cluster # 4334

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Schistosoma mansoni
cluster # 4334 cluster # 4334 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4334#0 length = 811 sequences # 3

consensusID : consensus_4334#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 811
fasta sequence

                              [TAATGTTAATTAAGGAAAAAAGCATATGTTACATGAGTGGTAATATCTATATGTTGTAAATAAGTTTCTGAAATAAATGTATGTATGATTTCAATGTCACATCTGATCTAAATTTTAATTGATCAATATCGATAAAAATGGACGAAAACAAGCGAAATAATCCACACGCAGAGAAGTCCCAAGTAATTACTGAATGGGAAAAAAGAGGAAATAATTTGCACACACGAATAGATTTTGCATAGGGTACAGTAAATCATCGTAAATAAATAAATAAAGTCATCCGACTGACAACTAATTGCAGATATCAAATGAATAACAGATGTAAAAAGAAAGAGAATATAATAATACAGATATTGGATTTATGATGAAAAAAGGAAGT-TCACATAATTAAGGATGAAAATGCATTAAA-AT-GATTAATACTGACTGAGGATGACAGTAAACAAACGGTGGAGAAGGATACGAAAAGTAAGAAGAACAAGTAGTATGAATGTGAAGATGATTGAAAAGAGTAATCAACTTTTCTTTCGAAAAAACACCAACAAACCAAACAGCTCAACATATTGGATGCATGTTATTTATACTTTATGTATTTATAGCGCAACAACGTGATTTTAGGTAGCTTTTCTATTCTGATCAACACCTTCATATTGAACTGAATGCATAAAGACATTATTGGCATTATTATCAACATCATCACGTTTAATATTACGACTATTATTAGCAGTAGTGGTATTAAACGTAATATCATTGATCTCATTGTTTTCACCTTTAACAGAATTACTAATCCATTTAGTGGCCCATATATTAACAC]

[-] EMBL AI618783             [TAATGTTAATTAAGGAAAAAAGCATATGTTACATGAGTGGTAATATCTATATGTTGTAAATAAGTTTCTGAAATAAATGTATGTATGATTTCAATGTCACATCTGATCTAAATTTTAATTGATCAATATCGATAAAAATGGACGAAAACAAGCGAAATAATCCACACGCAGAGAAGTCCCAAGTAATTACTGAATGGGAAAAAAGAGGAAATAATTTGCACACACGAATAGATTTTGCATAGGGTACAGTAAATCATCGTAAATAAATAAATAAAGTCATCCGACTGACAACTAATTGCAGATATCAAATGAATAACAGATGTAAAAAGAAAGAGAATATAATAATACAGATATTGGATTTATGATGAAAAAAGGAAGTAGCACATAATTAAGGATGAAAATGCATTAAAGCTCGATTAATACTGACTGAGGATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD117264             [                                                                                                                                                                                                                                                              CATCGTAAATAAATAAATAAAGTCATCCGACTGACAACTAATTGCAGATATCAAATGAATAACAGATGTAAAAAGAAAGAGAATATAATAATACAGATATTGGATTTATGATGAAAAAAGGAAGT TCACATAATTAAGGATGAAAATGCATTAAA AT GATTAATACTGACTGAGGATGACAGTAAACAAACGGTGGAGAAGGATACGAAAAGTAAGAAGAACAAGTAGTATGAATGTGAAGATGATTGAAAAGAGTAATCAACTTTTCTTTCGAAAAAACACCAACAAACCAAACAGCTCAACATATTGGATGCATGTTATTTATACTTTATGTATTTATAGCGCAACAACGTGATTTTAGGTAGCTTTTCTATTCTGATCAACACCTTCATATTGAACTGAATGCATAAAGACATTATTGGCATTATTATCAACATCATCACGTTTAATATTACGACTATTATTAGCAGTAGTGGTATTAAACGTAATATCATTGATCTCATTGTTTTCACCTTTAACAGAATTACTAATCCATTTAGTGGCCCATATATTAACAC]
[+] EMBL CD169497             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAATAATACAGATATTGGATTTATGATGAAAAAAGGAAGT TCACATAATTAAGGATGAAAATGCATTAAA AT GATTAATACTGACTGAGGATGACAGTAAACAAACGGTGGAGAAGGATACGAAAAGTAAGAAGAACAAGTAGTATGAATGTGAAGATGATTGAAAAGAGTAATCAACTTTTCTTTCGAAAAAACACCAACAAACCAAACAGCTCAACATATTGGATGCATGTTATTTATACTTTATGTATTTATAGCGCAACAACGTGATTTTAGGTAGCTTTTCTATTCTGATCAACACCTTCATATTGAACTGAAGGCATAAAGACATTATTGGCATTATT                                                                                                                                ]




>consensus_4334#0
TAATGTTAATTAAGGAAAAAAGCATATGTTACATGAGTGGTAATATCTATATGTTGTAAA
TAAGTTTCTGAAATAAATGTATGTATGATTTCAATGTCACATCTGATCTAAATTTTAATT
GATCAATATCGATAAAAATGGACGAAAACAAGCGAAATAATCCACACGCAGAGAAGTCCC
AAGTAATTACTGAATGGGAAAAAAGAGGAAATAATTTGCACACACGAATAGATTTTGCAT
AGGGTACAGTAAATCATCGTAAATAAATAAATAAAGTCATCCGACTGACAACTAATTGCA
GATATCAAATGAATAACAGATGTAAAAAGAAAGAGAATATAATAATACAGATATTGGATT
TATGATGAAAAAAGGAAGTTCACATAATTAAGGATGAAAATGCATTAAAATGATTAATAC
TGACTGAGGATGACAGTAAACAAACGGTGGAGAAGGATACGAAAAGTAAGAAGAACAAGT
AGTATGAATGTGAAGATGATTGAAAAGAGTAATCAACTTTTCTTTCGAAAAAACACCAAC
AAACCAAACAGCTCAACATATTGGATGCATGTTATTTATACTTTATGTATTTATAGCGCA
ACAACGTGATTTTAGGTAGCTTTTCTATTCTGATCAACACCTTCATATTGAACTGAATGC
ATAAAGACATTATTGGCATTATTATCAACATCATCACGTTTAATATTACGACTATTATTA
GCAGTAGTGGTATTAAACGTAATATCATTGATCTCATTGTTTTCACCTTTAACAGAATTA
CTAATCCATTTAGTGGCCCATATATTAACAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case