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Schistosoma mansoni
cluster # 4429 cluster # 4429       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4429#0 length = 850 sequences # 3  

consensusID : consensus_4429#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 850
fasta sequence
                              [GTAAGCATATCCATACTACCCCTATGTATACCTAAAAGGATCTCTTTTGTTATGTTGCTTACAGTAATCTTAAAGAACTAATTGATGCTAGGCATATTATAATATTACTCTTTTTTAACATCACTAATCATGCATAACGACTTCTATTAGTGAGTATGTTTCTATGTACAAATGGAATATGTTTTCAACTGTATCCTGTCTCTCTCTCGCACACACACACACACACCTACAAGTGGATGTCAATACATAATCAGTTTTGTTGATTTAGGTAGACATCATCAATAATTAGTAGAATGAATGTGATTGTCACATTGTATCATTACTATTGTTGATGGTGTTGTTCCCTTTTTTATTCCCGGTACATTCATTTAACGATTGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTATGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAAGTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTTCCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTACAAACTCCATAAAACCCCCTTTTTGATATATTTAAGTAAATAACTTGTTGTAATTACCTTGTGTTTGGTGCGTGCTAACGAGTCGGATGCCACAGTTGACTTCCAACTCCTCCGAGCCACTAGCAACGAAAAGTCTGATATGAGTGAAATGATCTGAAGCTGATGACACTCGAACTAGTGATATAATATGGAAAGGAGTGTCGGTCGATGGGCCGTGTTTTTTGAGCAATATTTCAGGTGATGTGTTACCCCACCGATA]

[+] EMBL CD081307             [GTAAGCATATCCATACTACCCCTATGTATACCTAAAAGGATCTCTTTTGTTATGTTGCTTACAGTAATCTTAAAGAACTAATTGATGCTAGGCATATTATAATATTACTCTTTTTTAACATCACTAATCATGCATAACGACTTCTATTAGTGAGTATGTTTCTATGTACAAATGGAATATGTTTTCAACTGTATCCTGTCTCTCTCTCGCACACACACACACACACCTACAAGTGGATGTCAATACATAATCAGTTTTGTTGATTTAGGTAGACATCATCAATAATTAGTAGAATGAATGTGATTGTCACATTGTATCATTACTATTGTTGATGGTGTTGTTCCCTTTTTTATTCCCGGTACATTCATTTAACGATTGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTATGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAAGTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTTCCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD075139             [ TAAGCATATCCATACTACCCCTATGTATACCTAAAAGGATCTCTTTTGTTATGTTGCTTACAGTAATCTTAAAGAACTAATTGATGCTAGGCATATTATAATATTATTCTTTTTTAACATCACTAATCATGCATAACGACTTCTATTAGTGAGTATGTTTCTATGTACAAATGGAATATGTTTTCAACTGTATCCTGTCTCTCTCTCGCACACACACACACACACCTACAAGTGGATGTCAATACATAATCAGTTTTGTTGATTTAGGTAGACATCATCAATAATTAGTAGAATGAATGTGATTGTCACATTGTATCATTACTATTGTTGATGGTGTTGTTCCCTTTTTTATTCCCGGTACATTCATTTAACGATTGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTATGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAAGTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTTCCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD116307             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCATTTAACGATGGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTATGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAAGTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTTCCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTACAAACTCCATAAAACCCCCTTTTTGATATATTTAAGTAAATAACTTGTTGTAATTACCTTGTGTTTGGTGCGTGCTAACGAGTCGGATGCCACAGTTGACTTCCAACTCCTCCGAGCCACTAGCAACGAAAAGTCTGATATGAGTGAAATGATCTGAAGCTGATGACACTCGAACTAGTGATATAATATGGAAAGGAGTGTCGGTCGATGGGCCGTGTTTTTTGAGCAATATTTCAGGTGATGTGTTACCCCACCGATA]


>consensus_4429#0 GTAAGCATATCCATACTACCCCTATGTATACCTAAAAGGATCTCTTTTGTTATGTTGCTT ACAGTAATCTTAAAGAACTAATTGATGCTAGGCATATTATAATATTACTCTTTTTTAACA TCACTAATCATGCATAACGACTTCTATTAGTGAGTATGTTTCTATGTACAAATGGAATAT GTTTTCAACTGTATCCTGTCTCTCTCTCGCACACACACACACACACCTACAAGTGGATGT CAATACATAATCAGTTTTGTTGATTTAGGTAGACATCATCAATAATTAGTAGAATGAATG TGATTGTCACATTGTATCATTACTATTGTTGATGGTGTTGTTCCCTTTTTTATTCCCGGT ACATTCATTTAACGATTGTAAATTCGTATTCATTATTCTGTTTTATTATTAGTGACAGTA TGTTTTGTAATACTATTGATAATAATAATAATGTTACTGTATGTATCATGTTAAGTAAAA GTATGATTTCACCAGTTTGATTCGAGTCTCAAACTAGGACGAAACGGCCGTCCAGGTTTT CCATAGTAGTCTAGCTTTATTCGACTCATGAATTCAATTATTAAATTGCTACAAACTCCA TAAAACCCCCTTTTTGATATATTTAAGTAAATAACTTGTTGTAATTACCTTGTGTTTGGT GCGTGCTAACGAGTCGGATGCCACAGTTGACTTCCAACTCCTCCGAGCCACTAGCAACGA AAAGTCTGATATGAGTGAAATGATCTGAAGCTGATGACACTCGAACTAGTGATATAATAT GGAAAGGAGTGTCGGTCGATGGGCCGTGTTTTTTGAGCAATATTTCAGGTGATGTGTTAC CCCACCGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)