cluster # 4213

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Schistosoma mansoni
cluster # 4213 cluster # 4213 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4213#0 length = 221 sequences # 3

consensusID : consensus_4213#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 221
fasta sequence

                              [GTGTATGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTATACAACATTGATATACCTAA--CCCC-CCCCACCCACATACATACCTACATACATACCCATATGTAGGCATGGATACATGTATTATTGTTAATTGTATAACATATCTTTCTTTGTTTAGATTTTGTTTTTTTTTTCTTTCATTGTTTGTTTATTTATTAAATTATTTACTATGAAGGTTTTTAAAAACCTTT]

[+] EMBL CD081838             [GTGTATGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTATACAACATTGATATACCTAACCCCCC CCCCACCCACATACATACCTACATACATACCCATATGTAGGCATGGATACATGTATTATTGTTAATTGT                                                                                                ]
[-] EMBL CD075053             [ TGTATGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTATACAACATTGATATACCTAA  CCCCTCCCCACCCACATACATACCTACATACATACCCATATGTAGGCATGGATACATGTATTATTGTTAATTGTA                                                                                               ]
[+] EMBL AI975895             [ggGTATGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTATACAACATTGATATACCTAA  CCCC CCCCACCCACATACATACCTACATACATACCCATATGTAGGCATGGATACATGTATTATTGTTAATTGTATAACATATCTTTCTTTGTTTAGATTTTGTTTTTTTTTTCTTTCATTGTTTGTTTATTTATTAAATTATTTACTATGAAGGTTTTTAAAAACCTTT]




>consensus_4213#0
GTGTATGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTATACAACATTGATATACCTAACCCCCCCC
ACCCACATACATACCTACATACATACCCATATGTAGGCATGGATACATGTATTATTGTTA
ATTGTATAACATATCTTTCTTTGTTTAGATTTTGTTTTTTTTTTCTTTCATTGTTTGTTT
ATTTATTAAATTATTTACTATGAAGGTTTTTAAAAACCTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case