cluster # 4211

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Schistosoma mansoni
cluster # 4211 cluster # 4211 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4211#0 length = 717 sequences # 3

consensusID : consensus_4211#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 717
fasta sequence

                              [TTGTCGAATCTATTTCTTGTCAAAATAATTCAATTGATGGATGGGGTTTCCTTAAAAGAAAACTAAATATCTCTCATACTGAAGCTCGTAACTTGGATGCGGAAGGAAGAGTATTGGGTCTTCAGTTTTCTACTGATATATTTACAACCTTTCGAACTCCAGACGAAATCCGGCCGCTGATTGTGCTGTCCATATATTTTCCCAGGTTAAATCCAGAAAACGTTGAACGTTTGAATTACAAACATCTTTTCCAGTCTGCTGTACAACTTTGCATTGAATCACTTCTAATAGAAAACAACGTAGTTATTGCTGGGGACTTTAATATTTGTCACAAAATGATTGATCATTGTGCTCCAGACGAACTTATGATGGATAAGTTTTCAAACTCTTTTCGCCAGTGGTTTGATCAGTTGTTGATTGAAGAGCAACAAGACGTAAGTCTTGATAATCAAAGCAGTGTCGGTTTAAGAAGATTCGTGGATATCTTCAGGCTACTCCATCCTCATCG-AAAAAATGCTTTTACGTGTTGGTCATCGCGCACGAATGCTCGTCAAACAAACTATGGAGTCAGACTGGATTATATTTTATTCGACATGAAACTTGTGGAGATTATCACCACTATATCAGATAACA--ATACAAGCAGACCTGATGTCTCATATAAATGGATCTGATCATTGCCCNATATATGCAGATCTACCGTATTTTTACAATTCAGAT]

[-] EMBL CD161148             [TTGTCGAATCTATTTCTTGTCAAAATAATTCAATTGATGGATGGGGTTTCCTTAAAAGAAAACTAAATATCTCTCATACTGAAGCTCGTAACTTGGATGCGGAAGGAAGAGTATTGGGTCTTCAGTTTTCTACTGATATATTTACAACCTTTCGAACTCCAGACGAAATCCGGCCGCTGATTGTGCTGTCCATATATTTTCCCAGGTTAAATCCAGAAAACGTTGAACGTTTGAATTACAAACATCTTTTCCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD079268             [                                                                                           CTTGGATGCGGAAGGAAGAGTATTGGGTCTTCAGTTTTCTACTGATATATTTACAACCTTTCGAACTCCAGACGAAATCCGGCCGCTGATTGTGTTGTCCATATATTTTCCCAGGTTAAATCCAGAAAACGTTGAACGTTTGAATTACAAACATCTTTTCCAGTCTGCTGTACAACTTTGCATTGAATCACTTCTAATAGAAAACAACGTAGTTATTGCTGGGGACTTTAATATTTGTCACAAAATGATTGATCATTGTGCTCCAGACGAACTTATGATGGATAAGTTTTCAAACTCTTTTCGCCAGTGGTTTGATCAGTTGTTGATTGAAGAGCAACAAGACGTAAGTCTTGATAATCAAAGCAGTGTCGGTTTAAGAAGATTCGTGGATATCTTCAGGCTACTCCATCCTCATCG AAAAAATGCTTTTACGTGTTGGTCATCGCGCACGAATGCTCGTCAAACAAACTATGGAGTCAGACTGGATTATATTTTATTCGACATGAAACTTGTGGAGATTATCACCACTATATCAGATAACA  ATACAAGCAGACCTGATGTCTCATATAAATGGATCTGATCATTGCCCNATATATGCAGATCTACCGTATTTTTACAATTCAGA ]
[-] EMBL CD066401             [                                                                                                                                                                                                                                                                        AACTTTGCATTGAATCACTTCTAATAGAAAACAACGTAGTTATTGCTGGGGACTTTAATATTTGTCACAAAATGATTGATCATTGTGCTCCAGACGAACTTATGATGGATAAGTTTTCAAACTCTTTTCGCCAGTGGTTTGATCAGTTGTTGATTGAAGAGCAACAAGACGTAAGTCTTGATAATCAAAGCAGTGTCGGTTTAAGAAGATTCGTGGATATCTTCAGGCTACTCCATCCTCATCGAAAAAAATGCTTTTACGTGTTGGTCATCGCGCACGAATGCTCGTCAAACAAACTATGGAGTCAGACTGGATTATATTTTATTCGACATGAAACTTGTGGAGATTATCACCACTATATCAGATAACAATATACAAGCAGACCTGATGTCTCATATAAATGGATCTGATCATTGCCCAATATATGCAGATCTACCGTATTTTTACAATTCAGAT]




>consensus_4211#0
TTGTCGAATCTATTTCTTGTCAAAATAATTCAATTGATGGATGGGGTTTCCTTAAAAGAA
AACTAAATATCTCTCATACTGAAGCTCGTAACTTGGATGCGGAAGGAAGAGTATTGGGTC
TTCAGTTTTCTACTGATATATTTACAACCTTTCGAACTCCAGACGAAATCCGGCCGCTGA
TTGTGCTGTCCATATATTTTCCCAGGTTAAATCCAGAAAACGTTGAACGTTTGAATTACA
AACATCTTTTCCAGTCTGCTGTACAACTTTGCATTGAATCACTTCTAATAGAAAACAACG
TAGTTATTGCTGGGGACTTTAATATTTGTCACAAAATGATTGATCATTGTGCTCCAGACG
AACTTATGATGGATAAGTTTTCAAACTCTTTTCGCCAGTGGTTTGATCAGTTGTTGATTG
AAGAGCAACAAGACGTAAGTCTTGATAATCAAAGCAGTGTCGGTTTAAGAAGATTCGTGG
ATATCTTCAGGCTACTCCATCCTCATCGAAAAAATGCTTTTACGTGTTGGTCATCGCGCA
CGAATGCTCGTCAAACAAACTATGGAGTCAGACTGGATTATATTTTATTCGACATGAAAC
TTGTGGAGATTATCACCACTATATCAGATAACAATACAAGCAGACCTGATGTCTCATATA
AATGGATCTGATCATTGCCCNATATATGCAGATCTACCGTATTTTTACAATTCAGAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case