cluster # 4272

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4272 cluster # 4272 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4272#0 length = 612 sequences # 3

consensusID : consensus_4272#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 612
fasta sequence

                              [AAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTGTTAGACAAGTAGAGGTGTTGTTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACGAGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAGAAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAATGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGTGTAAATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTACTATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTTCCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAATTTCAGCCAATTCATGAATATGATACTCGGATAGGATAATGAATGTTTTTAAAGTAGAATCCATACGACGTGCACAATCTAAACATCTAACAACCAATTTTTTATCTTGAGATAAAACGAATAAAATATTGAATACTTCA]

[+] EMBL CD169216             [AAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTGTTAGACAAGTAGAGGTGTTGCTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACGAGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAGAAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAATGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGTGTAAATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTACTATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTTCCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAATTTCAGCCAATTCATGAATATGATACTCGGATAGGATAATGAATGTTTTTAAAGTAGAATCCATACGACGTGCACAATCTAAACATCTAACAACCAATTTTTTATCTTGAGATAAAACGAATAAAATATTGAATACTTCA]
[+] EMBL CD169264             [AAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTGTTAGACAAGTAGAGGTGTTGTTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACGAGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAGAAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAATGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGTGTAAATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTACTATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTTCCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAATTTCAGCCAATTCATGAATATGATACTCGGATAGGATAATGAATGTTTTTAAAGTAGAATCCATACGACGTGCACAATCTAAACATCTAACAACCAATTTTTTATCTTGAGATAAAACGAATAAAATATTGAATACTTC ]
[+] EMBL CD169700             [gAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTGTTAGACAAGTAGAGGTGTTGTTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACGAGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAGAAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAATGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGCGTAAATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTACTATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTTCCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAACTTCAGCCAATTCATGAATATGATACTCCGATAGGATAATGAATGTT                                                                                             ]




>consensus_4272#0
AAATAGTGATTATACAGTTAACAAACAGTAAAAAGAAACTTTAACGTACAATATATTTTG
TTAGACAAGTAGAGGTGTTGTTTGTTTTTTGGAATTAGTACTGAAATCTTACAAAATACG
AGGGAACATTTAAAGAATAGAAGAAATTAACCATACATAAGGAAATGAAAATACATTAAG
AAGTTGATTACTTGAGTGGTTAATTTCTAACTTGAAAATTTGTTATATTATACAAATTAA
TGACCACAGAAAATTTTCAATGCAATGTCACAACAACGAATAACAATGAAAAATGTGTAA
ATGTGAATGTCTCATTCTGGTGGTGTATATTACACAAAAGTGAAAATGTGCTCCATTTAC
TATTCAGTAATAACAATATGTACACATCAATTCATAGTAATGTAAGTAGATTAAGTTTTT
CCCACTGGATAAGCTGTGATAGGTTGAGTTTGAAGTTGAAATTTGTCAAAAATTTCAGCC
AATTCATGAATATGATACTCGGATAGGATAATGAATGTTTTTAAAGTAGAATCCATACGA
CGTGCACAATCTAAACATCTAACAACCAATTTTTTATCTTGAGATAAAACGAATAAAATA
TTGAATACTTCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case