATTATC 751
consensus_4158#1      TTTATCCCGAATTTTGTTATAATCTCAATCATATCATCTTTTTTTAATACTTAAACTGGG 760
                             *  *   **  *****       **      ***    ******  ** *   

consensus_4158#0      GTGTCGGTAAAGTTTCTATATTTACCAATATGGTATGTCATTCAACTGAATGTCATGCTC 811
consensus_4158#1      ACTATTCTCAAGAATTTCTACTTTCT--TATTGGCTGTTGTTTTGAGAACTACTTNCTTC 818
                             * ***  * * ** ** *   *** *  ***  **      * *       **

consensus_4158#0      GTTTGGTACTTTGTTCCGGTGAATATCCGGCAAATAATAGTTGTAGTGGCCCAGAAGAAA 871
consensus_4158#1      CTTCTTTCTTTTGNTTTCTTGTTCTTTTTGCTAA-AGTATTCCCTG-------------- 863
                       **   *  **** *    **    *   ** ** * ** *    *              

consensus_4158#0      ATAAAAACCCACCATGTGTGCCTAACTCA 900
consensus_4158#1      -----------------------------