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Schistosoma mansoni
cluster # 4415 cluster # 4415       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4415#0 length = 515 sequences # 3  

consensusID : consensus_4415#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 515
fasta sequence
                              [GTTTTGAGTTTGTTACATATAGTGGTGAGGGTTGTAATATTGATTTTTGGTGAGTACAGTACANATTTAGTTAGTTTGTTGTATTTTTATGGNCATGGGTGTCCTGTAAGTGCAATGTTTATATTTATATGATGAGGTTATAGGTGCATATTGTCTCNAAAAAGGTTAATTTTANCAACTGTATTTTGTTCAGTTATTTCCATCCAGGCAGTAAGTGTCGTGGTGTTTATGGGTGTATCNAGTTNCCCNCCAACTTTACAGTTTTTTGGANAAGTGGTANTGGCCGTTATAANTCTATNAAAACAGGATTTTGTATTGATTTTANCANCAGTTATAACTTTGTNNGGGGGTAAATTGCTAGGATTAATGGTATTGGGTTTAGTTATAAATNCATTATTAAATAGGAAAGGTGTTATAGTAAGGGGTATAAAAGGTTTGCTAGTTTATGTNATTTACTTTATATTAATAGGACTATTANTGTTTATGGTAGTTTAAGTTTATCNCAGGATNCTAGT]

[+] EMBL AA559631             [GTTTTGAGTTTGTTACATATAGTGGTGAGGGTTGTAATATTGATTTTTGGTGAGTACAGTACANATTTAGTTAGTTTGTTGTATTTTTATGGNCATGGGTGTCCTGTAAGTGCAATGTTTATATTTATATGATGAGGTTATAGGTGCATATTGTCTCNAAAAAGGTTAATTTTANCAACTGTATTTTGTTCAGTTATTTCCATCCAGGCAGTAAGTGTCGTGGTGTTTATGGGTGTATCNAGTTNCCCNCCAACTTTACAGTTTTTTGGANAAGTGGTANTGGCCGTTATA                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AA559559             [                                                                                                                                                          CTCGAAANTGGTTAATTTTANCAACTGTATTTTGTNCAGTTATTTCCATNCAGGCAGTAAGTGTCGTGGTGTTTATGGGTGTATCAAGTTTCCCNCCAACTTTACAGTTTTTTGGANAANTGGTAGTGGCCGTTATAANTCTATNAAAACAGGATTTTGTATTGATTTTANCANCAGTTATAACTTTGTNNGGGGGTAAATTGCTAGGATTAATGGTATTGGGTTTAGTTATAAATNCATTATTAAATAGGAAAGGTGTTATAGTAAGGGGTATAAAAGGTTTGCTAGTTTATGT                                                                  ]
[+] EMBL SM274                [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTAGATTGTTAGGATTAATGGTATTGGGTTTAGTTATAAATNCATTATTAGATAGGAAAGGTGTTATAGTAAGGGGTNTNNAAGGTTTGCTAGTTTATGTNATTTACTTTATATTAATAGGACTATTANTGTTTATGGTAGTTTAAGTTTATCNCAGGATNCTAGT]


>consensus_4415#0 GTTTTGAGTTTGTTACATATAGTGGTGAGGGTTGTAATATTGATTTTTGGTGAGTACAGT ACANATTTAGTTAGTTTGTTGTATTTTTATGGNCATGGGTGTCCTGTAAGTGCAATGTTT ATATTTATATGATGAGGTTATAGGTGCATATTGTCTCNAAAAAGGTTAATTTTANCAACT GTATTTTGTTCAGTTATTTCCATCCAGGCAGTAAGTGTCGTGGTGTTTATGGGTGTATCN AGTTNCCCNCCAACTTTACAGTTTTTTGGANAAGTGGTANTGGCCGTTATAANTCTATNA AAACAGGATTTTGTATTGATTTTANCANCAGTTATAACTTTGTNNGGGGGTAAATTGCTA GGATTAATGGTATTGGGTTTAGTTATAAATNCATTATTAAATAGGAAAGGTGTTATAGTA AGGGGTATAAAAGGTTTGCTAGTTTATGTNATTTACTTTATATTAATAGGACTATTANTG TTTATGGTAGTTTAAGTTTATCNCAGGATNCTAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)