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Schistosoma mansoni
cluster # 4432 cluster # 4432       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4432#0 length = 996 sequences # 3  

consensusID : consensus_4432#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 996
fasta sequence
                              [CATATTTAAGTAACATCTTCAATTGACTCATGATCTCAACTATATAAAAATACAAACTATTATTTATCGGATTGGTATATACATTAAAATGTATACTAAGGTTATTTTTACGTGTTTCTATTACAGTCTAGAAAGATTTGTTTTACTATCTGGTTAATTTTCACTTCAGGATAGGATTTTTGTTTTTTCTGATGTATCTTTAACTGTTCCAAAGCTTTCTAACTTGAATTATTCATAGTATATANTATAGTTGAAATCATGAGTCAATTGAAGCTATCTAAGGCACCATGGAAAACCTGGAAACACTGGACGGCCGTTTCGTCCTATTATGGAACTCCTCGGCAGTGCATATCCACGATCCCGCCTTACAAGATTCGAACACAGGACCTACCAGTCTCGCGCGCGAGCACTTAACCGATAGACCACTGAGCCGGCCGGCATCCAACGGTGTTAATGTCTAACTTCAACCAATCCACGAAGTTGAGCAACCATTTCACCAATGTCTTCAGTAAGTTTTTAAATTAAATTATAGCCAACTTTTCGCGAACTAAGTGTTATTATTAAACTACAAGACAACGTTGGATATAAATATTCCTTTCCTTCTAAAAATTTTGAAGTTCATTAAACTGTAAATCATAATCCTTATTTTTTAAACTGCTTTATAACTCTCAGTTAGTTCTAGTTAGGATGTGGACATTCTCAAAGTCACTTTAGTGTCGCTCAAAGGTCGTCCATAAAGTATAGTCTCGCCAGCCTAAGATGTATAAGAAGTGAGCCGATATGTTCACGCGTACCGGGGAACCCAGTGCAAACGAGGGCTTAATCAAGATATCTTACAAACACATGTAGTCTATCCGTCATGTATGTTATAGAGAGAAGGCTGTTCCATATTTGTGCATACTTAATTANGCAGATGTTTCTAGAGACCTGAACTAAGGAATTTGTGTTGAAGTCTGATATAAAGAAGAAGATTGAACTTGAACCCCACTTTAACAC]

