cluster # 4382

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Schistosoma mansoni
cluster # 4382 cluster # 4382 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4382#0 length = 773 sequences # 3

consensusID : consensus_4382#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 773
fasta sequence

                              [AAAGAATTTTAAAGGAAAACTATAGACATACCACACACACACATACCATAAATGTAGATAACGATTCTTCATTACTTCTAATATTCATACCGTGCTCATTTGATTTGCTCAAAAGTCTTTCTATTAATTGAATATATTTTATCAATAAATATAATTTCTCTTTATATGTATACCATAGTTTGTTAACAAAATGAATTAAATTGATCTAAAATATAACATTATAATAATATTGCAATTGTTTAATGCATTTACGATTCATTGAATTGACCAGTTCTAATAAATTGGAAAGATAGAGAAAGAAAAAGTTCCAAGAAAAACGTCCTATCAAAACAAAAGAGAGTAAATCTACAAGTACTACACA-CATA-CACATATAATAAGGAAACTGGTATCTGTTCAACGTTATTCTTAAATGTAAAGAATAACAAGA-GTATTTTAATTTGGATTCACCTTTTCATTTATCACTCATTTTCTCTTTGAATTGTATCGTATAATAATAATTTGGAAATTTCAACGATAATCGAAGTGCTATTATTACTAACGTCTAAAAATTTGTAAAAGAAGATATAACTAATTCTCTTCTTTTGTAGAGAGGTAGGGTATTAGTACCATTATTATTCGTAGTAACAGTATTAGGGGGAAGTCCTTTGGTTGTTTTTCAATTAACTAGCTACAATCAAACAATTCTATTATTATTATTAATTATAATAAATAAGAAAACAATATATGATCAAAAAGAAGTTGACGAACCACACAAAAGAAAACCATCAGTACAA]

[+] EMBL BF936154             [AAAGAATTTTAAAGGAAAACTATAGACATACCACACACACACATACCATAAATGTAGATAACGATTCTTCATTACTTCTAATATTCATACCGTGCTCATTTGATTTGCTCAAAAGTCTTTCTATTAATTGAATATATTTTATCAATAAATATAATTTCTCTTTATATGTATACCATAGTTTGTTAACAAAATGAATTAAATTGATCTAAAATATAACATTATAATAATATTGCAATTGTTTAATGCATTTACGATTCATTGAATTGACCAGTTCTAATAAATTGGAAAGATAGAGAAAGAAAAAGTTCCAAGAAAAACCTCCTATCAAAACAAAAGAGAGTAAATCTACAAGTACTACACACCATACCCCATATAATAAGGAAACTGGTATCTGTTCAACGTTATTCTTAAATGTAAAGAATAACAAGA GTATTTTAATTTGGATTCACCTTTTCATTTATCACTCATTTTCTCTTTGAATTGTATCGTATAATAATAATTTGGAAATTTCAACGATAATCGAAGTGCTATTATT                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD122312             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GAAAAAGTCCCAAGAAAAACGTCCTATCAAAACAAAAGAGAGTAAATCTACAAGTTCTACACA CATA CACATATAATAAGGAAACTGGTATCTGTTCTACGTTATTCTTAAATGTAAACAATAACAAGACGT TTTTAATTTGGATTCACCTTTTCATTTATCACTCATTTCCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD122353             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAAAAGTTCCAAGAAAAACGTCCTATCAAAACAAAAGAGAGTAAATCTACAAGTACTACACA CATA CACATATAATAAGGAAACTGGTATCTGTTCAACGTTATTCTTAAATGTAAAGAATAACAAGA GTATTTTAATTTGGATTCACCTTTTCATTTATCACTCATTTTCTCTTTGAATTGTATCGTATAATAATAATTTGGAAATTTCAACGATAATCGAAGTGCTATTATTACTAACGTCTAAAAATTTGTAAAAGAAGATATAACTAATTCTCTTCTTTTGTAGAGAGGTAGGGTATTAGTACCATTATTATTCGTAGTAACAGTATTAGGGGGAAGTCCTTTGGTTGTTTTTCAATTAACTAGCTACAATCAAACAATTCTATTATTATTATTAATTATAATAAATAAGAAAACAATATATGATCAAAAAGAAGTTGACGAACCACACAAAAGAAAACCATCAGTACAA]




>consensus_4382#0
AAAGAATTTTAAAGGAAAACTATAGACATACCACACACACACATACCATAAATGTAGATA
ACGATTCTTCATTACTTCTAATATTCATACCGTGCTCATTTGATTTGCTCAAAAGTCTTT
CTATTAATTGAATATATTTTATCAATAAATATAATTTCTCTTTATATGTATACCATAGTT
TGTTAACAAAATGAATTAAATTGATCTAAAATATAACATTATAATAATATTGCAATTGTT
TAATGCATTTACGATTCATTGAATTGACCAGTTCTAATAAATTGGAAAGATAGAGAAAGA
AAAAGTTCCAAGAAAAACGTCCTATCAAAACAAAAGAGAGTAAATCTACAAGTACTACAC
ACATACACATATAATAAGGAAACTGGTATCTGTTCAACGTTATTCTTAAATGTAAAGAAT
AACAAGAGTATTTTAATTTGGATTCACCTTTTCATTTATCACTCATTTTCTCTTTGAATT
GTATCGTATAATAATAATTTGGAAATTTCAACGATAATCGAAGTGCTATTATTACTAACG
TCTAAAAATTTGTAAAAGAAGATATAACTAATTCTCTTCTTTTGTAGAGAGGTAGGGTAT
TAGTACCATTATTATTCGTAGTAACAGTATTAGGGGGAAGTCCTTTGGTTGTTTTTCAAT
TAACTAGCTACAATCAAACAATTCTATTATTATTATTAATTATAATAAATAAGAAAACAA
TATATGATCAAAAAGAAGTTGACGAACCACACAAAAGAAAACCATCAGTACAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case