cluster # 4172

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4172 cluster # 4172 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4172#0 length = 790 sequences # 3

consensusID : consensus_4172#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 790
fasta sequence

                              [AACTTGAACCAATGTACACTTGTACCAATTTCTACGTTCATATTTTACTGACTGGCCATACCGTGTGCTTCGCTTTTCTTAAATTCGCAAGTCTGATACCAAATCTATGAAAAAAGGATTTACGTCTTCCTAATGGTTCACTTTATTTACAGTTGCCACATGTGTGACCACAGCATAGGCAGTCATTGTTGTCATTCACATAAAGCCGATGATTCCCCATCGTTTAGCTTGTACAGGTTTATTGATATACATAATGTAGAATGTTTGAATGAATCCGTTTCTGGAAGTGGTAAACTTGTTTTCAAGCCTTATGAGGATCGTAAAGATTCAACTGTTTATGTTGAAAGTGATGTTGATCAGGAGTTGTTATTTAACATACCGTTTACTGGAAATATAAAAGTAATGAGTATTATTATATCTGGTGCTGATACCGAACAACATCCAAGTCAAGTGTCGTTGTATAAAAATAAACCTTTTATGACATTTGAAGATTTAAATGCTGAATGTGAA-CAATCACTCGAACTAAC-TATTGATCCAAATGGTGAAGTGATATATCCATTGAAAATTTCACGCTTTTCTAATGTGCAAACACTGAGCTTACATTTCAGTGCTAATTACGGTGGTGATACAACACGAATTCACTACATTGGCTTGCGGGGAGATTATACTCCAGCACCGAGACGAGAAGCCGTTATTACTAATTACGAATTAACTCCAAATGTTTCCGATTTAAAAGACAACATATTACAAACTCAGAGTCGTTTTGTTGAATAAATATAAAAGTCTTGGG]

[-] EMBL CD170797             [AACTTGAACCAATGTACACTTGTACCAATTTCTACGTTCATATTTTACTGACTGGCCATACCGTGTGCTTCGCTTTTCTTAAATTCGCAAGTCTGATACCAAATCTATGAAAAAAGGATTTACGTCTTCCTAATGGTTCACTTTATTTACAGTTGCCACATGTGTGACCACAGCATAGGCAGTCATTGTTGTCATTCACATAAAGCCGATGATTCCCCATCGTTTAGCTTGTACAGGTTTATTGATATACATAATGTAGAATGTTTGAATGAATCCGTTTCTGGAAGTGGTAAACTTGTTTTCAAGCCTTATGAGGATCGTAAAGATTCAACTGTTTATGTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD132844             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTTGTTTTCAAGCCTTATGTGGATCGTAAAGATTCAACTGTTTATGTTGAAAGTGATGTTGATCAGGAGTTGTTATTTAACATACCGTTTACTGGAAATATAAAAGTAATGAGTATTATTATATCTGGTGCTGATACCGAACAACATCCAAGTCAAGTGTCGTTGTATAAAAATAAACCTTTTATGACATTTGAAGATTTAAATGCTGAATGTGAA CAATCACTCGAACTAAC TATTGATCCAAATGGTGAAGTGATATATCCATTGAAAATTTCACGCTTTTCTAATGTGCAAACACTGAGCTTACATTTCAGTGCTAATTACGGTGGTGATACAACACGAATTCACTACATTGGCTTGCGGGGAGATTA                                                                                                                             ]
[-] EMBL AA999508             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAATGTGAACCAATCACTCGAACTAACTTATTGACCCAAATGGTGAAGTGATATACCCATTGAAAATTTCACGCTTTTCTAATGTGCAAACACTGAGAAAACATTTCAGTGCTAATTACGGTGGTGATACAACACGAATTCACTACATTGGCTTGCGGGGAGATTATACTCCAGCACCGAGACGAGAAGCCGTTATTACTAATTACGAATTAACTCCAAATGTTTCCGATTTAAAAGACAACATATTACAAACTCAGAGTCGTTTTGTTGAATAAATATAAAAGTCTTGGG]




>consensus_4172#0
AACTTGAACCAATGTACACTTGTACCAATTTCTACGTTCATATTTTACTGACTGGCCATA
CCGTGTGCTTCGCTTTTCTTAAATTCGCAAGTCTGATACCAAATCTATGAAAAAAGGATT
TACGTCTTCCTAATGGTTCACTTTATTTACAGTTGCCACATGTGTGACCACAGCATAGGC
AGTCATTGTTGTCATTCACATAAAGCCGATGATTCCCCATCGTTTAGCTTGTACAGGTTT
ATTGATATACATAATGTAGAATGTTTGAATGAATCCGTTTCTGGAAGTGGTAAACTTGTT
TTCAAGCCTTATGAGGATCGTAAAGATTCAACTGTTTATGTTGAAAGTGATGTTGATCAG
GAGTTGTTATTTAACATACCGTTTACTGGAAATATAAAAGTAATGAGTATTATTATATCT
GGTGCTGATACCGAACAACATCCAAGTCAAGTGTCGTTGTATAAAAATAAACCTTTTATG
ACATTTGAAGATTTAAATGCTGAATGTGAACAATCACTCGAACTAACTATTGATCCAAAT
GGTGAAGTGATATATCCATTGAAAATTTCACGCTTTTCTAATGTGCAAACACTGAGCTTA
CATTTCAGTGCTAATTACGGTGGTGATACAACACGAATTCACTACATTGGCTTGCGGGGA
GATTATACTCCAGCACCGAGACGAGAAGCCGTTATTACTAATTACGAATTAACTCCAAAT
GTTTCCGATTTAAAAGACAACATATTACAAACTCAGAGTCGTTTTGTTGAATAAATATAA
AAGTCTTGGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case