[+] EMBL AI976121             [CATATTTAAGTAACATCTTCAATTGACTCATGATCTCAACTATATAAAAATACAAACTATTATTTATCGGATTGGTATATACATTAAAATGTATACTAAGGTTATTTTTACGTGTTTCTATTACAGTCTAGAAAGATTTGTTTTACTATCTGGTTAATTTTCACTTCAGGATAGGATTTTTGTTTTTTCTGATGTATCTTTAACTGTTCCAAAGCTTTCTAACTTGAATTATTCATAGTATATANTATAGTTGAAATCATGAGTCAATTGAAGCTATCTAAGGCACCATGGAAAACCTGGAAACACTGGACGGCCGTTTCGTCCTATTATGGAACTCCTCGGCAGTGCATATCCACGATCCCGCCTTACAAGATTCGAACACAGGACCTACCAGTCTCGCGCGCGAGCACTTAACCGATAGACCACTGAGCCTGCCAGCATCCAGCGGTGTTAATGTCCAACTTCAACCAATCCACGAAGTTGAGCAACCATTTTACCGATGTCTTCAGTg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD088915             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GATAGACCACTGAGCCGGCCGGCATCCAACGGTGTTAATGTCTAACTTCAACCAATCCACGAAGTTGAGCAACCATTTCACCAATGTCTTCAGTAAGTTTTTAAATTAAATTATAGCCAACTTTTCGCGAACTAAGTGTTATTATTAAACTACAAGACAACGTTGGATATAAATATTCCTTTCCTTCTAAAAATTTTGAAGTTCATTAAACTGTAAATCATAATCCTTATTTTTTAAACTGCTTTATAACTCTCAGTTAGTTCTAGTTAGGATGTGGACATTCTCAAAGTCACTTTAGTGTCGCTCAAAGGTCGTCCATAAAGTATAGTCTCGCCAGCCTAAGATGTATAAGAAGTGAGCCGATATGTTCACGCGTACCGGGGAACCCAGTGCAAACGAGGGCTTAATCAAGATATCTTACAAACACATGTAGTCTATCCGTCATGTATGTTATAGAGAGAAGGCTGTTCCATATTTGTGCATACTTAATTANGCAGATGTTTCTAGAGACCTGAACTAAGGAATTTGTGTTGAAGTCTGATATAAAGAAGAAGATTGAACTTGAACCCCACTTTAACAC]
[+] EMBL CD088881             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GATAGACCACTGAGCCGGCCGGCATCCAACGGTGTTAATGTCTAACTTCAACCAATCCACGAAGTTGAGCAACCATTTCACCAATGCCTTCAGTAAGTTTTTAAATTAAATTATAGCCAACTTTTCGCGAACTAAGTGTTATTATTAAACTACAAGACAACGTTGGATATAAACATTCCTTTCCTTCTAAAAATTTTGAAGTTCATTAAACTGTAAATCATAATCCTTATTTTTTAAACTGCTTTATAACTCTCAGTTAGTTCTAGTTAGGATGTGGACATTCTCAAAGTCACTTTAGTGTCGCTCAAAGGTCGTCCATAAAGTATAGTCTCGCCAGCCTAAGATGTATAAGAAGTGAGCCGATATGTTCACGCGTACCGGGGAACCCAGTGCAAACGAGGGCTTAATCGAGATATCTTACAAACACATGTAGTCTATCCGTCATGTATGTTATAGAGAGAAGGCTGTTCCATATTTGTGCATACTTAATTAGGCAGATGTTTCTAGAGACCTGAACTAAGGAATTTGTGTTGAAGTCTGAT                                      ]


>consensus_4432#0 CATATTTAAGTAACATCTTCAATTGACTCATGATCTCAACTATATAAAAATACAAACTAT TATTTATCGGATTGGTATATACATTAAAATGTATACTAAGGTTATTTTTACGTGTTTCTA TTACAGTCTAGAAAGATTTGTTTTACTATCTGGTTAATTTTCACTTCAGGATAGGATTTT TGTTTTTTCTGATGTATCTTTAACTGTTCCAAAGCTTTCTAACTTGAATTATTCATAGTA TATANTATAGTTGAAATCATGAGTCAATTGAAGCTATCTAAGGCACCATGGAAAACCTGG AAACACTGGACGGCCGTTTCGTCCTATTATGGAACTCCTCGGCAGTGCATATCCACGATC CCGCCTTACAAGATTCGAACACAGGACCTACCAGTCTCGCGCGCGAGCACTTAACCGATA GACCACTGAGCCGGCCGGCATCCAACGGTGTTAATGTCTAACTTCAACCAATCCACGAAG TTGAGCAACCATTTCACCAATGTCTTCAGTAAGTTTTTAAATTAAATTATAGCCAACTTT TCGCGAACTAAGTGTTATTATTAAACTACAAGACAACGTTGGATATAAATATTCCTTTCC TTCTAAAAATTTTGAAGTTCATTAAACTGTAAATCATAATCCTTATTTTTTAAACTGCTT TATAACTCTCAGTTAGTTCTAGTTAGGATGTGGACATTCTCAAAGTCACTTTAGTGTCGC TCAAAGGTCGTCCATAAAGTATAGTCTCGCCAGCCTAAGATGTATAAGAAGTGAGCCGAT ATGTTCACGCGTACCGGGGAACCCAGTGCAAACGAGGGCTTAATCAAGATATCTTACAAA CACATGTAGTCTATCCGTCATGTATGTTATAGAGAGAAGGCTGTTCCATATTTGTGCATA CTTAATTANGCAGATGTTTCTAGAGACCTGAACTAAGGAATTTGTGTTGAAGTCTGATAT AAAGAAGAAGATTGAACTTGAACCCCACTTTAACAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)