cluster # 4279

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Schistosoma mansoni
cluster # 4279 cluster # 4279 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4279#0 length = 670 sequences # 3

consensusID : consensus_4279#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 670
fasta sequence

                              [TTAGCACGTGTATACTACAATGATAATGAACCTGACTGTATGATATGTGGGCGAGAATAACAATGATTGGTTGTTTTGCTGAGTCAGATATTAGATAGGATGACAGGTGTTATACGTGTTATATATATTCCCCTATCCTTATTATGTATTGACTGTTATTGGTTGACTGTTCCTTGTTGTTGGATTGTGTCGGGTTTTGGTGTGGAAATATATTGACGTTATAGTCAGGCTAATCTCGTTCTTGATCCGAGTTGTGTTGAAGTCCTGTAGAATAGACACTGGGTGGGAAATCTAGTGTAGATATTCGTCTAAGGTAAATTAATGTCCCACATACGTGTAAAAAGTGAAAAGACTGTCATAACAGGTTCGCACTAGACCCAGCTTTCACGCCAGTTGAAACTCATCAGTTTGATCTATGGGAATTTGATCAGCGCTAAGGATTAGGTATACAATACTCATAGACCAATCAGCTATAATTTACGGTTGTTACGATCCGTAACGTCGCGTGATCACGAATACTATGATAATGCCTGTATCTCAAGTAACTATGAGAACATTTACNGGGATTACTAAATCTCATTAGCAATATATGTGACGACTCTNTTTTGTGTTATATGCTAAAGGTTAACAACCAAGTTGTTTACTGAAGTAAAGTATGTTGGATTAAAAC]

[+] EMBL CD120017             [TTAGCACGTGTATACTACAATGATAATGAACCTGACTGTATGATATGTGGGCGAGAATAACAATGATTGGTTGTTTTGCTGAGTCAGATATTAGATAGGATGACAGGTGTTATACGTGTTATATATATTCCCCTATCCTTATTATGTATTGACTGTTATTGGTTGACTGTTCCTTGTTGTTGGATTGTGTCGGGTTTTGGCGTGGAAATATATTGACGTTATAGTCAGGCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD120114             [TTAGCACGTGTATACTACAATGATAATGAACCTGACTGTATGATATGTGGGCGAGAGTAACAATGATTGGTTGTTTTGCTGAGTCAGATATTAGATAGGATGACAGGTGTTATACGTGTTATATATATTCCCCTATCCTTATTATGTATTGACTGTTATTGGTTGACTGTTCCTTGTTGTTGGATTGTGTCGGGTTTTGGTGTGGAAATATATTGACGTTATAGTCAGGCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD195157             [                                                                                                                                                                                     GGATTGTGTCGGATTTTGGTGTGGAAATATATTGACGTTATAGTCAGGCTAATCTCGTTCTTGATCCGAGTTGTGTTGAAGTCCTGTAGAATAGACACTGGGTGGGAAATCTAGTGTAGATATTCGTCTAAGGTAAATTAATGTCCCACATACGTGTAAAAAGTGAAAAGACTGTCATAACAGGTTCGCACTAGACCCAGCTTTCACGCCAGTTGAAACTCATCAGTTTGATCTATGGGAATTTGATCAGCGCTAAGGATTAGGTATACAATACTCATAGACCAATCAGCTATAATTTACGGTTGTTACGATCCGTAACGTCGCGTGATCACGAATACTATGATAATGCCTGTATCTCAAGTAACTATGAGAACATTTACNGGGATTACTAAATCTCATTAGCAATATATGTGACGACTCTNTTTTGTGTTATATGCTAAAGGTTAACAACCAAGTTGTTTACTGAAGTAAAGTATGTTGGATTAAAAC]




>consensus_4279#0
TTAGCACGTGTATACTACAATGATAATGAACCTGACTGTATGATATGTGGGCGAGAATAA
CAATGATTGGTTGTTTTGCTGAGTCAGATATTAGATAGGATGACAGGTGTTATACGTGTT
ATATATATTCCCCTATCCTTATTATGTATTGACTGTTATTGGTTGACTGTTCCTTGTTGT
TGGATTGTGTCGGGTTTTGGTGTGGAAATATATTGACGTTATAGTCAGGCTAATCTCGTT
CTTGATCCGAGTTGTGTTGAAGTCCTGTAGAATAGACACTGGGTGGGAAATCTAGTGTAG
ATATTCGTCTAAGGTAAATTAATGTCCCACATACGTGTAAAAAGTGAAAAGACTGTCATA
ACAGGTTCGCACTAGACCCAGCTTTCACGCCAGTTGAAACTCATCAGTTTGATCTATGGG
AATTTGATCAGCGCTAAGGATTAGGTATACAATACTCATAGACCAATCAGCTATAATTTA
CGGTTGTTACGATCCGTAACGTCGCGTGATCACGAATACTATGATAATGCCTGTATCTCA
AGTAACTATGAGAACATTTACNGGGATTACTAAATCTCATTAGCAATATATGTGACGACT
CTNTTTTGTGTTATATGCTAAAGGTTAACAACCAAGTTGTTTACTGAAGTAAAGTATGTT
GGATTAAAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case